RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562933.5

LINGO1-206, Transcript of leucine rich repeat and Ig domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINGO1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1-206ENST00000562933 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.03■■■■■ 6.56
LINGO1-206ENST00000562933 ABCC9O60706 1549 aa50.54■■■■■ 5.68
LINGO1-206ENST00000562933 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.36■■■■■ 5.65
LINGO1-206ENST00000562933 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.04■■■■■ 5.28
LINGO1-206ENST00000562933 NACADO15069 1562 aa47.66■■■■■ 5.22
LINGO1-206ENST00000562933 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.48■■■■■ 5.19
LINGO1-206ENST00000562933 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.41■■■■■ 5.18
LINGO1-206ENST00000562933 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.01■■■■■ 5.12
LINGO1-206ENST00000562933 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.93■■■■■ 5.1
LINGO1-206ENST00000562933 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.92■■■■■ 5.1
LINGO1-206ENST00000562933 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.6■■■■■ 5.05
LINGO1-206ENST00000562933 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.42■■■■■ 5.02
LINGO1-206ENST00000562933 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.27■■■■■ 5
LINGO1-206ENST00000562933 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.99■■■■■ 4.95
LINGO1-206ENST00000562933 SCRIBQ14160 1630 aa45.92■■■■■ 4.94
LINGO1-206ENST00000562933 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.63■■■■■ 4.9
LINGO1-206ENST00000562933 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.55■■■■■ 4.88
LINGO1-206ENST00000562933 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
LINGO1-206ENST00000562933 NCAPD3P42695 1498 aa43.97■■■■■ 4.63
LINGO1-206ENST00000562933 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.83■■■■■ 4.61
LINGO1-206ENST00000562933 SMARCA4P51532 1647 aa43.76■■■■■ 4.6
LINGO1-206ENST00000562933 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.73■■■■■ 4.59
LINGO1-206ENST00000562933 SMARCA2P51531 1590 aa43.72■■■■■ 4.59
LINGO1-206ENST00000562933 ERCC6Q03468 1493 aa43.69■■■■■ 4.58
LINGO1-206ENST00000562933 HMGXB3Q12766 1538 aa43.66■■■■■ 4.58
LINGO1-206ENST00000562933 CUX2O14529 1486 aa43.62■■■■■ 4.57
LINGO1-206ENST00000562933 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
LINGO1-206ENST00000562933 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
LINGO1-206ENST00000562933 NESP48681 1621 aa43.35■■■■■ 4.53
LINGO1-206ENST00000562933 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.31■■■■■ 4.52
LINGO1-206ENST00000562933 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.17■■■■■ 4.5
LINGO1-206ENST00000562933 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.03■■■■■ 4.48
LINGO1-206ENST00000562933 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
LINGO1-206ENST00000562933 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.8■■■■■ 4.44
LINGO1-206ENST00000562933 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.8■■■■■ 4.44
LINGO1-206ENST00000562933 WIZO95785 1651 aa42.66■■■■■ 4.42
LINGO1-206ENST00000562933 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.65■■■■■ 4.42
LINGO1-206ENST00000562933 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.44■■■■■ 4.38
LINGO1-206ENST00000562933 WDR62O43379 1518 aa42.34■■■■■ 4.37
LINGO1-206ENST00000562933 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.26■■■■■ 4.36
LINGO1-206ENST00000562933 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
LINGO1-206ENST00000562933 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.18■■■■■ 4.34
LINGO1-206ENST00000562933 CFTRP13569 1480 aa42.12■■■■■ 4.33
LINGO1-206ENST00000562933 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
LINGO1-206ENST00000562933 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
LINGO1-206ENST00000562933 TRIM41Q8WV44 630 aa41.82■■■■■ 4.29
LINGO1-206ENST00000562933 PRDM2Q13029 1718 aa41.72■■■■■ 4.27
LINGO1-206ENST00000562933 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.62■■■■■ 4.25
LINGO1-206ENST00000562933 OSCARQ8IYS5 282 aa41.59■■■■■ 4.25
LINGO1-206ENST00000562933 IFT140Q96RY7 1462 aa41.41■■■■■ 4.22
LINGO1-206ENST00000562933 TOPBP1Q92547 1522 aa41.36■■■■■ 4.21
LINGO1-206ENST00000562933 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
LINGO1-206ENST00000562933 ABCC8Q09428 1581 aa41.26■■■■■ 4.2
LINGO1-206ENST00000562933 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.2■■■■■ 4.19
LINGO1-206ENST00000562933 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
LINGO1-206ENST00000562933 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
LINGO1-206ENST00000562933 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
LINGO1-206ENST00000562933 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
LINGO1-206ENST00000562933 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
LINGO1-206ENST00000562933 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
LINGO1-206ENST00000562933 ARHGEF11O15085 1522 aa40.94■■■■■ 4.14
LINGO1-206ENST00000562933 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
LINGO1-206ENST00000562933 CHD1O14646 1710 aa40.86■■■■■ 4.13
LINGO1-206ENST00000562933 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.78■■■■■ 4.12
LINGO1-206ENST00000562933 FBLN2P98095 1184 aa40.75■■■■■ 4.11
LINGO1-206ENST00000562933 SOGA1O94964 1423 aa40.74■■■■■ 4.11
LINGO1-206ENST00000562933 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
LINGO1-206ENST00000562933 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.65■■■■■ 4.1
LINGO1-206ENST00000562933 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.64■■■■■ 4.1
LINGO1-206ENST00000562933 CUX1P39880 1505 aa40.59■■■■■ 4.09
LINGO1-206ENST00000562933 WDR97A6NE52 1622 aa40.58■■■■■ 4.09
LINGO1-206ENST00000562933 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.56■■■■■ 4.08
LINGO1-206ENST00000562933 ARAP1Q96P48 1450 aa40.52■■■■■ 4.08
LINGO1-206ENST00000562933 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
LINGO1-206ENST00000562933 GRIN2BQ13224 1484 aa40.41■■■■■ 4.06
LINGO1-206ENST00000562933 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
LINGO1-206ENST00000562933 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.37■■■■■ 4.05
LINGO1-206ENST00000562933 SYNJ1O43426 1573 aa40.35■■■■■ 4.05
LINGO1-206ENST00000562933 SYNJ2O15056 1496 aa40.3■■■■■ 4.04
LINGO1-206ENST00000562933 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
LINGO1-206ENST00000562933 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
LINGO1-206ENST00000562933 PBRM1Q86U86 1689 aa40.26■■■■■ 4.04
LINGO1-206ENST00000562933 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.25■■■■■ 4.03
LINGO1-206ENST00000562933 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.17■■■■■ 4.02
LINGO1-206ENST00000562933 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.13■■■■■ 4.02
LINGO1-206ENST00000562933 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40■■■■□ 3.99
LINGO1-206ENST00000562933 TOP2BQ02880 1626 aa39.9■■■■□ 3.98
LINGO1-206ENST00000562933 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.9■■■■□ 3.98
LINGO1-206ENST00000562933 GRIN2AQ12879 1464 aa39.89■■■■□ 3.98
LINGO1-206ENST00000562933 ADAMTS12P58397 1594 aa39.86■■■■□ 3.97
LINGO1-206ENST00000562933 CEP170Q5SW79 1584 aa39.76■■■■□ 3.95
LINGO1-206ENST00000562933 NUP160Q12769 1436 aa39.75■■■■□ 3.95
LINGO1-206ENST00000562933 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.74■■■■□ 3.95
LINGO1-206ENST00000562933 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.72■■■■□ 3.95
LINGO1-206ENST00000562933 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.68■■■■□ 3.94
LINGO1-206ENST00000562933 SHROOM2Q13796 1616 aa39.58■■■■□ 3.93
LINGO1-206ENST00000562933 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
LINGO1-206ENST00000562933 JPH4Q96JJ6 628 aa39.34■■■■□ 3.89
LINGO1-206ENST00000562933 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.3■■■■□ 3.88
LINGO1-206ENST00000562933 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
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