RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547356.1

SMARCC2-204, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 2, humanhuman

TSL 2

Gene SMARCC2, Length 741 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC2-204ENST00000547356 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.2■■■■■ 6.75
SMARCC2-204ENST00000547356 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.87■■■■■ 5.73
SMARCC2-204ENST00000547356 ABCC9O60706 1549 aa50.17■■■■■ 5.62
SMARCC2-204ENST00000547356 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.01■■■■■ 5.28
SMARCC2-204ENST00000547356 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.98■■■■■ 5.27
SMARCC2-204ENST00000547356 NACADO15069 1562 aa47.89■■■■■ 5.26
SMARCC2-204ENST00000547356 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.6■■■■■ 5.21
SMARCC2-204ENST00000547356 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.46■■■■■ 5.19
SMARCC2-204ENST00000547356 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.21■■■■■ 5.15
SMARCC2-204ENST00000547356 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.99■■■■■ 5.11
SMARCC2-204ENST00000547356 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.88■■■■■ 5.1
SMARCC2-204ENST00000547356 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.67■■■■■ 5.06
SMARCC2-204ENST00000547356 SCRIBQ14160 1630 aa46.56■■■■■ 5.04
SMARCC2-204ENST00000547356 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.31■■■■■ 5
SMARCC2-204ENST00000547356 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.96■■■■■ 4.95
SMARCC2-204ENST00000547356 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
SMARCC2-204ENST00000547356 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.31■■■■■ 4.84
SMARCC2-204ENST00000547356 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.04■■■■■ 4.8
SMARCC2-204ENST00000547356 SMARCA4P51532 1647 aa44.44■■■■■ 4.7
SMARCC2-204ENST00000547356 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
SMARCC2-204ENST00000547356 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.27■■■■■ 4.68
SMARCC2-204ENST00000547356 NCAPD3P42695 1498 aa44.22■■■■■ 4.67
SMARCC2-204ENST00000547356 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.15■■■■■ 4.66
SMARCC2-204ENST00000547356 SMARCA2P51531 1590 aa44.13■■■■■ 4.65
SMARCC2-204ENST00000547356 HMGXB3Q12766 1538 aa43.97■■■■■ 4.63
SMARCC2-204ENST00000547356 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.94■■■■■ 4.62
SMARCC2-204ENST00000547356 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
SMARCC2-204ENST00000547356 WIZO95785 1651 aa43.65■■■■■ 4.58
SMARCC2-204ENST00000547356 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
SMARCC2-204ENST00000547356 NESP48681 1621 aa43.37■■■■■ 4.53
SMARCC2-204ENST00000547356 ERCC6Q03468 1493 aa43.19■■■■■ 4.51
SMARCC2-204ENST00000547356 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
SMARCC2-204ENST00000547356 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.07■■■■■ 4.48
SMARCC2-204ENST00000547356 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.94■■■■■ 4.46
SMARCC2-204ENST00000547356 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.8■■■■■ 4.44
SMARCC2-204ENST00000547356 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.78■■■■■ 4.44
SMARCC2-204ENST00000547356 CUX2O14529 1486 aa42.74■■■■■ 4.43
SMARCC2-204ENST00000547356 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
SMARCC2-204ENST00000547356 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.65■■■■■ 4.42
SMARCC2-204ENST00000547356 CFTRP13569 1480 aa42.64■■■■■ 4.42
SMARCC2-204ENST00000547356 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.49■■■■■ 4.39
SMARCC2-204ENST00000547356 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.43■■■■■ 4.38
SMARCC2-204ENST00000547356 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.43■■■■■ 4.38
SMARCC2-204ENST00000547356 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
SMARCC2-204ENST00000547356 WDR62O43379 1518 aa42.28■■■■■ 4.36
SMARCC2-204ENST00000547356 PRDM2Q13029 1718 aa42.24■■■■■ 4.35
SMARCC2-204ENST00000547356 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
SMARCC2-204ENST00000547356 TOPBP1Q92547 1522 aa41.79■■■■■ 4.28
SMARCC2-204ENST00000547356 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.75■■■■■ 4.27
SMARCC2-204ENST00000547356 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.68■■■■■ 4.26
SMARCC2-204ENST00000547356 ABCC8Q09428 1581 aa41.63■■■■■ 4.26
SMARCC2-204ENST00000547356 IFT140Q96RY7 1462 aa41.53■■■■■ 4.24
SMARCC2-204ENST00000547356 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
SMARCC2-204ENST00000547356 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
SMARCC2-204ENST00000547356 CUX1P39880 1505 aa41.42■■■■■ 4.22
SMARCC2-204ENST00000547356 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
SMARCC2-204ENST00000547356 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.31■■■■■ 4.2
SMARCC2-204ENST00000547356 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.3■■■■■ 4.2
SMARCC2-204ENST00000547356 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
SMARCC2-204ENST00000547356 SOGA1O94964 1423 aa41.23■■■■■ 4.19
SMARCC2-204ENST00000547356 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.2■■■■■ 4.197e-7■■■■■ 29.8
SMARCC2-204ENST00000547356 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
SMARCC2-204ENST00000547356 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.02■■■■■ 4.16
SMARCC2-204ENST00000547356 SYNJ1O43426 1573 aa40.99■■■■■ 4.15
SMARCC2-204ENST00000547356 OSCARQ8IYS5 282 aa40.96■■■■■ 4.15
SMARCC2-204ENST00000547356 WDR97A6NE52 1622 aa40.93■■■■■ 4.14
SMARCC2-204ENST00000547356 TOP2BQ02880 1626 aa40.93■■■■■ 4.14
SMARCC2-204ENST00000547356 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.93■■■■■ 4.14
SMARCC2-204ENST00000547356 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.83■■■■■ 4.13
SMARCC2-204ENST00000547356 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.79■■■■■ 4.12
SMARCC2-204ENST00000547356 CHD1O14646 1710 aa40.76■■■■■ 4.12
SMARCC2-204ENST00000547356 GRIN2BQ13224 1484 aa40.75■■■■■ 4.11
SMARCC2-204ENST00000547356 FBLN2P98095 1184 aa40.74■■■■■ 4.11
SMARCC2-204ENST00000547356 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.74■■■■■ 4.11
SMARCC2-204ENST00000547356 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.71■■■■■ 4.11
SMARCC2-204ENST00000547356 PBRM1Q86U86 1689 aa40.67■■■■■ 4.1
SMARCC2-204ENST00000547356 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
SMARCC2-204ENST00000547356 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
SMARCC2-204ENST00000547356 SYNJ2O15056 1496 aa40.51■■■■■ 4.08
SMARCC2-204ENST00000547356 TRIM41Q8WV44 630 aa40.4■■■■■ 4.06
SMARCC2-204ENST00000547356 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.39■■■■■ 4.06
SMARCC2-204ENST00000547356 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.39■■■■■ 4.06
SMARCC2-204ENST00000547356 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.39■■■■■ 4.06
SMARCC2-204ENST00000547356 ARHGEF11O15085 1522 aa40.36■■■■■ 4.05
SMARCC2-204ENST00000547356 ADAMTS12P58397 1594 aa40.35■■■■■ 4.05
SMARCC2-204ENST00000547356 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.31■■■■■ 4.04
SMARCC2-204ENST00000547356 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.31■■■■■ 4.04
SMARCC2-204ENST00000547356 GRIN2AQ12879 1464 aa40.25■■■■■ 4.03
SMARCC2-204ENST00000547356 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.25■■■■■ 4.03
SMARCC2-204ENST00000547356 KIF27Q86VH2 1401 aa40.16■■■■■ 4.02
SMARCC2-204ENST00000547356 CEP170Q5SW79 1584 aa40.1■■■■■ 4.01
SMARCC2-204ENST00000547356 NUP160Q12769 1436 aa40.08■■■■■ 4.01
SMARCC2-204ENST00000547356 IGF1RP08069 1367 aa40.06■■■■■ 4
SMARCC2-204ENST00000547356 ARAP1Q96P48 1450 aa40.05■■■■■ 4
SMARCC2-204ENST00000547356 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.03■■■■■ 4
SMARCC2-204ENST00000547356 CUL7Q14999 1698 aa39.89■■■■□ 3.98
SMARCC2-204ENST00000547356 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.87■■■■□ 3.97
SMARCC2-204ENST00000547356 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.84■■■■□ 3.97
SMARCC2-204ENST00000547356 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.81■■■■□ 3.96
SMARCC2-204ENST00000547356 SHROOM2Q13796 1616 aa39.77■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms