RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552153.5

LMBR1L-225, Transcript of limb development membrane protein 1 like, human

TSL 4

Gene LMBR1L, Length 549 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMBR1L-225	ENST00000552153	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.72	■■■■■ 4.59
LMBR1L-225	ENST00000552153	ABCC9	O60706	1549 aa		40.1	■■■■■ 4.01
LMBR1L-225	ENST00000552153	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.4	■■■■□ 3.9
LMBR1L-225	ENST00000552153	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		38.3	■■■■□ 3.72
LMBR1L-225	ENST00000552153	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.82	■■■■□ 3.65
LMBR1L-225	ENST00000552153	NACAD	O15069	1562 aa		37.45	■■■■□ 3.59
LMBR1L-225	ENST00000552153	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.27	■■■■□ 3.56
LMBR1L-225	ENST00000552153	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.12	■■■■□ 3.53
LMBR1L-225	ENST00000552153	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.94	■■■■□ 3.5
LMBR1L-225	ENST00000552153	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.85	■■■■□ 3.49
LMBR1L-225	ENST00000552153	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.77	■■■■□ 3.48
LMBR1L-225	ENST00000552153	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.21	■■■■□ 3.39
LMBR1L-225	ENST00000552153	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		36.18	■■■■□ 3.38
LMBR1L-225	ENST00000552153	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.16	■■■■□ 3.38
LMBR1L-225	ENST00000552153	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.1	■■■■□ 3.37
LMBR1L-225	ENST00000552153	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.06	■■■■□ 3.36
LMBR1L-225	ENST00000552153	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.94	■■■■□ 3.34
LMBR1L-225	ENST00000552153	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.89	■■■■□ 3.34
LMBR1L-225	ENST00000552153	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		35.56	■■■■□ 3.28
LMBR1L-225	ENST00000552153	CUX2	O14529	1486 aa		34.79	■■■■□ 3.16
LMBR1L-225	ENST00000552153	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.65	■■■■□ 3.14
LMBR1L-225	ENST00000552153	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.59	■■■■□ 3.13
LMBR1L-225	ENST00000552153	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.45	■■■■□ 3.1
LMBR1L-225	ENST00000552153	NES	P48681	1621 aa		34.3	■■■■□ 3.08
LMBR1L-225	ENST00000552153	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.27	■■■■□ 3.08
LMBR1L-225	ENST00000552153	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.23	■■■■□ 3.07
LMBR1L-225	ENST00000552153	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.19	■■■■□ 3.06
LMBR1L-225	ENST00000552153	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.02	■■■■□ 3.04
LMBR1L-225	ENST00000552153	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.01	■■■■□ 3.04
LMBR1L-225	ENST00000552153	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
LMBR1L-225	ENST00000552153	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.9	■■■■□ 3.02
LMBR1L-225	ENST00000552153	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.88	■■■■□ 3.01
LMBR1L-225	ENST00000552153	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.73	■■■□□ 2.99
LMBR1L-225	ENST00000552153	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.72	■■■□□ 2.99
LMBR1L-225	ENST00000552153	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.69	■■■□□ 2.98
LMBR1L-225	ENST00000552153	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.66	■■■□□ 2.98
LMBR1L-225	ENST00000552153	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.55	■■■□□ 2.96
LMBR1L-225	ENST00000552153	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.48	■■■□□ 2.95
LMBR1L-225	ENST00000552153	WDR62	O43379	1518 aa		33.43	■■■□□ 2.94
LMBR1L-225	ENST00000552153	WIZ	O95785	1651 aa		33.2	■■■□□ 2.91
LMBR1L-225	ENST00000552153	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.2	■■■□□ 2.91
LMBR1L-225	ENST00000552153	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.14	■■■□□ 2.9
LMBR1L-225	ENST00000552153	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.12	■■■□□ 2.89
LMBR1L-225	ENST00000552153	CFTR	P13569	1480 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LMBR1L-225	ENST00000552153	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
LMBR1L-225	ENST00000552153	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
LMBR1L-225	ENST00000552153	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
LMBR1L-225	ENST00000552153	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.72	■■■□□ 2.83
LMBR1L-225	ENST00000552153	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.72	■■■□□ 2.83
LMBR1L-225	ENST00000552153	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.72	■■■□□ 2.83
LMBR1L-225	ENST00000552153	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
LMBR1L-225	ENST00000552153	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.59	■■■□□ 2.81
LMBR1L-225	ENST00000552153	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LMBR1L-225	ENST00000552153	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.48	■■■□□ 2.79
LMBR1L-225	ENST00000552153	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.46	■■■□□ 2.79
LMBR1L-225	ENST00000552153	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.42	■■■□□ 2.78
LMBR1L-225	ENST00000552153	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.4	■■■□□ 2.78
LMBR1L-225	ENST00000552153	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
LMBR1L-225	ENST00000552153	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.28	■■■□□ 2.76
LMBR1L-225	ENST00000552153	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.26	■■■□□ 2.75	8e-9	■■■■■ 58.8
LMBR1L-225	ENST00000552153	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.26	■■■□□ 2.75
LMBR1L-225	ENST00000552153	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.24	■■■□□ 2.75
LMBR1L-225	ENST00000552153	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
LMBR1L-225	ENST00000552153	CHD1	O14646	1710 aa		32.19	■■■□□ 2.74
LMBR1L-225	ENST00000552153	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
LMBR1L-225	ENST00000552153	FBLN2	P98095	1184 aa		32.11	■■■□□ 2.73
LMBR1L-225	ENST00000552153	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
LMBR1L-225	ENST00000552153	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32	■■■□□ 2.71
LMBR1L-225	ENST00000552153	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
LMBR1L-225	ENST00000552153	SOGA1	O94964	1423 aa		31.92	■■■□□ 2.7
LMBR1L-225	ENST00000552153	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.9	■■■□□ 2.7
LMBR1L-225	ENST00000552153	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.88	■■■□□ 2.69
LMBR1L-225	ENST00000552153	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
LMBR1L-225	ENST00000552153	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.78	■■■□□ 2.68
LMBR1L-225	ENST00000552153	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.77	■■■□□ 2.68
LMBR1L-225	ENST00000552153	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
LMBR1L-225	ENST00000552153	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.74	■■■□□ 2.67
LMBR1L-225	ENST00000552153	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.7	■■■□□ 2.66
LMBR1L-225	ENST00000552153	CUX1	P39880	1505 aa		31.68	■■■□□ 2.66
LMBR1L-225	ENST00000552153	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.67	■■■□□ 2.66
LMBR1L-225	ENST00000552153	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
LMBR1L-225	ENST00000552153	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.59	■■■□□ 2.65
LMBR1L-225	ENST00000552153	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.44	■■■□□ 2.62
LMBR1L-225	ENST00000552153	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.4	■■■□□ 2.62
LMBR1L-225	ENST00000552153	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.39	■■■□□ 2.61
LMBR1L-225	ENST00000552153	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.38	■■■□□ 2.61
LMBR1L-225	ENST00000552153	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.3	■■■□□ 2.6
LMBR1L-225	ENST00000552153	NUP160	Q12769	1436 aa		31.26	■■■□□ 2.6
LMBR1L-225	ENST00000552153	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.24	■■■□□ 2.59
LMBR1L-225	ENST00000552153	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.18	■■■□□ 2.58
LMBR1L-225	ENST00000552153	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.14	■■■□□ 2.58
LMBR1L-225	ENST00000552153	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.13	■■■□□ 2.57
LMBR1L-225	ENST00000552153	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LMBR1L-225	ENST00000552153	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		31.02	■■■□□ 2.56
LMBR1L-225	ENST00000552153	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.98	■■■□□ 2.55
LMBR1L-225	ENST00000552153	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.96	■■■□□ 2.55
LMBR1L-225	ENST00000552153	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.95	■■■□□ 2.55
LMBR1L-225	ENST00000552153	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.95	■■■□□ 2.54
LMBR1L-225	ENST00000552153	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.93	■■■□□ 2.54
LMBR1L-225	ENST00000552153	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		30.87	■■■□□ 2.53

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