RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556908.5

COCH-210, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 3

Gene COCH, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-210ENST00000556908 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.18■■■■■ 5.3
COCH-210ENST00000556908 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.86■■■■■ 4.45
COCH-210ENST00000556908 ABCC9O60706 1549 aa42.65■■■■■ 4.42
COCH-210ENST00000556908 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.67■■■■■ 4.1
COCH-210ENST00000556908 NACADO15069 1562 aa40.55■■■■■ 4.08
COCH-210ENST00000556908 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.53■■■■■ 4.08
COCH-210ENST00000556908 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.19■■■■■ 4.02
COCH-210ENST00000556908 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
COCH-210ENST00000556908 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.91■■■■□ 3.98
COCH-210ENST00000556908 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.89■■■■□ 3.98
COCH-210ENST00000556908 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.81■■■■□ 3.96
COCH-210ENST00000556908 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.67■■■■□ 3.94
COCH-210ENST00000556908 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.59■■■■□ 3.93
COCH-210ENST00000556908 SCRIBQ14160 1630 aa39.13■■■■□ 3.85
COCH-210ENST00000556908 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.01■■■■□ 3.84
COCH-210ENST00000556908 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
COCH-210ENST00000556908 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.49■■■■□ 3.75
COCH-210ENST00000556908 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.38■■■■□ 3.73
COCH-210ENST00000556908 NCAPD3P42695 1498 aa37.55■■■■□ 3.6
COCH-210ENST00000556908 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.47■■■■□ 3.59
COCH-210ENST00000556908 SMARCA4P51532 1647 aa37.4■■■■□ 3.58
COCH-210ENST00000556908 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
COCH-210ENST00000556908 SMARCA2P51531 1590 aa37.25■■■■□ 3.55
COCH-210ENST00000556908 HMGXB3Q12766 1538 aa37.17■■■■□ 3.54
COCH-210ENST00000556908 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.15■■■■□ 3.54
COCH-210ENST00000556908 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.1■■■■□ 3.53
COCH-210ENST00000556908 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
COCH-210ENST00000556908 NESP48681 1621 aa36.78■■■■□ 3.48
COCH-210ENST00000556908 ERCC6Q03468 1493 aa36.7■■■■□ 3.47
COCH-210ENST00000556908 WIZO95785 1651 aa36.62■■■■□ 3.45
COCH-210ENST00000556908 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
COCH-210ENST00000556908 CUX2O14529 1486 aa36.56■■■■□ 3.44
COCH-210ENST00000556908 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.49■■■■□ 3.43
COCH-210ENST00000556908 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.43■■■■□ 3.42
COCH-210ENST00000556908 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.34■■■■□ 3.41
COCH-210ENST00000556908 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.27■■■■□ 3.4
COCH-210ENST00000556908 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
COCH-210ENST00000556908 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
COCH-210ENST00000556908 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.14■■■■□ 3.38
COCH-210ENST00000556908 CFTRP13569 1480 aa36.07■■■■□ 3.37
COCH-210ENST00000556908 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.96■■■■□ 3.35
COCH-210ENST00000556908 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.93■■■■□ 3.34
COCH-210ENST00000556908 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.9■■■■□ 3.34
COCH-210ENST00000556908 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.87■■■■□ 3.33
COCH-210ENST00000556908 WDR62O43379 1518 aa35.86■■■■□ 3.33
COCH-210ENST00000556908 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
COCH-210ENST00000556908 PRDM2Q13029 1718 aa35.42■■■■□ 3.26
COCH-210ENST00000556908 TOPBP1Q92547 1522 aa35.3■■■■□ 3.24
COCH-210ENST00000556908 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
COCH-210ENST00000556908 ABCC8Q09428 1581 aa35.21■■■■□ 3.23
COCH-210ENST00000556908 IFT140Q96RY7 1462 aa35.19■■■■□ 3.22
COCH-210ENST00000556908 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
COCH-210ENST00000556908 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.13■■■■□ 3.21
COCH-210ENST00000556908 OSCARQ8IYS5 282 aa35.07■■■■□ 3.2
COCH-210ENST00000556908 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
COCH-210ENST00000556908 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
COCH-210ENST00000556908 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.91■■■■□ 3.182e-14■■■□□ 16.3
COCH-210ENST00000556908 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.89■■■■□ 3.18
COCH-210ENST00000556908 SOGA1O94964 1423 aa34.86■■■■□ 3.17
COCH-210ENST00000556908 CUX1P39880 1505 aa34.86■■■■□ 3.17
COCH-210ENST00000556908 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
COCH-210ENST00000556908 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.78■■■■□ 3.16
COCH-210ENST00000556908 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
COCH-210ENST00000556908 TRIM41Q8WV44 630 aa34.72■■■■□ 3.15
COCH-210ENST00000556908 FBLN2P98095 1184 aa34.55■■■■□ 3.12
COCH-210ENST00000556908 WDR97A6NE52 1622 aa34.52■■■■□ 3.12
COCH-210ENST00000556908 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.47■■■■□ 3.11
COCH-210ENST00000556908 GRIN2BQ13224 1484 aa34.46■■■■□ 3.11
COCH-210ENST00000556908 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.45■■■■□ 3.1
COCH-210ENST00000556908 CHD1O14646 1710 aa34.42■■■■□ 3.1
COCH-210ENST00000556908 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.41■■■■□ 3.1
COCH-210ENST00000556908 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.41■■■■□ 3.1
COCH-210ENST00000556908 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.41■■■■□ 3.1
COCH-210ENST00000556908 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
COCH-210ENST00000556908 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.4■■■■□ 3.1
COCH-210ENST00000556908 ARHGEF11O15085 1522 aa34.4■■■■□ 3.1
COCH-210ENST00000556908 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
COCH-210ENST00000556908 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
COCH-210ENST00000556908 TOP2BQ02880 1626 aa34.33■■■■□ 3.09
COCH-210ENST00000556908 SYNJ1O43426 1573 aa34.32■■■■□ 3.09
COCH-210ENST00000556908 SYNJ2O15056 1496 aa34.29■■■■□ 3.08
COCH-210ENST00000556908 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.29■■■■□ 3.08
COCH-210ENST00000556908 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.27■■■■□ 3.08
COCH-210ENST00000556908 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.23■■■■□ 3.07
COCH-210ENST00000556908 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.19■■■■□ 3.06
COCH-210ENST00000556908 PBRM1Q86U86 1689 aa34.16■■■■□ 3.06
COCH-210ENST00000556908 ARAP1Q96P48 1450 aa34.13■■■■□ 3.05
COCH-210ENST00000556908 GRIN2AQ12879 1464 aa34.01■■■■□ 3.03
COCH-210ENST00000556908 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.99■■■■□ 3.03
COCH-210ENST00000556908 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.98■■■■□ 3.03
COCH-210ENST00000556908 ADAMTS12P58397 1594 aa33.96■■■■□ 3.03
COCH-210ENST00000556908 NUP160Q12769 1436 aa33.94■■■■□ 3.02
COCH-210ENST00000556908 CEP170Q5SW79 1584 aa33.85■■■■□ 3.01
COCH-210ENST00000556908 IGF1RP08069 1367 aa33.82■■■■□ 3
COCH-210ENST00000556908 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.73■■■□□ 2.99
COCH-210ENST00000556908 KIF27Q86VH2 1401 aa33.72■■■□□ 2.99
COCH-210ENST00000556908 JPH4Q96JJ6 628 aa33.67■■■□□ 2.98
COCH-210ENST00000556908 SHROOM2Q13796 1616 aa33.64■■■□□ 2.98
COCH-210ENST00000556908 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
COCH-210ENST00000556908 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
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