RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570092.5

RHOT2-225, Transcript of ras homolog family member T2, human

TSL 3

Gene RHOT2, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT2-225	ENST00000570092	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		60.71	■■■■■ 7.31
RHOT2-225	ENST00000570092	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		53.99	■■■■■ 6.23
RHOT2-225	ENST00000570092	ABCC9	O60706	1549 aa		53.22	■■■■■ 6.11
RHOT2-225	ENST00000570092	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		51.03	■■■■■ 5.76
RHOT2-225	ENST00000570092	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		51.02	■■■■■ 5.76
RHOT2-225	ENST00000570092	NACAD	O15069	1562 aa		50.91	■■■■■ 5.74
RHOT2-225	ENST00000570092	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		50.51	■■■■■ 5.68
RHOT2-225	ENST00000570092	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	50.46	■■■■■ 5.67
RHOT2-225	ENST00000570092	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		50.19	■■■■■ 5.62
RHOT2-225	ENST00000570092	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.8	■■■■■ 5.56
RHOT2-225	ENST00000570092	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.78	■■■■■ 5.56	6e-7	■■□□□ 13.8
RHOT2-225	ENST00000570092	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		49.48	■■■■■ 5.51
RHOT2-225	ENST00000570092	SCRIB	Q14160	1630 aa		49.3	■■■■■ 5.48
RHOT2-225	ENST00000570092	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.2	■■■■■ 5.47
RHOT2-225	ENST00000570092	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.91	■■■■■ 5.42
RHOT2-225	ENST00000570092	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	48.21	■■■■■ 5.31
RHOT2-225	ENST00000570092	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		48.09	■■■■■ 5.29
RHOT2-225	ENST00000570092	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.85	■■■■■ 5.25
RHOT2-225	ENST00000570092	SMARCA4	P51532	1647 aa		47.12	■■■■■ 5.13
RHOT2-225	ENST00000570092	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	47.05	■■■■■ 5.12
RHOT2-225	ENST00000570092	NCAPD3	P42695	1498 aa		47.02	■■■■■ 5.12
RHOT2-225	ENST00000570092	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		47	■■■■■ 5.11
RHOT2-225	ENST00000570092	SMARCA2	P51531	1590 aa		46.9	■■■■■ 5.1
RHOT2-225	ENST00000570092	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		46.78	■■■■■ 5.08
RHOT2-225	ENST00000570092	HMGXB3	Q12766	1538 aa		46.69	■■■■■ 5.06
RHOT2-225	ENST00000570092	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		46.65	■■■■■ 5.06
RHOT2-225	ENST00000570092	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	46.58	■■■■■ 5.05
RHOT2-225	ENST00000570092	WIZ	O95785	1651 aa		46.24	■■■■■ 4.99
RHOT2-225	ENST00000570092	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	46.19	■■■■■ 4.98
RHOT2-225	ENST00000570092	NES	P48681	1621 aa		45.96	■■■■■ 4.95
RHOT2-225	ENST00000570092	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.9	■■■■■ 4.94
RHOT2-225	ENST00000570092	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.77	■■■■■ 4.92
RHOT2-225	ENST00000570092	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	45.72	■■■■■ 4.91
RHOT2-225	ENST00000570092	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		45.68	■■■■■ 4.9
RHOT2-225	ENST00000570092	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		45.55	■■■■■ 4.88
RHOT2-225	ENST00000570092	CUX2	O14529	1486 aa		45.49	■■■■■ 4.87
RHOT2-225	ENST00000570092	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.34	■■■■■ 4.85
RHOT2-225	ENST00000570092	CFTR	P13569	1480 aa		45.29	■■■■■ 4.84
RHOT2-225	ENST00000570092	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		45.26	■■■■■ 4.84
RHOT2-225	ENST00000570092	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.24	■■■■■ 4.83
RHOT2-225	ENST00000570092	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		45.1	■■■■■ 4.81
RHOT2-225	ENST00000570092	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		45.05	■■■■■ 4.8
RHOT2-225	ENST00000570092	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		45.04	■■■■■ 4.8
RHOT2-225	ENST00000570092	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44.92	■■■■■ 4.78
RHOT2-225	ENST00000570092	WDR62	O43379	1518 aa		44.87	■■■■■ 4.77
RHOT2-225	ENST00000570092	PRDM2	Q13029	1718 aa		44.8	■■■■■ 4.76
RHOT2-225	ENST00000570092	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	44.65	■■■■■ 4.74
RHOT2-225	ENST00000570092	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.54	■■■■■ 4.72
RHOT2-225	ENST00000570092	ABCC8	Q09428	1581 aa		44.35	■■■■■ 4.69
RHOT2-225	ENST00000570092	TOPBP1	Q92547	1522 aa		44.34	■■■■■ 4.69
RHOT2-225	ENST00000570092	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		44.23	■■■■■ 4.67
RHOT2-225	ENST00000570092	IFT140	Q96RY7	1462 aa		44.14	■■■■■ 4.66
RHOT2-225	ENST00000570092	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	43.97	■■■■■ 4.63
RHOT2-225	ENST00000570092	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.94	■■■■■ 4.62
RHOT2-225	ENST00000570092	CUX1	P39880	1505 aa		43.89	■■■■■ 4.62
RHOT2-225	ENST00000570092	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43.84	■■■■■ 4.61
RHOT2-225	ENST00000570092	SOGA1	O94964	1423 aa		43.83	■■■■■ 4.61
RHOT2-225	ENST00000570092	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		43.8	■■■■■ 4.6
RHOT2-225	ENST00000570092	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		43.79	■■■■■ 4.6
RHOT2-225	ENST00000570092	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	43.73	■■■■■ 4.59	9e-8	■■■■□ 20.5
RHOT2-225	ENST00000570092	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.7	■■■■■ 4.59
RHOT2-225	ENST00000570092	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.69	■■■■■ 4.58
RHOT2-225	ENST00000570092	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	43.63	■■■■■ 4.57
RHOT2-225	ENST00000570092	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	43.55	■■■■■ 4.56
RHOT2-225	ENST00000570092	WDR97	A6NE52	1622 aa		43.44	■■■■■ 4.55
RHOT2-225	ENST00000570092	TOP2B	Q02880	1626 aa		43.42	■■■■■ 4.54
RHOT2-225	ENST00000570092	SYNJ1	O43426	1573 aa		43.39	■■■■■ 4.54
RHOT2-225	ENST00000570092	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		43.39	■■■■■ 4.54
RHOT2-225	ENST00000570092	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		43.36	■■■■■ 4.53
RHOT2-225	ENST00000570092	FBLN2	P98095	1184 aa		43.34	■■■■■ 4.53
RHOT2-225	ENST00000570092	GRIN2B	Q13224	1484 aa		43.3	■■■■■ 4.52
RHOT2-225	ENST00000570092	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		43.28	■■■■■ 4.52
RHOT2-225	ENST00000570092	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		43.25	■■■■■ 4.51
RHOT2-225	ENST00000570092	CHD1	O14646	1710 aa		43.2	■■■■■ 4.51
RHOT2-225	ENST00000570092	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	43.19	■■■■■ 4.51
RHOT2-225	ENST00000570092	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.16	■■■■■ 4.5
RHOT2-225	ENST00000570092	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		43.15	■■■■■ 4.5
RHOT2-225	ENST00000570092	PBRM1	Q86U86	1689 aa		43.09	■■■■■ 4.49
RHOT2-225	ENST00000570092	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.04	■■■■■ 4.48
RHOT2-225	ENST00000570092	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.96	■■■■■ 4.47
RHOT2-225	ENST00000570092	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.86	■■■■■ 4.45
RHOT2-225	ENST00000570092	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.86	■■■■■ 4.45
RHOT2-225	ENST00000570092	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.86	■■■■■ 4.45
RHOT2-225	ENST00000570092	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.84	■■■■■ 4.45
RHOT2-225	ENST00000570092	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		42.82	■■■■■ 4.45
RHOT2-225	ENST00000570092	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		42.77	■■■■■ 4.44
RHOT2-225	ENST00000570092	ADAMTS12	P58397	1594 aa		42.75	■■■■■ 4.43
RHOT2-225	ENST00000570092	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.75	■■■■■ 4.43
RHOT2-225	ENST00000570092	GRIN2A	Q12879	1464 aa		42.72	■■■■■ 4.43
RHOT2-225	ENST00000570092	KIF27	Q86VH2	1401 aa		42.68	■■■■■ 4.42
RHOT2-225	ENST00000570092	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.61	■■■■■ 4.41
RHOT2-225	ENST00000570092	IGF1R	P08069	1367 aa		42.58	■■■■■ 4.41
RHOT2-225	ENST00000570092	NUP160	Q12769	1436 aa		42.55	■■■■■ 4.4
RHOT2-225	ENST00000570092	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.49	■■■■■ 4.39
RHOT2-225	ENST00000570092	CEP170	Q5SW79	1584 aa		42.48	■■■■■ 4.39
RHOT2-225	ENST00000570092	CUL7	Q14999	1698 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RHOT2-225	ENST00000570092	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.32	■■■■■ 4.37
RHOT2-225	ENST00000570092	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.24	■■■■■ 4.35
RHOT2-225	ENST00000570092	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RHOT2-225	ENST00000570092	SHROOM2	Q13796	1616 aa		42.2	■■■■■ 4.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms