RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551690.1

PPP1CC-209, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CC, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-209ENST00000551690 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.39■■■■■ 6.3
PPP1CC-209ENST00000551690 ABCC9O60706 1549 aa49.7■■■■■ 5.55
PPP1CC-209ENST00000551690 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.92■■■■■ 5.42
PPP1CC-209ENST00000551690 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.21■■■■■ 5.15
PPP1CC-209ENST00000551690 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.9■■■■■ 5.1
PPP1CC-209ENST00000551690 NACADO15069 1562 aa46.44■■■■■ 5.03
PPP1CC-209ENST00000551690 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.34■■■■■ 5.01
PPP1CC-209ENST00000551690 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.26■■■■■ 5
PPP1CC-209ENST00000551690 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.85■■■■■ 4.93
PPP1CC-209ENST00000551690 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.62■■■■■ 4.89
PPP1CC-209ENST00000551690 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.57■■■■■ 4.88
PPP1CC-209ENST00000551690 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
PPP1CC-209ENST00000551690 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.8■■■■■ 4.76
PPP1CC-209ENST00000551690 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.79■■■■■ 4.76
PPP1CC-209ENST00000551690 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.78■■■■■ 4.76
PPP1CC-209ENST00000551690 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.78■■■■■ 4.76
PPP1CC-209ENST00000551690 SCRIBQ14160 1630 aa44.7■■■■■ 4.75
PPP1CC-209ENST00000551690 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
PPP1CC-209ENST00000551690 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.66■■■■■ 4.58
PPP1CC-209ENST00000551690 NCAPD3P42695 1498 aa42.94■■■■■ 4.46
PPP1CC-209ENST00000551690 CUX2O14529 1486 aa42.93■■■■■ 4.46
PPP1CC-209ENST00000551690 ERCC6Q03468 1493 aa42.89■■■■■ 4.46
PPP1CC-209ENST00000551690 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.76■■■■■ 4.44
PPP1CC-209ENST00000551690 NESP48681 1621 aa42.53■■■■■ 4.4
PPP1CC-209ENST00000551690 SMARCA4P51532 1647 aa42.53■■■■■ 4.4
PPP1CC-209ENST00000551690 SMARCA2P51531 1590 aa42.52■■■■■ 4.4
PPP1CC-209ENST00000551690 HMGXB3Q12766 1538 aa42.51■■■■■ 4.39
PPP1CC-209ENST00000551690 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
PPP1CC-209ENST00000551690 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
PPP1CC-209ENST00000551690 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
PPP1CC-209ENST00000551690 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.06■■■■■ 4.32
PPP1CC-209ENST00000551690 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42■■■■■ 4.31
PPP1CC-209ENST00000551690 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.96■■■■■ 4.31
PPP1CC-209ENST00000551690 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.87■■■■■ 4.29
PPP1CC-209ENST00000551690 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.83■■■■■ 4.29
PPP1CC-209ENST00000551690 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.63■■■■■ 4.26
PPP1CC-209ENST00000551690 TRIM41Q8WV44 630 aa41.61■■■■■ 4.25
PPP1CC-209ENST00000551690 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.51■■■■■ 4.24
PPP1CC-209ENST00000551690 WIZO95785 1651 aa41.4■■■■■ 4.22
PPP1CC-209ENST00000551690 WDR62O43379 1518 aa41.39■■■■■ 4.22
PPP1CC-209ENST00000551690 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.23■■■■■ 4.19
PPP1CC-209ENST00000551690 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.16■■■■■ 4.18
PPP1CC-209ENST00000551690 CFTRP13569 1480 aa41.02■■■■■ 4.16
PPP1CC-209ENST00000551690 OSCARQ8IYS5 282 aa40.97■■■■■ 4.15
PPP1CC-209ENST00000551690 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
PPP1CC-209ENST00000551690 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
PPP1CC-209ENST00000551690 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
PPP1CC-209ENST00000551690 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
PPP1CC-209ENST00000551690 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.45■■■■■ 4.07
PPP1CC-209ENST00000551690 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.45■■■■■ 4.07
PPP1CC-209ENST00000551690 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.45■■■■■ 4.07
PPP1CC-209ENST00000551690 PRDM2Q13029 1718 aa40.42■■■■■ 4.06
PPP1CC-209ENST00000551690 IFT140Q96RY7 1462 aa40.42■■■■■ 4.06
PPP1CC-209ENST00000551690 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.41■■■■■ 4.06
PPP1CC-209ENST00000551690 TOPBP1Q92547 1522 aa40.32■■■■■ 4.04
PPP1CC-209ENST00000551690 ARHGEF11O15085 1522 aa40.28■■■■■ 4.04
PPP1CC-209ENST00000551690 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
PPP1CC-209ENST00000551690 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.13■■■■■ 4.01
PPP1CC-209ENST00000551690 ABCC8Q09428 1581 aa40.1■■■■■ 4.01
PPP1CC-209ENST00000551690 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.016e-6■■■■□ 23.2
PPP1CC-209ENST00000551690 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.07■■■■■ 4.01
PPP1CC-209ENST00000551690 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
PPP1CC-209ENST00000551690 FBLN2P98095 1184 aa39.97■■■■□ 3.99
PPP1CC-209ENST00000551690 CHD1O14646 1710 aa39.96■■■■□ 3.99
PPP1CC-209ENST00000551690 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
PPP1CC-209ENST00000551690 ARAP1Q96P48 1450 aa39.88■■■■□ 3.97
PPP1CC-209ENST00000551690 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
PPP1CC-209ENST00000551690 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.81■■■■□ 3.96
PPP1CC-209ENST00000551690 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
PPP1CC-209ENST00000551690 SOGA1O94964 1423 aa39.71■■■■□ 3.95
PPP1CC-209ENST00000551690 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.6■■■■□ 3.93
PPP1CC-209ENST00000551690 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.56■■■■□ 3.92
PPP1CC-209ENST00000551690 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
PPP1CC-209ENST00000551690 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.5■■■■□ 3.91
PPP1CC-209ENST00000551690 CUX1P39880 1505 aa39.44■■■■□ 3.9
PPP1CC-209ENST00000551690 WDR97A6NE52 1622 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP1CC-209ENST00000551690 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
PPP1CC-209ENST00000551690 SYNJ1O43426 1573 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP1CC-209ENST00000551690 GRIN2BQ13224 1484 aa39.38■■■■□ 3.9
PPP1CC-209ENST00000551690 SYNJ2O15056 1496 aa39.3■■■■□ 3.88
PPP1CC-209ENST00000551690 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.18■■■■□ 3.86
PPP1CC-209ENST00000551690 PBRM1Q86U86 1689 aa39.13■■■■□ 3.86
PPP1CC-209ENST00000551690 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
PPP1CC-209ENST00000551690 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.04■■■■□ 3.84
PPP1CC-209ENST00000551690 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39■■■■□ 3.83
PPP1CC-209ENST00000551690 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.94■■■■□ 3.82
PPP1CC-209ENST00000551690 GRIN2AQ12879 1464 aa38.88■■■■□ 3.81
PPP1CC-209ENST00000551690 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
PPP1CC-209ENST00000551690 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.79■■■■□ 3.8
PPP1CC-209ENST00000551690 CEP170Q5SW79 1584 aa38.78■■■■□ 3.8
PPP1CC-209ENST00000551690 NUP160Q12769 1436 aa38.77■■■■□ 3.8
PPP1CC-209ENST00000551690 ADAMTS12P58397 1594 aa38.76■■■■□ 3.8
PPP1CC-209ENST00000551690 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.65■■■■□ 3.78
PPP1CC-209ENST00000551690 SHROOM2Q13796 1616 aa38.61■■■■□ 3.77
PPP1CC-209ENST00000551690 TOP2BQ02880 1626 aa38.59■■■■□ 3.77
PPP1CC-209ENST00000551690 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.57■■■■□ 3.77
PPP1CC-209ENST00000551690 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.5■■■■□ 3.75
PPP1CC-209ENST00000551690 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
PPP1CC-209ENST00000551690 JPH4Q96JJ6 628 aa38.44■■■■□ 3.74
PPP1CC-209ENST00000551690 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.41■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms