RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.53■■■□□ 2.64
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.61■■■□□ 2.49
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.61■■■□□ 2.49
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.53■■■□□ 2.48
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARAP1Q96P48 1450 aa30.21■■■□□ 2.43
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CEP170Q5SW79 1584 aa29.76■■■□□ 2.35
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NUP160Q12769 1436 aa29.74■■■□□ 2.35
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.72■■■□□ 2.35
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SHROOM2Q13796 1616 aa29.63■■■□□ 2.33
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.45■■■□□ 2.3
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 JPH4Q96JJ6 628 aa29.38■■■□□ 2.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGF1RP08069 1367 aa29.33■■■□□ 2.29
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