RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563964.5

LAT-208, Transcript of linker for activation of T cells, humanhuman

TSL 5

Gene LAT, Length 710 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAT-208ENST00000563964 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.02■■■■■ 6.88
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LAT-208ENST00000563964 ABCC9O60706 1549 aa51.46■■■■■ 5.83
LAT-208ENST00000563964 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.16■■■■■ 5.46
LAT-208ENST00000563964 NACADO15069 1562 aa48.93■■■■■ 5.42
LAT-208ENST00000563964 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.84■■■■■ 5.41
LAT-208ENST00000563964 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.38■■■■■ 5.34
LAT-208ENST00000563964 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
LAT-208ENST00000563964 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.07■■■■■ 5.29
LAT-208ENST00000563964 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48■■■■■ 5.27
LAT-208ENST00000563964 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.94■■■■■ 5.26
LAT-208ENST00000563964 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.9■■■■■ 5.26
LAT-208ENST00000563964 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.72■■■■■ 5.23
LAT-208ENST00000563964 SCRIBQ14160 1630 aa47.3■■■■■ 5.16
LAT-208ENST00000563964 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.08■■■■■ 5.13
LAT-208ENST00000563964 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.51■■■■■ 5.04
LAT-208ENST00000563964 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.5■■■■■ 5.03
LAT-208ENST00000563964 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.3■■■■■ 5
LAT-208ENST00000563964 NCAPD3P42695 1498 aa45.17■■■■■ 4.82
LAT-208ENST00000563964 SMARCA4P51532 1647 aa45.16■■■■■ 4.82
LAT-208ENST00000563964 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.1■■■■■ 4.81
LAT-208ENST00000563964 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45■■■■■ 4.79
LAT-208ENST00000563964 SMARCA2P51531 1590 aa44.99■■■■■ 4.79
LAT-208ENST00000563964 HMGXB3Q12766 1538 aa44.86■■■■■ 4.77
LAT-208ENST00000563964 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.73■■■■■ 4.75
LAT-208ENST00000563964 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.72■■■■■ 4.75
LAT-208ENST00000563964 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
LAT-208ENST00000563964 ERCC6Q03468 1493 aa44.39■■■■■ 4.7
LAT-208ENST00000563964 NESP48681 1621 aa44.34■■■■■ 4.69
LAT-208ENST00000563964 WIZO95785 1651 aa44.21■■■■■ 4.67
LAT-208ENST00000563964 CUX2O14529 1486 aa44.14■■■■■ 4.66
LAT-208ENST00000563964 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.08■■■■■ 4.65
LAT-208ENST00000563964 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
LAT-208ENST00000563964 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.82■■■■■ 4.61
LAT-208ENST00000563964 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.82■■■■■ 4.6
LAT-208ENST00000563964 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.78■■■■■ 4.6
LAT-208ENST00000563964 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
LAT-208ENST00000563964 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
LAT-208ENST00000563964 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.65■■■■■ 4.58
LAT-208ENST00000563964 CFTRP13569 1480 aa43.42■■■■■ 4.54
LAT-208ENST00000563964 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.4■■■■■ 4.54
LAT-208ENST00000563964 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.33■■■■■ 4.53
LAT-208ENST00000563964 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.32■■■■■ 4.53
LAT-208ENST00000563964 WDR62O43379 1518 aa43.27■■■■■ 4.52
LAT-208ENST00000563964 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.19■■■■■ 4.5
LAT-208ENST00000563964 PRDM2Q13029 1718 aa43.01■■■■■ 4.48
LAT-208ENST00000563964 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
LAT-208ENST00000563964 TOPBP1Q92547 1522 aa42.56■■■■■ 4.4
LAT-208ENST00000563964 ABCC8Q09428 1581 aa42.49■■■■■ 4.39
LAT-208ENST00000563964 IFT140Q96RY7 1462 aa42.44■■■■■ 4.38
LAT-208ENST00000563964 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.43■■■■■ 4.38
LAT-208ENST00000563964 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
LAT-208ENST00000563964 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
LAT-208ENST00000563964 OSCARQ8IYS5 282 aa42.24■■■■■ 4.35
LAT-208ENST00000563964 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
LAT-208ENST00000563964 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
LAT-208ENST00000563964 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
LAT-208ENST00000563964 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.04■■■■■ 4.32
LAT-208ENST00000563964 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42■■■■■ 4.31
LAT-208ENST00000563964 CUX1P39880 1505 aa41.99■■■■■ 4.31
LAT-208ENST00000563964 SOGA1O94964 1423 aa41.98■■■■■ 4.31
LAT-208ENST00000563964 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.96■■■■■ 4.31
LAT-208ENST00000563964 TRIM41Q8WV44 630 aa41.94■■■■■ 4.3
LAT-208ENST00000563964 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
LAT-208ENST00000563964 CHD1O14646 1710 aa41.74■■■■■ 4.27
LAT-208ENST00000563964 WDR97A6NE52 1622 aa41.72■■■■■ 4.27
LAT-208ENST00000563964 FBLN2P98095 1184 aa41.68■■■■■ 4.26
LAT-208ENST00000563964 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.62■■■■■ 4.25
LAT-208ENST00000563964 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.62■■■■■ 4.25
LAT-208ENST00000563964 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.62■■■■■ 4.25
LAT-208ENST00000563964 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.6■■■■■ 4.25
LAT-208ENST00000563964 GRIN2BQ13224 1484 aa41.55■■■■■ 4.24
LAT-208ENST00000563964 ARHGEF11O15085 1522 aa41.54■■■■■ 4.24
LAT-208ENST00000563964 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
LAT-208ENST00000563964 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.49■■■■■ 4.23
LAT-208ENST00000563964 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.47■■■■■ 4.23
LAT-208ENST00000563964 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
LAT-208ENST00000563964 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
LAT-208ENST00000563964 TOP2BQ02880 1626 aa41.43■■■■■ 4.22
LAT-208ENST00000563964 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.43■■■■■ 4.22
LAT-208ENST00000563964 PBRM1Q86U86 1689 aa41.42■■■■■ 4.22
LAT-208ENST00000563964 SYNJ1O43426 1573 aa41.4■■■■■ 4.22
LAT-208ENST00000563964 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.39■■■■■ 4.22
LAT-208ENST00000563964 SYNJ2O15056 1496 aa41.36■■■■■ 4.21
LAT-208ENST00000563964 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.26■■■■■ 4.2
LAT-208ENST00000563964 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.23■■■■■ 4.19
LAT-208ENST00000563964 ARAP1Q96P48 1450 aa41.15■■■■■ 4.18
LAT-208ENST00000563964 ADAMTS12P58397 1594 aa41.04■■■■■ 4.16
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LAT-208ENST00000563964 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.98■■■■■ 4.15
LAT-208ENST00000563964 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.96■■■■■ 4.15
LAT-208ENST00000563964 CEP170Q5SW79 1584 aa40.86■■■■■ 4.13
LAT-208ENST00000563964 NUP160Q12769 1436 aa40.85■■■■■ 4.13
LAT-208ENST00000563964 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.67■■■■■ 4.1
LAT-208ENST00000563964 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
LAT-208ENST00000563964 KIF27Q86VH2 1401 aa40.64■■■■■ 4.1
LAT-208ENST00000563964 SHROOM2Q13796 1616 aa40.63■■■■■ 4.09
LAT-208ENST00000563964 IGF1RP08069 1367 aa40.59■■■■■ 4.09
LAT-208ENST00000563964 CUL7Q14999 1698 aa40.47■■■■■ 4.07
LAT-208ENST00000563964 JPH4Q96JJ6 628 aa40.47■■■■■ 4.07
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