RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568790.5

COQ9-215, Transcript of coenzyme Q9, human

TSL 2

Gene COQ9, Length 1,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COQ9-215	ENST00000568790	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.78	■■■■■ 6.68
COQ9-215	ENST00000568790	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.81	■■■■■ 5.72
COQ9-215	ENST00000568790	ABCC9	O60706	1549 aa		50.55	■■■■■ 5.68
COQ9-215	ENST00000568790	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.3	■■■■■ 5.32
COQ9-215	ENST00000568790	NACAD	O15069	1562 aa		48.05	■■■■■ 5.28
COQ9-215	ENST00000568790	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.97	■■■■■ 5.27
COQ9-215	ENST00000568790	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.49	■■■■■ 5.19
COQ9-215	ENST00000568790	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		47.17	■■■■■ 5.14
COQ9-215	ENST00000568790	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.16	■■■■■ 5.14
COQ9-215	ENST00000568790	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.06	■■■■■ 5.12
COQ9-215	ENST00000568790	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		47.05	■■■■■ 5.12
COQ9-215	ENST00000568790	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.95	■■■■■ 5.11
COQ9-215	ENST00000568790	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.75	■■■■■ 5.07
COQ9-215	ENST00000568790	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.31	■■■■■ 5
COQ9-215	ENST00000568790	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.25	■■■■■ 4.99
COQ9-215	ENST00000568790	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.67	■■■■■ 4.9
COQ9-215	ENST00000568790	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.64	■■■■■ 4.9
COQ9-215	ENST00000568790	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.55	■■■■■ 4.88
COQ9-215	ENST00000568790	NCAPD3	P42695	1498 aa		44.35	■■■■■ 4.69
COQ9-215	ENST00000568790	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		44.21	■■■■■ 4.67
COQ9-215	ENST00000568790	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.19	■■■■■ 4.66
COQ9-215	ENST00000568790	SMARCA2	P51531	1590 aa		44.16	■■■■■ 4.66
COQ9-215	ENST00000568790	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.08	■■■■■ 4.65
COQ9-215	ENST00000568790	HMGXB3	Q12766	1538 aa		44	■■■■■ 4.63
COQ9-215	ENST00000568790	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.83	■■■■■ 4.61
COQ9-215	ENST00000568790	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.79	■■■■■ 4.6
COQ9-215	ENST00000568790	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.72	■■■■■ 4.59
COQ9-215	ENST00000568790	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.69	■■■■■ 4.58
COQ9-215	ENST00000568790	CUX2	O14529	1486 aa		43.54	■■■■■ 4.56
COQ9-215	ENST00000568790	NES	P48681	1621 aa		43.44	■■■■■ 4.55
COQ9-215	ENST00000568790	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.29	■■■■■ 4.52
COQ9-215	ENST00000568790	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.27	■■■■■ 4.52
COQ9-215	ENST00000568790	WIZ	O95785	1651 aa		43.16	■■■■■ 4.5
COQ9-215	ENST00000568790	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.13	■■■■■ 4.49
COQ9-215	ENST00000568790	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		43.05	■■■■■ 4.48
COQ9-215	ENST00000568790	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.94	■■■■■ 4.46
COQ9-215	ENST00000568790	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.93	■■■■■ 4.46
COQ9-215	ENST00000568790	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.88	■■■■■ 4.45
COQ9-215	ENST00000568790	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.68	■■■■■ 4.42
COQ9-215	ENST00000568790	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.63	■■■■■ 4.42
COQ9-215	ENST00000568790	CFTR	P13569	1480 aa		42.56	■■■■■ 4.4
COQ9-215	ENST00000568790	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.54	■■■■■ 4.4
COQ9-215	ENST00000568790	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.5	■■■■■ 4.39
COQ9-215	ENST00000568790	WDR62	O43379	1518 aa		42.48	■■■■■ 4.39
COQ9-215	ENST00000568790	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.23	■■■■■ 4.35
COQ9-215	ENST00000568790	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.09	■■■■■ 4.33
COQ9-215	ENST00000568790	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
COQ9-215	ENST00000568790	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.78	■■■■■ 4.28
COQ9-215	ENST00000568790	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.72	■■■■■ 4.27
COQ9-215	ENST00000568790	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.7	■■■■■ 4.27
COQ9-215	ENST00000568790	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.7	■■■■■ 4.27
COQ9-215	ENST00000568790	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.58	■■■■■ 4.25
COQ9-215	ENST00000568790	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.5	■■■■■ 4.23
COQ9-215	ENST00000568790	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.46	■■■■■ 4.23
COQ9-215	ENST00000568790	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.32	■■■■■ 4.21
COQ9-215	ENST00000568790	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.28	■■■■■ 4.2
COQ9-215	ENST00000568790	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.27	■■■■■ 4.2
COQ9-215	ENST00000568790	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.27	■■■■■ 4.2
COQ9-215	ENST00000568790	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41.22	■■■■■ 4.19	2e-8	■■■■■ 35.8
COQ9-215	ENST00000568790	SOGA1	O94964	1423 aa		41.2	■■■■■ 4.19
COQ9-215	ENST00000568790	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		41.11	■■■■■ 4.17
COQ9-215	ENST00000568790	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.06	■■■■■ 4.16
COQ9-215	ENST00000568790	CUX1	P39880	1505 aa		41.03	■■■■■ 4.16
COQ9-215	ENST00000568790	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
COQ9-215	ENST00000568790	FBLN2	P98095	1184 aa		41.02	■■■■■ 4.16
COQ9-215	ENST00000568790	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.97	■■■■■ 4.15
COQ9-215	ENST00000568790	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.93	■■■■■ 4.14
COQ9-215	ENST00000568790	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.93	■■■■■ 4.14
COQ9-215	ENST00000568790	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.93	■■■■■ 4.14
COQ9-215	ENST00000568790	CHD1	O14646	1710 aa		40.9	■■■■■ 4.14
COQ9-215	ENST00000568790	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.86	■■■■■ 4.13
COQ9-215	ENST00000568790	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.79	■■■■■ 4.12
COQ9-215	ENST00000568790	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
COQ9-215	ENST00000568790	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.77	■■■■■ 4.12
COQ9-215	ENST00000568790	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
COQ9-215	ENST00000568790	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.68	■■■■■ 4.1
COQ9-215	ENST00000568790	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.67	■■■■■ 4.1
COQ9-215	ENST00000568790	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.65	■■■■■ 4.1
COQ9-215	ENST00000568790	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.61	■■■■■ 4.09
COQ9-215	ENST00000568790	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.61	■■■■■ 4.09
COQ9-215	ENST00000568790	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.56	■■■■■ 4.08
COQ9-215	ENST00000568790	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.53	■■■■■ 4.08
COQ9-215	ENST00000568790	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.49	■■■■■ 4.07
COQ9-215	ENST00000568790	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.48	■■■■■ 4.07
COQ9-215	ENST00000568790	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.47	■■■■■ 4.07
COQ9-215	ENST00000568790	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.45	■■■■■ 4.07
COQ9-215	ENST00000568790	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.44	■■■■■ 4.06
COQ9-215	ENST00000568790	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40.21	■■■■■ 4.03
COQ9-215	ENST00000568790	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.18	■■■■■ 4.02
COQ9-215	ENST00000568790	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
COQ9-215	ENST00000568790	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.16	■■■■■ 4.02
COQ9-215	ENST00000568790	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.15	■■■■■ 4.02
COQ9-215	ENST00000568790	NUP160	Q12769	1436 aa		40.07	■■■■■ 4
COQ9-215	ENST00000568790	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.97	■■■■□ 3.99
COQ9-215	ENST00000568790	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.82	■■■■□ 3.96
COQ9-215	ENST00000568790	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.81	■■■■□ 3.96
COQ9-215	ENST00000568790	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.79	■■■■□ 3.96
COQ9-215	ENST00000568790	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.79	■■■■□ 3.96
COQ9-215	ENST00000568790	IGF1R	P08069	1367 aa		39.74	■■■■□ 3.95
COQ9-215	ENST00000568790	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.71	■■■■□ 3.95

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