RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557415.5

PRMT5-225, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, humanhuman

TSL 2

Gene PRMT5, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT5-225ENST00000557415 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.11■■■■■ 6.73
PRMT5-225ENST00000557415 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.26■■■■■ 5.8
PRMT5-225ENST00000557415 ABCC9O60706 1549 aa50.96■■■■■ 5.75
PRMT5-225ENST00000557415 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.67■■■■■ 5.38
PRMT5-225ENST00000557415 NACADO15069 1562 aa48.4■■■■■ 5.34
PRMT5-225ENST00000557415 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.93■■■■■ 5.26
PRMT5-225ENST00000557415 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.85■■■■■ 5.25
PRMT5-225ENST00000557415 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.68■■■■■ 5.22
PRMT5-225ENST00000557415 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.59■■■■■ 5.21
PRMT5-225ENST00000557415 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.42■■■■■ 5.18
PRMT5-225ENST00000557415 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.38■■■■■ 5.17
PRMT5-225ENST00000557415 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.27■■■■■ 5.16
PRMT5-225ENST00000557415 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.26■■■■■ 5.16
PRMT5-225ENST00000557415 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.72■■■■■ 5.07
PRMT5-225ENST00000557415 SCRIBQ14160 1630 aa46.59■■■■■ 5.05
PRMT5-225ENST00000557415 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.11■■■■■ 4.97
PRMT5-225ENST00000557415 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
PRMT5-225ENST00000557415 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.93■■■■■ 4.94
PRMT5-225ENST00000557415 NCAPD3P42695 1498 aa44.67■■■■■ 4.74
PRMT5-225ENST00000557415 SMARCA4P51532 1647 aa44.53■■■■■ 4.72
PRMT5-225ENST00000557415 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.52■■■■■ 4.72
PRMT5-225ENST00000557415 SMARCA2P51531 1590 aa44.43■■■■■ 4.7
PRMT5-225ENST00000557415 HMGXB3Q12766 1538 aa44.37■■■■■ 4.69
PRMT5-225ENST00000557415 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
PRMT5-225ENST00000557415 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.16■■■■■ 4.66
PRMT5-225ENST00000557415 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
PRMT5-225ENST00000557415 ERCC6Q03468 1493 aa44■■■■■ 4.63
PRMT5-225ENST00000557415 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.97■■■■■ 4.63
PRMT5-225ENST00000557415 CUX2O14529 1486 aa43.96■■■■■ 4.63
PRMT5-225ENST00000557415 NESP48681 1621 aa43.83■■■■■ 4.61
PRMT5-225ENST00000557415 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.72■■■■■ 4.59
PRMT5-225ENST00000557415 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.64■■■■■ 4.58
PRMT5-225ENST00000557415 WIZO95785 1651 aa43.45■■■■■ 4.55
PRMT5-225ENST00000557415 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
PRMT5-225ENST00000557415 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.34■■■■■ 4.53
PRMT5-225ENST00000557415 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.33■■■■■ 4.53
PRMT5-225ENST00000557415 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.28■■■■■ 4.52
PRMT5-225ENST00000557415 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.49
PRMT5-225ENST00000557415 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.96■■■■■ 4.47
PRMT5-225ENST00000557415 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
PRMT5-225ENST00000557415 WDR62O43379 1518 aa42.89■■■■■ 4.46
PRMT5-225ENST00000557415 CFTRP13569 1480 aa42.84■■■■■ 4.45
PRMT5-225ENST00000557415 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.81■■■■■ 4.44
PRMT5-225ENST00000557415 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.77■■■■■ 4.44
PRMT5-225ENST00000557415 PRDM2Q13029 1718 aa42.48■■■■■ 4.39
PRMT5-225ENST00000557415 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.43■■■■■ 4.38
PRMT5-225ENST00000557415 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
PRMT5-225ENST00000557415 TOPBP1Q92547 1522 aa42■■■■■ 4.31
PRMT5-225ENST00000557415 IFT140Q96RY7 1462 aa41.97■■■■■ 4.31
PRMT5-225ENST00000557415 ABCC8Q09428 1581 aa41.96■■■■■ 4.31
PRMT5-225ENST00000557415 OSCARQ8IYS5 282 aa41.9■■■■■ 4.3
PRMT5-225ENST00000557415 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.88■■■■■ 4.29
PRMT5-225ENST00000557415 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
PRMT5-225ENST00000557415 TRIM41Q8WV44 630 aa41.73■■■■■ 4.27
PRMT5-225ENST00000557415 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
PRMT5-225ENST00000557415 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
PRMT5-225ENST00000557415 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
PRMT5-225ENST00000557415 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.233e-6■■■■■ 27.4
PRMT5-225ENST00000557415 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.38■■■■■ 4.21
PRMT5-225ENST00000557415 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.38■■■■■ 4.21
PRMT5-225ENST00000557415 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.38■■■■■ 4.21
PRMT5-225ENST00000557415 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.36■■■■■ 4.21
PRMT5-225ENST00000557415 SOGA1O94964 1423 aa41.35■■■■■ 4.21
PRMT5-225ENST00000557415 CHD1O14646 1710 aa41.32■■■■■ 4.21
PRMT5-225ENST00000557415 CUX1P39880 1505 aa41.32■■■■■ 4.2
PRMT5-225ENST00000557415 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.31■■■■■ 4.2
PRMT5-225ENST00000557415 WDR97A6NE52 1622 aa41.29■■■■■ 4.2
PRMT5-225ENST00000557415 ARHGEF11O15085 1522 aa41.27■■■■■ 4.2
PRMT5-225ENST00000557415 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
PRMT5-225ENST00000557415 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
PRMT5-225ENST00000557415 FBLN2P98095 1184 aa41.08■■■■■ 4.17
PRMT5-225ENST00000557415 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.08■■■■■ 4.17
PRMT5-225ENST00000557415 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
PRMT5-225ENST00000557415 GRIN2BQ13224 1484 aa41.01■■■■■ 4.16
PRMT5-225ENST00000557415 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.9■■■■■ 4.14
PRMT5-225ENST00000557415 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.88■■■■■ 4.14
PRMT5-225ENST00000557415 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.88■■■■■ 4.13
PRMT5-225ENST00000557415 PBRM1Q86U86 1689 aa40.88■■■■■ 4.13
PRMT5-225ENST00000557415 SYNJ2O15056 1496 aa40.87■■■■■ 4.13
PRMT5-225ENST00000557415 ARAP1Q96P48 1450 aa40.87■■■■■ 4.13
PRMT5-225ENST00000557415 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.86■■■■■ 4.13
PRMT5-225ENST00000557415 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
PRMT5-225ENST00000557415 SYNJ1O43426 1573 aa40.85■■■■■ 4.13
PRMT5-225ENST00000557415 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.84■■■■■ 4.13
PRMT5-225ENST00000557415 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.75■■■■■ 4.11
PRMT5-225ENST00000557415 TOP2BQ02880 1626 aa40.73■■■■■ 4.11
PRMT5-225ENST00000557415 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.73■■■■■ 4.11
PRMT5-225ENST00000557415 ADAMTS12P58397 1594 aa40.5■■■■■ 4.07
PRMT5-225ENST00000557415 GRIN2AQ12879 1464 aa40.49■■■■■ 4.07
PRMT5-225ENST00000557415 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.4■■■■■ 4.06
PRMT5-225ENST00000557415 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.38■■■■■ 4.05
PRMT5-225ENST00000557415 NUP160Q12769 1436 aa40.38■■■■■ 4.05
PRMT5-225ENST00000557415 CEP170Q5SW79 1584 aa40.33■■■■■ 4.05
PRMT5-225ENST00000557415 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
PRMT5-225ENST00000557415 SHROOM2Q13796 1616 aa40.21■■■■■ 4.03
PRMT5-225ENST00000557415 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.19■■■■■ 4.02
PRMT5-225ENST00000557415 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.94■■■■□ 3.98
PRMT5-225ENST00000557415 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
PRMT5-225ENST00000557415 KIF27Q86VH2 1401 aa39.9■■■■□ 3.98
PRMT5-225ENST00000557415 JPH4Q96JJ6 628 aa39.89■■■■□ 3.98
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