RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559507.1

AMN-205, Transcript of amnion associated transmembrane protein, humanhuman

TSL 3

Gene AMN, Length 435 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMN-205ENST00000559507 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.79■■■■■ 7.48
AMN-205ENST00000559507 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.92■■■■■ 6.38
AMN-205ENST00000559507 ABCC9O60706 1549 aa54.41■■■■■ 6.3
AMN-205ENST00000559507 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.97■■■■■ 5.91
AMN-205ENST00000559507 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.89■■■■■ 5.9
AMN-205ENST00000559507 NACADO15069 1562 aa51.76■■■■■ 5.88
AMN-205ENST00000559507 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.41■■■■■ 5.82
AMN-205ENST00000559507 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.39■■■■■ 5.82
AMN-205ENST00000559507 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.32■■■■■ 5.81
AMN-205ENST00000559507 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.03■■■■■ 5.76
AMN-205ENST00000559507 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.67■■■■■ 5.75e-8■■■■□ 23.3
AMN-205ENST00000559507 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.65■■■■■ 5.7
AMN-205ENST00000559507 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.33■■■■■ 5.65
AMN-205ENST00000559507 SCRIBQ14160 1630 aa50.24■■■■■ 5.63
AMN-205ENST00000559507 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.69■■■■■ 5.55
AMN-205ENST00000559507 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.12■■■■■ 5.45
AMN-205ENST00000559507 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.1■■■■■ 5.45
AMN-205ENST00000559507 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
AMN-205ENST00000559507 SMARCA4P51532 1647 aa47.97■■■■■ 5.27
AMN-205ENST00000559507 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.89■■■■■ 5.26
AMN-205ENST00000559507 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.82■■■■■ 5.25
AMN-205ENST00000559507 NCAPD3P42695 1498 aa47.8■■■■■ 5.24
AMN-205ENST00000559507 SMARCA2P51531 1590 aa47.71■■■■■ 5.23
AMN-205ENST00000559507 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.66■■■■■ 5.22
AMN-205ENST00000559507 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.61■■■■■ 5.21
AMN-205ENST00000559507 HMGXB3Q12766 1538 aa47.49■■■■■ 5.19
AMN-205ENST00000559507 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.45■■■■■ 5.19
AMN-205ENST00000559507 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
AMN-205ENST00000559507 CUX2O14529 1486 aa47.14■■■■■ 5.14
AMN-205ENST00000559507 WIZO95785 1651 aa47.11■■■■■ 5.13
AMN-205ENST00000559507 ERCC6Q03468 1493 aa47.08■■■■■ 5.13
AMN-205ENST00000559507 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.05■■■■■ 5.12
AMN-205ENST00000559507 NESP48681 1621 aa46.79■■■■■ 5.08
AMN-205ENST00000559507 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
AMN-205ENST00000559507 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.53■■■■■ 5.04
AMN-205ENST00000559507 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.45■■■■■ 5.03
AMN-205ENST00000559507 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.31■■■■■ 5
AMN-205ENST00000559507 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
AMN-205ENST00000559507 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.13■■■■■ 4.97
AMN-205ENST00000559507 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.09■■■■■ 4.97
AMN-205ENST00000559507 CFTRP13569 1480 aa46.08■■■■■ 4.97
AMN-205ENST00000559507 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.91■■■■■ 4.94
AMN-205ENST00000559507 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.86■■■■■ 4.93
AMN-205ENST00000559507 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
AMN-205ENST00000559507 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.83■■■■■ 4.93
AMN-205ENST00000559507 WDR62O43379 1518 aa45.64■■■■■ 4.9
AMN-205ENST00000559507 PRDM2Q13029 1718 aa45.57■■■■■ 4.89
AMN-205ENST00000559507 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
AMN-205ENST00000559507 TRIM41Q8WV44 630 aa45.34■■■■■ 4.85
AMN-205ENST00000559507 TOPBP1Q92547 1522 aa45.13■■■■■ 4.82
AMN-205ENST00000559507 ABCC8Q09428 1581 aa45.07■■■■■ 4.81
AMN-205ENST00000559507 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.02■■■■■ 4.8
AMN-205ENST00000559507 OSCARQ8IYS5 282 aa44.95■■■■■ 4.79
AMN-205ENST00000559507 IFT140Q96RY7 1462 aa44.9■■■■■ 4.78
AMN-205ENST00000559507 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
AMN-205ENST00000559507 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
AMN-205ENST00000559507 CUX1P39880 1505 aa44.71■■■■■ 4.75
AMN-205ENST00000559507 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
AMN-205ENST00000559507 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.61■■■■■ 4.73
AMN-205ENST00000559507 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.6■■■■■ 4.73
AMN-205ENST00000559507 SOGA1O94964 1423 aa44.6■■■■■ 4.73
AMN-205ENST00000559507 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.52■■■■■ 4.72
AMN-205ENST00000559507 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
AMN-205ENST00000559507 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
AMN-205ENST00000559507 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.36■■■■■ 4.69
AMN-205ENST00000559507 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.3■■■■■ 4.68
AMN-205ENST00000559507 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.3■■■■■ 4.68
AMN-205ENST00000559507 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.3■■■■■ 4.68
AMN-205ENST00000559507 SYNJ1O43426 1573 aa44.23■■■■■ 4.67
AMN-205ENST00000559507 TOP2BQ02880 1626 aa44.22■■■■■ 4.67
AMN-205ENST00000559507 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.18■■■■■ 4.66
AMN-205ENST00000559507 WDR97A6NE52 1622 aa44.17■■■■■ 4.66
AMN-205ENST00000559507 ARHGEF11O15085 1522 aa44.15■■■■■ 4.66
AMN-205ENST00000559507 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.13■■■■■ 4.65
AMN-205ENST00000559507 FBLN2P98095 1184 aa44.11■■■■■ 4.65
AMN-205ENST00000559507 GRIN2BQ13224 1484 aa44.06■■■■■ 4.64
AMN-205ENST00000559507 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.05■■■■■ 4.64
AMN-205ENST00000559507 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.05■■■■■ 4.64
AMN-205ENST00000559507 CHD1O14646 1710 aa43.96■■■■■ 4.63
AMN-205ENST00000559507 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.94■■■■■ 4.62
AMN-205ENST00000559507 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
AMN-205ENST00000559507 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.9■■■■■ 4.62
AMN-205ENST00000559507 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
AMN-205ENST00000559507 PBRM1Q86U86 1689 aa43.88■■■■■ 4.61
AMN-205ENST00000559507 SYNJ2O15056 1496 aa43.79■■■■■ 4.6
AMN-205ENST00000559507 ARAP1Q96P48 1450 aa43.67■■■■■ 4.58
AMN-205ENST00000559507 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
AMN-205ENST00000559507 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.58■■■■■ 4.57
AMN-205ENST00000559507 ADAMTS12P58397 1594 aa43.55■■■■■ 4.56
AMN-205ENST00000559507 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.53■■■■■ 4.56
AMN-205ENST00000559507 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.49■■■■■ 4.55
AMN-205ENST00000559507 GRIN2AQ12879 1464 aa43.49■■■■■ 4.55
AMN-205ENST00000559507 KIF27Q86VH2 1401 aa43.47■■■■■ 4.55
AMN-205ENST00000559507 IGF1RP08069 1367 aa43.34■■■■■ 4.53
AMN-205ENST00000559507 NUP160Q12769 1436 aa43.29■■■■■ 4.52
AMN-205ENST00000559507 CEP170Q5SW79 1584 aa43.27■■■■■ 4.52
AMN-205ENST00000559507 CUL7Q14999 1698 aa43.11■■■■■ 4.49
AMN-205ENST00000559507 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.08■■■■■ 4.49
AMN-205ENST00000559507 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.03■■■■■ 4.48
AMN-205ENST00000559507 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.95■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms