RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564853.1

GAS8-210, Transcript of growth arrest specific 8, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GAS8, Length 416 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAS8-210ENST00000564853 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.73■■■■■ 6.19
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GAS8-210ENST00000564853 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.13■■■■■ 4.98
GAS8-210ENST00000564853 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.08■■■■■ 4.97
GAS8-210ENST00000564853 NACADO15069 1562 aa45.71■■■■■ 4.91
GAS8-210ENST00000564853 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.66■■■■■ 4.9
GAS8-210ENST00000564853 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.41■■■■■ 4.86
GAS8-210ENST00000564853 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.28■■■■■ 4.84
GAS8-210ENST00000564853 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.91■■■■■ 4.78
GAS8-210ENST00000564853 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.85■■■■■ 4.77
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GAS8-210ENST00000564853 SCRIBQ14160 1630 aa44.17■■■■■ 4.66
GAS8-210ENST00000564853 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44■■■■■ 4.63
GAS8-210ENST00000564853 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.99■■■■■ 4.63
GAS8-210ENST00000564853 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.89■■■■■ 4.62
GAS8-210ENST00000564853 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
GAS8-210ENST00000564853 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.38■■■■■ 4.37
GAS8-210ENST00000564853 NCAPD3P42695 1498 aa42.2■■■■■ 4.35
GAS8-210ENST00000564853 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.1■■■■■ 4.33
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GAS8-210ENST00000564853 SMARCA4P51532 1647 aa42.02■■■■■ 4.32
GAS8-210ENST00000564853 CUX2O14529 1486 aa41.97■■■■■ 4.31
GAS8-210ENST00000564853 SMARCA2P51531 1590 aa41.91■■■■■ 4.3
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GAS8-210ENST00000564853 NESP48681 1621 aa41.84■■■■■ 4.29
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GAS8-210ENST00000564853 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.48■■■■■ 4.23
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GAS8-210ENST00000564853 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.29■■■■■ 4.2
GAS8-210ENST00000564853 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.07■■■■■ 4.16
GAS8-210ENST00000564853 WIZO95785 1651 aa41.02■■■■■ 4.16
GAS8-210ENST00000564853 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.94■■■■■ 4.14
GAS8-210ENST00000564853 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.79■■■■■ 4.12
GAS8-210ENST00000564853 WDR62O43379 1518 aa40.7■■■■■ 4.11
GAS8-210ENST00000564853 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.58■■■■■ 4.09
GAS8-210ENST00000564853 TRIM41Q8WV44 630 aa40.56■■■■■ 4.08
GAS8-210ENST00000564853 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.52■■■■■ 4.08
GAS8-210ENST00000564853 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
GAS8-210ENST00000564853 CFTRP13569 1480 aa40.4■■■■■ 4.06
GAS8-210ENST00000564853 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
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GAS8-210ENST00000564853 TOPBP1Q92547 1522 aa39.74■■■■□ 3.95
GAS8-210ENST00000564853 IFT140Q96RY7 1462 aa39.73■■■■□ 3.95
GAS8-210ENST00000564853 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.68■■■■□ 3.94
GAS8-210ENST00000564853 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.68■■■■□ 3.94
GAS8-210ENST00000564853 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.68■■■■□ 3.94
GAS8-210ENST00000564853 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
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GAS8-210ENST00000564853 CHD1O14646 1710 aa39.4■■■■□ 3.9
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GAS8-210ENST00000564853 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.26■■■■□ 3.88
GAS8-210ENST00000564853 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.26■■■■□ 3.88
GAS8-210ENST00000564853 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
GAS8-210ENST00000564853 SOGA1O94964 1423 aa39.11■■■■□ 3.85
GAS8-210ENST00000564853 ARAP1Q96P48 1450 aa39.09■■■■□ 3.85
GAS8-210ENST00000564853 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.05■■■■□ 3.84
GAS8-210ENST00000564853 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.99■■■■□ 3.83
GAS8-210ENST00000564853 CUX1P39880 1505 aa38.99■■■■□ 3.83
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GAS8-210ENST00000564853 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.84■■■■□ 3.81
GAS8-210ENST00000564853 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
GAS8-210ENST00000564853 WDR97A6NE52 1622 aa38.81■■■■□ 3.8
GAS8-210ENST00000564853 GRIN2BQ13224 1484 aa38.77■■■■□ 3.8
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GAS8-210ENST00000564853 PBRM1Q86U86 1689 aa38.71■■■■□ 3.79
GAS8-210ENST00000564853 SYNJ2O15056 1496 aa38.68■■■■□ 3.78
GAS8-210ENST00000564853 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.63■■■■□ 3.77
GAS8-210ENST00000564853 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
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GAS8-210ENST00000564853 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.36■■■■□ 3.73
GAS8-210ENST00000564853 GRIN2AQ12879 1464 aa38.3■■■■□ 3.72
GAS8-210ENST00000564853 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.28■■■■□ 3.72
GAS8-210ENST00000564853 ADAMTS12P58397 1594 aa38.27■■■■□ 3.72
GAS8-210ENST00000564853 CEP170Q5SW79 1584 aa38.25■■■■□ 3.71
GAS8-210ENST00000564853 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.23■■■■□ 3.71
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GAS8-210ENST00000564853 NUP160Q12769 1436 aa38.15■■■■□ 3.7
GAS8-210ENST00000564853 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.08■■■■□ 3.69
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GAS8-210ENST00000564853 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
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GAS8-210ENST00000564853 JPH4Q96JJ6 628 aa37.79■■■■□ 3.64
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