RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550601.5

AC068888.1-204, humanhuman

TSL 3

Gene AC068888.1, Length 711 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC068888.1-204ENST00000550601 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.88■■■■□ 3.17
AC068888.1-204ENST00000550601 ABCC9O60706 1549 aa32.02■■■□□ 2.72
AC068888.1-204ENST00000550601 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.44■■■□□ 2.62
AC068888.1-204ENST00000550601 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.51■■■□□ 2.47
AC068888.1-204ENST00000550601 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.2■■■□□ 2.42
AC068888.1-204ENST00000550601 NACADO15069 1562 aa29.87■■■□□ 2.37
AC068888.1-204ENST00000550601 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.78■■■□□ 2.36
AC068888.1-204ENST00000550601 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.72■■■□□ 2.35
AC068888.1-204ENST00000550601 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.48■■■□□ 2.31
AC068888.1-204ENST00000550601 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.37■■■□□ 2.29
AC068888.1-204ENST00000550601 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.28■■■□□ 2.28
AC068888.1-204ENST00000550601 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.88■■■□□ 2.21
AC068888.1-204ENST00000550601 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.86■■■□□ 2.21
AC068888.1-204ENST00000550601 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.86■■■□□ 2.21
AC068888.1-204ENST00000550601 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
AC068888.1-204ENST00000550601 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.74■■■□□ 2.19
AC068888.1-204ENST00000550601 SCRIBQ14160 1630 aa28.7■■■□□ 2.19
AC068888.1-204ENST00000550601 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
AC068888.1-204ENST00000550601 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.32■■■□□ 2.12
AC068888.1-204ENST00000550601 CUX2O14529 1486 aa27.75■■■□□ 2.03
AC068888.1-204ENST00000550601 ERCC6Q03468 1493 aa27.66■■■□□ 2.02
AC068888.1-204ENST00000550601 NCAPD3P42695 1498 aa27.61■■■□□ 2.01
AC068888.1-204ENST00000550601 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.48■■□□□ 1.99
AC068888.1-204ENST00000550601 NESP48681 1621 aa27.38■■□□□ 1.97
AC068888.1-204ENST00000550601 HMGXB3Q12766 1538 aa27.34■■□□□ 1.97
AC068888.1-204ENST00000550601 SMARCA2P51531 1590 aa27.33■■□□□ 1.97
AC068888.1-204ENST00000550601 SMARCA4P51532 1647 aa27.3■■□□□ 1.96
AC068888.1-204ENST00000550601 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
AC068888.1-204ENST00000550601 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
AC068888.1-204ENST00000550601 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
AC068888.1-204ENST00000550601 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.04■■□□□ 1.92
AC068888.1-204ENST00000550601 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.01■■□□□ 1.92
AC068888.1-204ENST00000550601 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.94■■□□□ 1.9
AC068888.1-204ENST00000550601 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.93■■□□□ 1.9
AC068888.1-204ENST00000550601 TRIM41Q8WV44 630 aa26.93■■□□□ 1.9
AC068888.1-204ENST00000550601 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.89■■□□□ 1.9
AC068888.1-204ENST00000550601 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.77■■□□□ 1.88
AC068888.1-204ENST00000550601 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.74■■□□□ 1.87
AC068888.1-204ENST00000550601 WDR62O43379 1518 aa26.67■■□□□ 1.86
AC068888.1-204ENST00000550601 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.53■■□□□ 1.84
AC068888.1-204ENST00000550601 WIZO95785 1651 aa26.53■■□□□ 1.84
AC068888.1-204ENST00000550601 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.47■■□□□ 1.83
AC068888.1-204ENST00000550601 OSCARQ8IYS5 282 aa26.43■■□□□ 1.82
AC068888.1-204ENST00000550601 CFTRP13569 1480 aa26.35■■□□□ 1.81
AC068888.1-204ENST00000550601 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
AC068888.1-204ENST00000550601 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
AC068888.1-204ENST00000550601 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
AC068888.1-204ENST00000550601 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.12■■□□□ 1.77
AC068888.1-204ENST00000550601 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.12■■□□□ 1.77
AC068888.1-204ENST00000550601 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.12■■□□□ 1.77
AC068888.1-204ENST00000550601 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
AC068888.1-204ENST00000550601 IFT140Q96RY7 1462 aa26.01■■□□□ 1.75
AC068888.1-204ENST00000550601 ARHGEF11O15085 1522 aa26■■□□□ 1.75
AC068888.1-204ENST00000550601 PRDM2Q13029 1718 aa25.94■■□□□ 1.74
AC068888.1-204ENST00000550601 TOPBP1Q92547 1522 aa25.91■■□□□ 1.74
AC068888.1-204ENST00000550601 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.89■■□□□ 1.73
AC068888.1-204ENST00000550601 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.88■■□□□ 1.73
AC068888.1-204ENST00000550601 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
AC068888.1-204ENST00000550601 ABCC8Q09428 1581 aa25.77■■□□□ 1.72
AC068888.1-204ENST00000550601 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
AC068888.1-204ENST00000550601 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
AC068888.1-204ENST00000550601 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.74■■□□□ 1.71
AC068888.1-204ENST00000550601 ARAP1Q96P48 1450 aa25.73■■□□□ 1.71
AC068888.1-204ENST00000550601 CHD1O14646 1710 aa25.71■■□□□ 1.71
AC068888.1-204ENST00000550601 FBLN2P98095 1184 aa25.7■■□□□ 1.7
AC068888.1-204ENST00000550601 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
AC068888.1-204ENST00000550601 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
AC068888.1-204ENST00000550601 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.56■■□□□ 1.68
AC068888.1-204ENST00000550601 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
AC068888.1-204ENST00000550601 SOGA1O94964 1423 aa25.5■■□□□ 1.67
AC068888.1-204ENST00000550601 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.47■■□□□ 1.67
AC068888.1-204ENST00000550601 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.44■■□□□ 1.66
AC068888.1-204ENST00000550601 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
AC068888.1-204ENST00000550601 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.39■■□□□ 1.65
AC068888.1-204ENST00000550601 SYNJ1O43426 1573 aa25.36■■□□□ 1.65
AC068888.1-204ENST00000550601 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
AC068888.1-204ENST00000550601 WDR97A6NE52 1622 aa25.34■■□□□ 1.65
AC068888.1-204ENST00000550601 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
AC068888.1-204ENST00000550601 GRIN2BQ13224 1484 aa25.32■■□□□ 1.64
AC068888.1-204ENST00000550601 CUX1P39880 1505 aa25.29■■□□□ 1.64
AC068888.1-204ENST00000550601 SYNJ2O15056 1496 aa25.28■■□□□ 1.64
AC068888.1-204ENST00000550601 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.22■■□□□ 1.63
AC068888.1-204ENST00000550601 PBRM1Q86U86 1689 aa25.13■■□□□ 1.61
AC068888.1-204ENST00000550601 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.06■■□□□ 1.6
AC068888.1-204ENST00000550601 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.05■■□□□ 1.6
AC068888.1-204ENST00000550601 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.04■■□□□ 1.6
AC068888.1-204ENST00000550601 GRIN2AQ12879 1464 aa24.99■■□□□ 1.59
AC068888.1-204ENST00000550601 CEP170Q5SW79 1584 aa24.94■■□□□ 1.58
AC068888.1-204ENST00000550601 NUP160Q12769 1436 aa24.93■■□□□ 1.58
AC068888.1-204ENST00000550601 ADAMTS12P58397 1594 aa24.91■■□□□ 1.58
AC068888.1-204ENST00000550601 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
AC068888.1-204ENST00000550601 SHROOM2Q13796 1616 aa24.84■■□□□ 1.57
AC068888.1-204ENST00000550601 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.83■■□□□ 1.57
AC068888.1-204ENST00000550601 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.75■■□□□ 1.55
AC068888.1-204ENST00000550601 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
AC068888.1-204ENST00000550601 TOP2BQ02880 1626 aa24.72■■□□□ 1.55
AC068888.1-204ENST00000550601 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.71■■□□□ 1.55
AC068888.1-204ENST00000550601 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.71■■□□□ 1.55
AC068888.1-204ENST00000550601 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
AC068888.1-204ENST00000550601 JPH4Q96JJ6 628 aa24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms