RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559296.1

ZHX3-215, Transcript of zinc fingers and homeoboxes 3, humanhuman

TSL 5

Gene ZHX3, Length 258 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZHX3-215ENST00000559296 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.32■■■■■ 6.77
ZHX3-215ENST00000559296 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.04■■■■■ 5.76
ZHX3-215ENST00000559296 ABCC9O60706 1549 aa50.41■■■■■ 5.66
ZHX3-215ENST00000559296 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.2■■■■■ 5.31
ZHX3-215ENST00000559296 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.07■■■■■ 5.29
ZHX3-215ENST00000559296 NACADO15069 1562 aa48.05■■■■■ 5.28
ZHX3-215ENST00000559296 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.69■■■■■ 5.22
ZHX3-215ENST00000559296 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.6■■■■■ 5.21
ZHX3-215ENST00000559296 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.3■■■■■ 5.16
ZHX3-215ENST00000559296 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.26■■■■■ 5.16
ZHX3-215ENST00000559296 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.07■■■■■ 5.13
ZHX3-215ENST00000559296 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.89■■■■■ 5.1
ZHX3-215ENST00000559296 SCRIBQ14160 1630 aa46.69■■■■■ 5.07
ZHX3-215ENST00000559296 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.65■■■■■ 5.06
ZHX3-215ENST00000559296 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.12■■■■■ 4.97
ZHX3-215ENST00000559296 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
ZHX3-215ENST00000559296 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.55■■■■■ 4.88
ZHX3-215ENST00000559296 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.27■■■■■ 4.84
ZHX3-215ENST00000559296 SMARCA4P51532 1647 aa44.57■■■■■ 4.72
ZHX3-215ENST00000559296 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.4■■■■■ 4.7
ZHX3-215ENST00000559296 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
ZHX3-215ENST00000559296 NCAPD3P42695 1498 aa44.36■■■■■ 4.69
ZHX3-215ENST00000559296 SMARCA2P51531 1590 aa44.25■■■■■ 4.67
ZHX3-215ENST00000559296 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.25■■■■■ 4.67
ZHX3-215ENST00000559296 HMGXB3Q12766 1538 aa44.11■■■■■ 4.65
ZHX3-215ENST00000559296 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.07■■■■■ 4.65
ZHX3-215ENST00000559296 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
ZHX3-215ENST00000559296 WIZO95785 1651 aa43.77■■■■■ 4.6
ZHX3-215ENST00000559296 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
ZHX3-215ENST00000559296 NESP48681 1621 aa43.57■■■■■ 4.57
ZHX3-215ENST00000559296 ERCC6Q03468 1493 aa43.38■■■■■ 4.53
ZHX3-215ENST00000559296 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.23■■■■■ 4.51
ZHX3-215ENST00000559296 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
ZHX3-215ENST00000559296 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.07■■■■■ 4.49
ZHX3-215ENST00000559296 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.01■■■■■ 4.48
ZHX3-215ENST00000559296 CUX2O14529 1486 aa42.99■■■■■ 4.47
ZHX3-215ENST00000559296 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.93■■■■■ 4.46
ZHX3-215ENST00000559296 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
ZHX3-215ENST00000559296 CFTRP13569 1480 aa42.75■■■■■ 4.43
ZHX3-215ENST00000559296 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.73■■■■■ 4.43
ZHX3-215ENST00000559296 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.62■■■■■ 4.41
ZHX3-215ENST00000559296 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.58■■■■■ 4.41
ZHX3-215ENST00000559296 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.56■■■■■ 4.4
ZHX3-215ENST00000559296 WDR62O43379 1518 aa42.46■■■■■ 4.39
ZHX3-215ENST00000559296 PRDM2Q13029 1718 aa42.41■■■■■ 4.38
ZHX3-215ENST00000559296 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
ZHX3-215ENST00000559296 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
ZHX3-215ENST00000559296 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.11■■■■■ 4.33
ZHX3-215ENST00000559296 TOPBP1Q92547 1522 aa41.91■■■■■ 4.3
ZHX3-215ENST00000559296 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
ZHX3-215ENST00000559296 ABCC8Q09428 1581 aa41.73■■■■■ 4.27
ZHX3-215ENST00000559296 IFT140Q96RY7 1462 aa41.66■■■■■ 4.26
ZHX3-215ENST00000559296 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
ZHX3-215ENST00000559296 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
ZHX3-215ENST00000559296 CUX1P39880 1505 aa41.52■■■■■ 4.24
ZHX3-215ENST00000559296 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
ZHX3-215ENST00000559296 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.43■■■■■ 4.22
ZHX3-215ENST00000559296 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
ZHX3-215ENST00000559296 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
ZHX3-215ENST00000559296 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
ZHX3-215ENST00000559296 SOGA1O94964 1423 aa41.32■■■■■ 4.21
ZHX3-215ENST00000559296 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
ZHX3-215ENST00000559296 OSCARQ8IYS5 282 aa41.15■■■■■ 4.18
ZHX3-215ENST00000559296 WDR97A6NE52 1622 aa41.08■■■■■ 4.17
ZHX3-215ENST00000559296 SYNJ1O43426 1573 aa41.07■■■■■ 4.16
ZHX3-215ENST00000559296 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.05■■■■■ 4.16
ZHX3-215ENST00000559296 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.01■■■■■ 4.16
ZHX3-215ENST00000559296 TOP2BQ02880 1626 aa41■■■■■ 4.15
ZHX3-215ENST00000559296 CHD1O14646 1710 aa40.98■■■■■ 4.15
ZHX3-215ENST00000559296 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.93■■■■■ 4.14
ZHX3-215ENST00000559296 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.93■■■■■ 4.14
ZHX3-215ENST00000559296 GRIN2BQ13224 1484 aa40.86■■■■■ 4.13
ZHX3-215ENST00000559296 FBLN2P98095 1184 aa40.86■■■■■ 4.13
ZHX3-215ENST00000559296 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.84■■■■■ 4.13
ZHX3-215ENST00000559296 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.84■■■■■ 4.13
ZHX3-215ENST00000559296 PBRM1Q86U86 1689 aa40.82■■■■■ 4.13
ZHX3-215ENST00000559296 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
ZHX3-215ENST00000559296 TRIM41Q8WV44 630 aa40.68■■■■■ 4.1
ZHX3-215ENST00000559296 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.65■■■■■ 4.1
ZHX3-215ENST00000559296 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.65■■■■■ 4.1
ZHX3-215ENST00000559296 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.65■■■■■ 4.1
ZHX3-215ENST00000559296 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
ZHX3-215ENST00000559296 SYNJ2O15056 1496 aa40.64■■■■■ 4.1
ZHX3-215ENST00000559296 ARHGEF11O15085 1522 aa40.58■■■■■ 4.09
ZHX3-215ENST00000559296 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.49■■■■■ 4.07
ZHX3-215ENST00000559296 ADAMTS12P58397 1594 aa40.48■■■■■ 4.07
ZHX3-215ENST00000559296 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.4■■■■■ 4.06
ZHX3-215ENST00000559296 GRIN2AQ12879 1464 aa40.37■■■■■ 4.05
ZHX3-215ENST00000559296 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.33■■■■■ 4.05
ZHX3-215ENST00000559296 ARAP1Q96P48 1450 aa40.27■■■■■ 4.04
ZHX3-215ENST00000559296 CEP170Q5SW79 1584 aa40.24■■■■■ 4.03
ZHX3-215ENST00000559296 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.22■■■■■ 4.03
ZHX3-215ENST00000559296 NUP160Q12769 1436 aa40.2■■■■■ 4.03
ZHX3-215ENST00000559296 KIF27Q86VH2 1401 aa40.17■■■■■ 4.02
ZHX3-215ENST00000559296 IGF1RP08069 1367 aa40.12■■■■■ 4.01
ZHX3-215ENST00000559296 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.02■■■■■ 4
ZHX3-215ENST00000559296 CUL7Q14999 1698 aa39.97■■■■□ 3.99
ZHX3-215ENST00000559296 SHROOM2Q13796 1616 aa39.94■■■■□ 3.98
ZHX3-215ENST00000559296 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.91■■■■□ 3.98
ZHX3-215ENST00000559296 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.85■■■■□ 3.97
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