RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567382.1

HSBP1-202, Transcript of heat shock factor binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HSBP1, Length 889 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSBP1-202ENST00000567382 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.1■■■■■ 7.21
HSBP1-202ENST00000567382 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.6■■■■■ 6.17
HSBP1-202ENST00000567382 ABCC9O60706 1549 aa52.78■■■■■ 6.04
HSBP1-202ENST00000567382 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.64■■■■■ 5.7
HSBP1-202ENST00000567382 NACADO15069 1562 aa50.48■■■■■ 5.67
HSBP1-202ENST00000567382 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.39■■■■■ 5.66
HSBP1-202ENST00000567382 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.06■■■■■ 5.6
HSBP1-202ENST00000567382 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.99■■■■■ 5.59
HSBP1-202ENST00000567382 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.71■■■■■ 5.55
HSBP1-202ENST00000567382 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.44■■■■■ 5.51
HSBP1-202ENST00000567382 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.24■■■■■ 5.47
HSBP1-202ENST00000567382 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.07■■■■■ 5.45
HSBP1-202ENST00000567382 SCRIBQ14160 1630 aa48.88■■■■■ 5.42
HSBP1-202ENST00000567382 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.69■■■■■ 5.38
HSBP1-202ENST00000567382 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.57■■■■■ 5.37
HSBP1-202ENST00000567382 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
HSBP1-202ENST00000567382 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.72■■■■■ 5.23
HSBP1-202ENST00000567382 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.46■■■■■ 5.19
HSBP1-202ENST00000567382 SMARCA4P51532 1647 aa46.72■■■■■ 5.07
HSBP1-202ENST00000567382 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.63■■■■■ 5.06
HSBP1-202ENST00000567382 NCAPD3P42695 1498 aa46.57■■■■■ 5.04
HSBP1-202ENST00000567382 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.54■■■■■ 5.04
HSBP1-202ENST00000567382 SMARCA2P51531 1590 aa46.49■■■■■ 5.03
HSBP1-202ENST00000567382 HMGXB3Q12766 1538 aa46.33■■■■■ 5.01
HSBP1-202ENST00000567382 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.3■■■■■ 5
HSBP1-202ENST00000567382 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.26■■■■■ 5
HSBP1-202ENST00000567382 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
HSBP1-202ENST00000567382 WIZO95785 1651 aa45.79■■■■■ 4.92
HSBP1-202ENST00000567382 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.64■■■■■ 4.9
HSBP1-202ENST00000567382 ERCC6Q03468 1493 aa45.55■■■■■ 4.88
HSBP1-202ENST00000567382 NESP48681 1621 aa45.55■■■■■ 4.88
HSBP1-202ENST00000567382 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.42■■■■■ 4.86
HSBP1-202ENST00000567382 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
HSBP1-202ENST00000567382 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.2■■■■■ 4.83
HSBP1-202ENST00000567382 CUX2O14529 1486 aa45.17■■■■■ 4.82
HSBP1-202ENST00000567382 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.13■■■■■ 4.82
HSBP1-202ENST00000567382 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.02■■■■■ 4.8
HSBP1-202ENST00000567382 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.79
HSBP1-202ENST00000567382 CFTRP13569 1480 aa44.85■■■■■ 4.77
HSBP1-202ENST00000567382 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.76■■■■■ 4.76
HSBP1-202ENST00000567382 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.69■■■■■ 4.74
HSBP1-202ENST00000567382 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.69■■■■■ 4.74
HSBP1-202ENST00000567382 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.68■■■■■ 4.74
HSBP1-202ENST00000567382 WDR62O43379 1518 aa44.54■■■■■ 4.72
HSBP1-202ENST00000567382 PRDM2Q13029 1718 aa44.5■■■■■ 4.71
HSBP1-202ENST00000567382 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
HSBP1-202ENST00000567382 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
HSBP1-202ENST00000567382 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.17■■■■■ 4.66
HSBP1-202ENST00000567382 TOPBP1Q92547 1522 aa43.94■■■■■ 4.62
HSBP1-202ENST00000567382 ABCC8Q09428 1581 aa43.93■■■■■ 4.62
HSBP1-202ENST00000567382 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.87■■■■■ 4.61
HSBP1-202ENST00000567382 IFT140Q96RY7 1462 aa43.76■■■■■ 4.6
HSBP1-202ENST00000567382 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
HSBP1-202ENST00000567382 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
HSBP1-202ENST00000567382 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
HSBP1-202ENST00000567382 CUX1P39880 1505 aa43.46■■■■■ 4.55
HSBP1-202ENST00000567382 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
HSBP1-202ENST00000567382 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.38■■■■■ 4.54
HSBP1-202ENST00000567382 SOGA1O94964 1423 aa43.36■■■■■ 4.53
HSBP1-202ENST00000567382 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.34■■■■■ 4.53
HSBP1-202ENST00000567382 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.28■■■■■ 4.52
HSBP1-202ENST00000567382 OSCARQ8IYS5 282 aa43.24■■■■■ 4.51
HSBP1-202ENST00000567382 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
HSBP1-202ENST00000567382 WDR97A6NE52 1622 aa43.14■■■■■ 4.5
HSBP1-202ENST00000567382 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.07■■■■■ 4.49
HSBP1-202ENST00000567382 TOP2BQ02880 1626 aa43.01■■■■■ 4.48
HSBP1-202ENST00000567382 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.01■■■■■ 4.48
HSBP1-202ENST00000567382 SYNJ1O43426 1573 aa42.97■■■■■ 4.47
HSBP1-202ENST00000567382 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.95■■■■■ 4.47
HSBP1-202ENST00000567382 CHD1O14646 1710 aa42.91■■■■■ 4.46
HSBP1-202ENST00000567382 GRIN2BQ13224 1484 aa42.9■■■■■ 4.46
HSBP1-202ENST00000567382 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.89■■■■■ 4.46
HSBP1-202ENST00000567382 FBLN2P98095 1184 aa42.87■■■■■ 4.45
HSBP1-202ENST00000567382 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.85■■■■■ 4.45
HSBP1-202ENST00000567382 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
HSBP1-202ENST00000567382 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.8■■■■■ 4.44
HSBP1-202ENST00000567382 PBRM1Q86U86 1689 aa42.79■■■■■ 4.44
HSBP1-202ENST00000567382 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.42
HSBP1-202ENST00000567382 SYNJ2O15056 1496 aa42.67■■■■■ 4.42
HSBP1-202ENST00000567382 TRIM41Q8WV44 630 aa42.61■■■■■ 4.41
HSBP1-202ENST00000567382 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.58■■■■■ 4.41
HSBP1-202ENST00000567382 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.58■■■■■ 4.41
HSBP1-202ENST00000567382 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.58■■■■■ 4.41
HSBP1-202ENST00000567382 ARHGEF11O15085 1522 aa42.54■■■■■ 4.4
HSBP1-202ENST00000567382 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.44■■■■■ 4.38
HSBP1-202ENST00000567382 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.43■■■■■ 4.38
HSBP1-202ENST00000567382 ADAMTS12P58397 1594 aa42.43■■■■■ 4.38
HSBP1-202ENST00000567382 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.35■■■■■ 4.37
HSBP1-202ENST00000567382 GRIN2AQ12879 1464 aa42.34■■■■■ 4.37
HSBP1-202ENST00000567382 KIF27Q86VH2 1401 aa42.21■■■■■ 4.35
HSBP1-202ENST00000567382 ARAP1Q96P48 1450 aa42.17■■■■■ 4.34
HSBP1-202ENST00000567382 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.16■■■■■ 4.34
HSBP1-202ENST00000567382 NUP160Q12769 1436 aa42.15■■■■■ 4.34
HSBP1-202ENST00000567382 CEP170Q5SW79 1584 aa42.14■■■■■ 4.34
HSBP1-202ENST00000567382 IGF1RP08069 1367 aa42.05■■■■■ 4.32
HSBP1-202ENST00000567382 CUL7Q14999 1698 aa42■■■■■ 4.31
HSBP1-202ENST00000567382 SHROOM2Q13796 1616 aa41.87■■■■■ 4.29
HSBP1-202ENST00000567382 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.82■■■■■ 4.29
HSBP1-202ENST00000567382 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.81■■■■■ 4.28
HSBP1-202ENST00000567382 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.8■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms