RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557485.5

WDR20-213, Transcript of WD repeat domain 20, humanhuman

TSL 3

Gene WDR20, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR20-213ENST00000557485 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.91■■■■■ 4.94
WDR20-213ENST00000557485 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.49■■■■■ 4.07
WDR20-213ENST00000557485 ABCC9O60706 1549 aa39.41■■■■□ 3.9
WDR20-213ENST00000557485 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
WDR20-213ENST00000557485 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.28■■■■□ 3.72
WDR20-213ENST00000557485 NACADO15069 1562 aa38.05■■■■□ 3.68
WDR20-213ENST00000557485 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.98■■■■□ 3.67
WDR20-213ENST00000557485 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.97■■■■□ 3.67
WDR20-213ENST00000557485 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.97■■■■□ 3.67
WDR20-213ENST00000557485 SCRIBQ14160 1630 aa37.1■■■■□ 3.53
WDR20-213ENST00000557485 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.98■■■■□ 3.51
WDR20-213ENST00000557485 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.96■■■■□ 3.51
WDR20-213ENST00000557485 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.87■■■■□ 3.49
WDR20-213ENST00000557485 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.62■■■■□ 3.45
WDR20-213ENST00000557485 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.87■■■■□ 3.33
WDR20-213ENST00000557485 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
WDR20-213ENST00000557485 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.78■■■■□ 3.32
WDR20-213ENST00000557485 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.58■■■■□ 3.29
WDR20-213ENST00000557485 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
WDR20-213ENST00000557485 SMARCA4P51532 1647 aa35.49■■■■□ 3.27
WDR20-213ENST00000557485 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.42■■■■□ 3.26
WDR20-213ENST00000557485 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.27■■■■□ 3.24
WDR20-213ENST00000557485 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
WDR20-213ENST00000557485 SMARCA2P51531 1590 aa35.17■■■■□ 3.22
WDR20-213ENST00000557485 NCAPD3P42695 1498 aa35.17■■■■□ 3.22
WDR20-213ENST00000557485 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.13■■■■□ 3.21
WDR20-213ENST00000557485 WIZO95785 1651 aa34.98■■■■□ 3.19
WDR20-213ENST00000557485 HMGXB3Q12766 1538 aa34.98■■■■□ 3.19
WDR20-213ENST00000557485 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
WDR20-213ENST00000557485 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
WDR20-213ENST00000557485 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
WDR20-213ENST00000557485 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.31■■■■□ 3.08
WDR20-213ENST00000557485 NESP48681 1621 aa34.22■■■■□ 3.07
WDR20-213ENST00000557485 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.2■■■■□ 3.07
WDR20-213ENST00000557485 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.1■■■■□ 3.05
WDR20-213ENST00000557485 CFTRP13569 1480 aa34.06■■■■□ 3.04
WDR20-213ENST00000557485 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.93■■■■□ 3.02
WDR20-213ENST00000557485 ERCC6Q03468 1493 aa33.9■■■■□ 3.02
WDR20-213ENST00000557485 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.78■■■■□ 3
WDR20-213ENST00000557485 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.68■■■□□ 2.98
WDR20-213ENST00000557485 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.68■■■□□ 2.98
WDR20-213ENST00000557485 PRDM2Q13029 1718 aa33.57■■■□□ 2.96
WDR20-213ENST00000557485 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.56■■■□□ 2.96
WDR20-213ENST00000557485 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
WDR20-213ENST00000557485 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
WDR20-213ENST00000557485 WDR62O43379 1518 aa33.4■■■□□ 2.94
WDR20-213ENST00000557485 CUX2O14529 1486 aa33.37■■■□□ 2.93
WDR20-213ENST00000557485 TOPBP1Q92547 1522 aa33.28■■■□□ 2.92
WDR20-213ENST00000557485 ABCC8Q09428 1581 aa33.24■■■□□ 2.91
WDR20-213ENST00000557485 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.24■■■□□ 2.91
WDR20-213ENST00000557485 CUX1P39880 1505 aa33.19■■■□□ 2.9
WDR20-213ENST00000557485 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.15■■■□□ 2.9
WDR20-213ENST00000557485 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
WDR20-213ENST00000557485 SYNJ1O43426 1573 aa33.01■■■□□ 2.88
WDR20-213ENST00000557485 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.01■■■□□ 2.88
WDR20-213ENST00000557485 IFT140Q96RY7 1462 aa32.97■■■□□ 2.87
WDR20-213ENST00000557485 TOP2BQ02880 1626 aa32.96■■■□□ 2.87
WDR20-213ENST00000557485 SOGA1O94964 1423 aa32.93■■■□□ 2.86
WDR20-213ENST00000557485 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.93■■■□□ 2.86
WDR20-213ENST00000557485 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.91■■■□□ 2.86
WDR20-213ENST00000557485 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
WDR20-213ENST00000557485 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.85
WDR20-213ENST00000557485 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
WDR20-213ENST00000557485 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.7■■■□□ 2.83
WDR20-213ENST00000557485 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.7■■■□□ 2.83
WDR20-213ENST00000557485 TRIM41Q8WV44 630 aa32.68■■■□□ 2.82
WDR20-213ENST00000557485 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
WDR20-213ENST00000557485 WDR97A6NE52 1622 aa32.6■■■□□ 2.81
WDR20-213ENST00000557485 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.59■■■□□ 2.81
WDR20-213ENST00000557485 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.53■■■□□ 2.8
WDR20-213ENST00000557485 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.48■■■□□ 2.79
WDR20-213ENST00000557485 GRIN2BQ13224 1484 aa32.47■■■□□ 2.79
WDR20-213ENST00000557485 KIF27Q86VH2 1401 aa32.42■■■□□ 2.78
WDR20-213ENST00000557485 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.39■■■□□ 2.78
WDR20-213ENST00000557485 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
WDR20-213ENST00000557485 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.29■■■□□ 2.76
WDR20-213ENST00000557485 PBRM1Q86U86 1689 aa32.28■■■□□ 2.76
WDR20-213ENST00000557485 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.28■■■□□ 2.76
WDR20-213ENST00000557485 IGF1RP08069 1367 aa32.28■■■□□ 2.76
WDR20-213ENST00000557485 FBLN2P98095 1184 aa32.24■■■□□ 2.75
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WDR20-213ENST00000557485 SYNJ2O15056 1496 aa32.2■■■□□ 2.75
WDR20-213ENST00000557485 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.17■■■□□ 2.74
WDR20-213ENST00000557485 ADAMTS12P58397 1594 aa32.16■■■□□ 2.74
WDR20-213ENST00000557485 OSCARQ8IYS5 282 aa32.11■■■□□ 2.73
WDR20-213ENST00000557485 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.07■■■□□ 2.73
WDR20-213ENST00000557485 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
WDR20-213ENST00000557485 GRIN2AQ12879 1464 aa32.04■■■□□ 2.72
WDR20-213ENST00000557485 CHD1O14646 1710 aa32.04■■■□□ 2.72
WDR20-213ENST00000557485 EEA1Q15075 1411 aa32.04■■■□□ 2.72
WDR20-213ENST00000557485 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.01■■■□□ 2.71
WDR20-213ENST00000557485 CUL7Q14999 1698 aa32.01■■■□□ 2.71
WDR20-213ENST00000557485 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.92■■■□□ 2.7
WDR20-213ENST00000557485 PRXQ9BXM0 1461 aa31.91■■■□□ 2.7
WDR20-213ENST00000557485 NUP160Q12769 1436 aa31.91■■■□□ 2.7
WDR20-213ENST00000557485 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.9■■■□□ 2.7
WDR20-213ENST00000557485 CEP170Q5SW79 1584 aa31.85■■■□□ 2.69
WDR20-213ENST00000557485 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.82■■■□□ 2.68
WDR20-213ENST00000557485 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.69■■■□□ 2.66
WDR20-213ENST00000557485 KIF21BO75037 1637 aa31.64■■■□□ 2.65
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