RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561556.5

RHBDL1-204, Transcript of rhomboid like 1, humanhuman

TSL 3

Gene RHBDL1, Length 796 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1-204ENST00000561556 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.21■■■■■ 6.75
RHBDL1-204ENST00000561556 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.38■■■■■ 5.82
RHBDL1-204ENST00000561556 ABCC9O60706 1549 aa51.3■■■■■ 5.8
RHBDL1-204ENST00000561556 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.9■■■■■ 5.42
RHBDL1-204ENST00000561556 NACADO15069 1562 aa48.57■■■■■ 5.37
RHBDL1-204ENST00000561556 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.3■■■■■ 5.32
RHBDL1-204ENST00000561556 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.01■■■■■ 5.28
RHBDL1-204ENST00000561556 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.91■■■■■ 5.26
RHBDL1-204ENST00000561556 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.75■■■■■ 5.23
RHBDL1-204ENST00000561556 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.72■■■■■ 5.23
RHBDL1-204ENST00000561556 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
RHBDL1-204ENST00000561556 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.39■■■■■ 5.18
RHBDL1-204ENST00000561556 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.3■■■■■ 5.16
RHBDL1-204ENST00000561556 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.89■■■■■ 5.1
RHBDL1-204ENST00000561556 SCRIBQ14160 1630 aa46.79■■■■■ 5.08
RHBDL1-204ENST00000561556 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.36■■■■■ 5.01
RHBDL1-204ENST00000561556 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
RHBDL1-204ENST00000561556 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.24■■■■■ 4.99
RHBDL1-204ENST00000561556 NCAPD3P42695 1498 aa44.8■■■■■ 4.76
RHBDL1-204ENST00000561556 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.66■■■■■ 4.74
RHBDL1-204ENST00000561556 SMARCA4P51532 1647 aa44.64■■■■■ 4.74
RHBDL1-204ENST00000561556 SMARCA2P51531 1590 aa44.6■■■■■ 4.73
RHBDL1-204ENST00000561556 HMGXB3Q12766 1538 aa44.5■■■■■ 4.71
RHBDL1-204ENST00000561556 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
RHBDL1-204ENST00000561556 ERCC6Q03468 1493 aa44.37■■■■■ 4.69
RHBDL1-204ENST00000561556 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
RHBDL1-204ENST00000561556 CUX2O14529 1486 aa44.27■■■■■ 4.68
RHBDL1-204ENST00000561556 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.21■■■■■ 4.67
RHBDL1-204ENST00000561556 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.15■■■■■ 4.66
RHBDL1-204ENST00000561556 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.05■■■■■ 4.64
RHBDL1-204ENST00000561556 NESP48681 1621 aa44.05■■■■■ 4.64
RHBDL1-204ENST00000561556 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.83■■■■■ 4.61
RHBDL1-204ENST00000561556 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
RHBDL1-204ENST00000561556 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.59■■■■■ 4.57
RHBDL1-204ENST00000561556 WIZO95785 1651 aa43.53■■■■■ 4.56
RHBDL1-204ENST00000561556 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.51■■■■■ 4.56
RHBDL1-204ENST00000561556 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.45■■■■■ 4.55
RHBDL1-204ENST00000561556 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.19■■■■■ 4.5
RHBDL1-204ENST00000561556 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
RHBDL1-204ENST00000561556 WDR62O43379 1518 aa43.07■■■■■ 4.48
RHBDL1-204ENST00000561556 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.04■■■■■ 4.48
RHBDL1-204ENST00000561556 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
RHBDL1-204ENST00000561556 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.97■■■■■ 4.47
RHBDL1-204ENST00000561556 CFTRP13569 1480 aa42.96■■■■■ 4.47
RHBDL1-204ENST00000561556 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
RHBDL1-204ENST00000561556 PRDM2Q13029 1718 aa42.56■■■■■ 4.4
RHBDL1-204ENST00000561556 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.51■■■■■ 4.4
RHBDL1-204ENST00000561556 TRIM41Q8WV44 630 aa42.25■■■■■ 4.35
RHBDL1-204ENST00000561556 OSCARQ8IYS5 282 aa42.24■■■■■ 4.35
RHBDL1-204ENST00000561556 IFT140Q96RY7 1462 aa42.17■■■■■ 4.34
RHBDL1-204ENST00000561556 TOPBP1Q92547 1522 aa42.15■■■■■ 4.34
RHBDL1-204ENST00000561556 ABCC8Q09428 1581 aa42.12■■■■■ 4.33
RHBDL1-204ENST00000561556 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
RHBDL1-204ENST00000561556 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.01■■■■■ 4.32
RHBDL1-204ENST00000561556 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
RHBDL1-204ENST00000561556 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
RHBDL1-204ENST00000561556 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
RHBDL1-204ENST00000561556 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.67■■■■■ 4.26
RHBDL1-204ENST00000561556 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.66■■■■■ 4.26
RHBDL1-204ENST00000561556 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.66■■■■■ 4.26
RHBDL1-204ENST00000561556 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.66■■■■■ 4.26
RHBDL1-204ENST00000561556 SOGA1O94964 1423 aa41.54■■■■■ 4.24
RHBDL1-204ENST00000561556 ARHGEF11O15085 1522 aa41.54■■■■■ 4.24
RHBDL1-204ENST00000561556 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.53■■■■■ 4.24
RHBDL1-204ENST00000561556 CHD1O14646 1710 aa41.52■■■■■ 4.24
RHBDL1-204ENST00000561556 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.46■■■■■ 4.23
RHBDL1-204ENST00000561556 FBLN2P98095 1184 aa41.45■■■■■ 4.23
RHBDL1-204ENST00000561556 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
RHBDL1-204ENST00000561556 WDR97A6NE52 1622 aa41.41■■■■■ 4.22
RHBDL1-204ENST00000561556 CUX1P39880 1505 aa41.4■■■■■ 4.22
RHBDL1-204ENST00000561556 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
RHBDL1-204ENST00000561556 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.28■■■■■ 4.2
RHBDL1-204ENST00000561556 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.23■■■■■ 4.19
RHBDL1-204ENST00000561556 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
RHBDL1-204ENST00000561556 GRIN2BQ13224 1484 aa41.2■■■■■ 4.19
RHBDL1-204ENST00000561556 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
RHBDL1-204ENST00000561556 ARAP1Q96P48 1450 aa41.11■■■■■ 4.17
RHBDL1-204ENST00000561556 SYNJ1O43426 1573 aa41.08■■■■■ 4.17
RHBDL1-204ENST00000561556 SYNJ2O15056 1496 aa41.05■■■■■ 4.16
RHBDL1-204ENST00000561556 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.04■■■■■ 4.16
RHBDL1-204ENST00000561556 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.04■■■■■ 4.16
RHBDL1-204ENST00000561556 PBRM1Q86U86 1689 aa41.01■■■■■ 4.16
RHBDL1-204ENST00000561556 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41■■■■■ 4.15
RHBDL1-204ENST00000561556 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.93■■■■■ 4.14
RHBDL1-204ENST00000561556 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.87■■■■■ 4.13
RHBDL1-204ENST00000561556 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
RHBDL1-204ENST00000561556 TOP2BQ02880 1626 aa40.78■■■■■ 4.12
RHBDL1-204ENST00000561556 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.78■■■■■ 4.12
RHBDL1-204ENST00000561556 GRIN2AQ12879 1464 aa40.64■■■■■ 4.1
RHBDL1-204ENST00000561556 ADAMTS12P58397 1594 aa40.62■■■■■ 4.09
RHBDL1-204ENST00000561556 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.54■■■■■ 4.08
RHBDL1-204ENST00000561556 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.52■■■■■ 4.08
RHBDL1-204ENST00000561556 NUP160Q12769 1436 aa40.5■■■■■ 4.07
RHBDL1-204ENST00000561556 CEP170Q5SW79 1584 aa40.48■■■■■ 4.07
RHBDL1-204ENST00000561556 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.35■■■■■ 4.05
RHBDL1-204ENST00000561556 SHROOM2Q13796 1616 aa40.31■■■■■ 4.04
RHBDL1-204ENST00000561556 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
RHBDL1-204ENST00000561556 JPH4Q96JJ6 628 aa40.09■■■■■ 4.01
RHBDL1-204ENST00000561556 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.06■■■■■ 4
RHBDL1-204ENST00000561556 KIF27Q86VH2 1401 aa40.02■■■■■ 4
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