RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548822.5

VEZT-218, Transcript of vezatin, adherens junctions transmembrane protein, humanhuman

TSL 4

Gene VEZT, Length 595 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEZT-218ENST00000548822 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.51■■■□□ 2.32
VEZT-218ENST00000548822 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.3■■□□□ 1.8
VEZT-218ENST00000548822 ABCC9O60706 1549 aa25.92■■□□□ 1.74
VEZT-218ENST00000548822 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.93■■□□□ 1.58
VEZT-218ENST00000548822 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.84■■□□□ 1.57
VEZT-218ENST00000548822 NACADO15069 1562 aa24.75■■□□□ 1.55
VEZT-218ENST00000548822 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
VEZT-218ENST00000548822 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.47■■□□□ 1.51
VEZT-218ENST00000548822 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.35■■□□□ 1.49
VEZT-218ENST00000548822 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.32■■□□□ 1.48
VEZT-218ENST00000548822 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
VEZT-218ENST00000548822 SCRIBQ14160 1630 aa24.06■■□□□ 1.44
VEZT-218ENST00000548822 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.03■■□□□ 1.44
VEZT-218ENST00000548822 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.83■■□□□ 1.41
VEZT-218ENST00000548822 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.72■■□□□ 1.39
VEZT-218ENST00000548822 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
VEZT-218ENST00000548822 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.41■■□□□ 1.34
VEZT-218ENST00000548822 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.27■■□□□ 1.32
VEZT-218ENST00000548822 SMARCA4P51532 1647 aa22.95■■□□□ 1.26
VEZT-218ENST00000548822 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
VEZT-218ENST00000548822 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.83■■□□□ 1.25
VEZT-218ENST00000548822 SMARCA2P51531 1590 aa22.82■■□□□ 1.24
VEZT-218ENST00000548822 NCAPD3P42695 1498 aa22.8■■□□□ 1.24
VEZT-218ENST00000548822 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.76■■□□□ 1.23
VEZT-218ENST00000548822 HMGXB3Q12766 1538 aa22.69■■□□□ 1.22
VEZT-218ENST00000548822 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VEZT-218ENST00000548822 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.65■■□□□ 1.22
VEZT-218ENST00000548822 WIZO95785 1651 aa22.56■■□□□ 1.2
VEZT-218ENST00000548822 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
VEZT-218ENST00000548822 ERCC6Q03468 1493 aa22.38■■□□□ 1.17
VEZT-218ENST00000548822 NESP48681 1621 aa22.37■■□□□ 1.17
VEZT-218ENST00000548822 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.27■■□□□ 1.16
VEZT-218ENST00000548822 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
VEZT-218ENST00000548822 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.17■■□□□ 1.14
VEZT-218ENST00000548822 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.14■■□□□ 1.14
VEZT-218ENST00000548822 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.14■■□□□ 1.13
VEZT-218ENST00000548822 CUX2O14529 1486 aa22.09■■□□□ 1.13
VEZT-218ENST00000548822 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
VEZT-218ENST00000548822 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.01■■□□□ 1.11
VEZT-218ENST00000548822 CFTRP13569 1480 aa21.99■■□□□ 1.11
VEZT-218ENST00000548822 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
VEZT-218ENST00000548822 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.95■■□□□ 1.1
VEZT-218ENST00000548822 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.95■■□□□ 1.1
VEZT-218ENST00000548822 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.91■■□□□ 1.1
VEZT-218ENST00000548822 PRDM2Q13029 1718 aa21.91■■□□□ 1.1
VEZT-218ENST00000548822 WDR62O43379 1518 aa21.8■■□□□ 1.08
VEZT-218ENST00000548822 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
VEZT-218ENST00000548822 TOPBP1Q92547 1522 aa21.57■■□□□ 1.04
VEZT-218ENST00000548822 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.57■■□□□ 1.04
VEZT-218ENST00000548822 ABCC8Q09428 1581 aa21.57■■□□□ 1.04
VEZT-218ENST00000548822 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.54■■□□□ 1.04
VEZT-218ENST00000548822 IFT140Q96RY7 1462 aa21.45■■□□□ 1.03
VEZT-218ENST00000548822 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
VEZT-218ENST00000548822 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
VEZT-218ENST00000548822 CUX1P39880 1505 aa21.35■■□□□ 1.01
VEZT-218ENST00000548822 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
VEZT-218ENST00000548822 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.32■■□□□ 1
VEZT-218ENST00000548822 SOGA1O94964 1423 aa21.32■■□□□ 1
VEZT-218ENST00000548822 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.32■■□□□ 1
VEZT-218ENST00000548822 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
VEZT-218ENST00000548822 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 17e-6■■□□□ 13.5
VEZT-218ENST00000548822 OSCARQ8IYS5 282 aa21.23■□□□□ 0.99
VEZT-218ENST00000548822 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
VEZT-218ENST00000548822 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
VEZT-218ENST00000548822 FBLN2P98095 1184 aa21.16■□□□□ 0.98
VEZT-218ENST00000548822 TOP2BQ02880 1626 aa21.15■□□□□ 0.98
VEZT-218ENST00000548822 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.15■□□□□ 0.98
VEZT-218ENST00000548822 SYNJ1O43426 1573 aa21.15■□□□□ 0.98
VEZT-218ENST00000548822 WDR97A6NE52 1622 aa21.13■□□□□ 0.97
VEZT-218ENST00000548822 CHD1O14646 1710 aa21.12■□□□□ 0.97
VEZT-218ENST00000548822 PBRM1Q86U86 1689 aa21.07■□□□□ 0.96
VEZT-218ENST00000548822 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.07■□□□□ 0.96
VEZT-218ENST00000548822 GRIN2BQ13224 1484 aa21.07■□□□□ 0.96
VEZT-218ENST00000548822 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.07■□□□□ 0.96
VEZT-218ENST00000548822 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.07■□□□□ 0.96
VEZT-218ENST00000548822 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
VEZT-218ENST00000548822 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21■□□□□ 0.95
VEZT-218ENST00000548822 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
VEZT-218ENST00000548822 TRIM41Q8WV44 630 aa20.96■□□□□ 0.95
VEZT-218ENST00000548822 SYNJ2O15056 1496 aa20.93■□□□□ 0.94
VEZT-218ENST00000548822 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.88■□□□□ 0.93
VEZT-218ENST00000548822 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.88■□□□□ 0.93
VEZT-218ENST00000548822 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.88■□□□□ 0.93
VEZT-218ENST00000548822 ARHGEF11O15085 1522 aa20.84■□□□□ 0.93
VEZT-218ENST00000548822 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.83■□□□□ 0.93
VEZT-218ENST00000548822 ADAMTS12P58397 1594 aa20.83■□□□□ 0.92
VEZT-218ENST00000548822 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.79■□□□□ 0.92
VEZT-218ENST00000548822 GRIN2AQ12879 1464 aa20.78■□□□□ 0.92
VEZT-218ENST00000548822 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.78■□□□□ 0.92
VEZT-218ENST00000548822 KIF27Q86VH2 1401 aa20.78■□□□□ 0.92
VEZT-218ENST00000548822 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.73■□□□□ 0.91
VEZT-218ENST00000548822 CEP170Q5SW79 1584 aa20.68■□□□□ 0.9
VEZT-218ENST00000548822 IGF1RP08069 1367 aa20.67■□□□□ 0.9
VEZT-218ENST00000548822 CUL7Q14999 1698 aa20.66■□□□□ 0.9
VEZT-218ENST00000548822 ARAP1Q96P48 1450 aa20.65■□□□□ 0.9
VEZT-218ENST00000548822 NUP160Q12769 1436 aa20.65■□□□□ 0.9
VEZT-218ENST00000548822 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.59■□□□□ 0.89
VEZT-218ENST00000548822 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.56■□□□□ 0.88
VEZT-218ENST00000548822 JPH4Q96JJ6 628 aa20.53■□□□□ 0.88
VEZT-218ENST00000548822 SHROOM2Q13796 1616 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms