RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544888.5

PHB2-210, Transcript of prohibitin 2, humanhuman

TSL 3

Gene PHB2, Length 872 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHB2-210ENST00000544888 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.51■■■■■ 5.36
PHB2-210ENST00000544888 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.5■■■■■ 4.55
PHB2-210ENST00000544888 ABCC9O60706 1549 aa43.36■■■■■ 4.53
PHB2-210ENST00000544888 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.3■■■■■ 4.2
PHB2-210ENST00000544888 NACADO15069 1562 aa41.05■■■■■ 4.16
PHB2-210ENST00000544888 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.79■■■■■ 4.12
PHB2-210ENST00000544888 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.6■■■■■ 4.09
PHB2-210ENST00000544888 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.54■■■■■ 4.08
PHB2-210ENST00000544888 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.49■■■■■ 4.07
PHB2-210ENST00000544888 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.36■■■■■ 4.05
PHB2-210ENST00000544888 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
PHB2-210ENST00000544888 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.18■■■■■ 4.02
PHB2-210ENST00000544888 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.06■■■■■ 4
PHB2-210ENST00000544888 SCRIBQ14160 1630 aa39.63■■■■□ 3.93
PHB2-210ENST00000544888 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.56■■■■□ 3.92
PHB2-210ENST00000544888 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.19■■■■□ 3.86
PHB2-210ENST00000544888 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
PHB2-210ENST00000544888 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.03■■■■□ 3.84
PHB2-210ENST00000544888 NCAPD3P42695 1498 aa37.9■■■■□ 3.66
PHB2-210ENST00000544888 SMARCA4P51532 1647 aa37.83■■■■□ 3.65
PHB2-210ENST00000544888 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.82■■■■□ 3.64
PHB2-210ENST00000544888 SMARCA2P51531 1590 aa37.7■■■■□ 3.63
PHB2-210ENST00000544888 HMGXB3Q12766 1538 aa37.65■■■■□ 3.62
PHB2-210ENST00000544888 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
PHB2-210ENST00000544888 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.46■■■■□ 3.59
PHB2-210ENST00000544888 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
PHB2-210ENST00000544888 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.41■■■■□ 3.58
PHB2-210ENST00000544888 ERCC6Q03468 1493 aa37.37■■■■□ 3.57
PHB2-210ENST00000544888 NESP48681 1621 aa37.31■■■■□ 3.56
PHB2-210ENST00000544888 CUX2O14529 1486 aa37.28■■■■□ 3.56
PHB2-210ENST00000544888 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.13■■■■□ 3.53
PHB2-210ENST00000544888 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.03■■■■□ 3.52
PHB2-210ENST00000544888 WIZO95785 1651 aa36.97■■■■□ 3.51
PHB2-210ENST00000544888 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
PHB2-210ENST00000544888 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.86■■■■□ 3.49
PHB2-210ENST00000544888 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.76■■■■□ 3.47
PHB2-210ENST00000544888 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.73■■■■□ 3.47
PHB2-210ENST00000544888 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
PHB2-210ENST00000544888 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.48■■■■□ 3.43
PHB2-210ENST00000544888 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
PHB2-210ENST00000544888 WDR62O43379 1518 aa36.41■■■■□ 3.42
PHB2-210ENST00000544888 CFTRP13569 1480 aa36.37■■■■□ 3.41
PHB2-210ENST00000544888 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.35■■■■□ 3.41
PHB2-210ENST00000544888 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.33■■■■□ 3.41
PHB2-210ENST00000544888 PRDM2Q13029 1718 aa36.08■■■■□ 3.37
PHB2-210ENST00000544888 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
PHB2-210ENST00000544888 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.06■■■■□ 3.36
PHB2-210ENST00000544888 TOPBP1Q92547 1522 aa35.68■■■■□ 3.3
PHB2-210ENST00000544888 IFT140Q96RY7 1462 aa35.61■■■■□ 3.29
PHB2-210ENST00000544888 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
PHB2-210ENST00000544888 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.56■■■■□ 3.28
PHB2-210ENST00000544888 OSCARQ8IYS5 282 aa35.56■■■■□ 3.28
PHB2-210ENST00000544888 ABCC8Q09428 1581 aa35.55■■■■□ 3.28
PHB2-210ENST00000544888 TRIM41Q8WV44 630 aa35.52■■■■□ 3.28
PHB2-210ENST00000544888 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
PHB2-210ENST00000544888 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
PHB2-210ENST00000544888 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
PHB2-210ENST00000544888 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.27■■■■□ 3.242e-8■■■■■ 37.1
PHB2-210ENST00000544888 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.2■■■■□ 3.23
PHB2-210ENST00000544888 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.18■■■■□ 3.22
PHB2-210ENST00000544888 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.18■■■■□ 3.22
PHB2-210ENST00000544888 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.18■■■■□ 3.22
PHB2-210ENST00000544888 CHD1O14646 1710 aa35.15■■■■□ 3.22
PHB2-210ENST00000544888 SOGA1O94964 1423 aa35.13■■■■□ 3.21
PHB2-210ENST00000544888 CUX1P39880 1505 aa35.12■■■■□ 3.21
PHB2-210ENST00000544888 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.12■■■■□ 3.21
PHB2-210ENST00000544888 ARHGEF11O15085 1522 aa35.06■■■■□ 3.2
PHB2-210ENST00000544888 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PHB2-210ENST00000544888 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
PHB2-210ENST00000544888 WDR97A6NE52 1622 aa34.98■■■■□ 3.19
PHB2-210ENST00000544888 FBLN2P98095 1184 aa34.94■■■■□ 3.18
PHB2-210ENST00000544888 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.9■■■■□ 3.18
PHB2-210ENST00000544888 GRIN2BQ13224 1484 aa34.81■■■■□ 3.16
PHB2-210ENST00000544888 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
PHB2-210ENST00000544888 PBRM1Q86U86 1689 aa34.75■■■■□ 3.15
PHB2-210ENST00000544888 ARAP1Q96P48 1450 aa34.74■■■■□ 3.15
PHB2-210ENST00000544888 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.74■■■■□ 3.15
PHB2-210ENST00000544888 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.73■■■■□ 3.15
PHB2-210ENST00000544888 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.72■■■■□ 3.15
PHB2-210ENST00000544888 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.71■■■■□ 3.15
PHB2-210ENST00000544888 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.7■■■■□ 3.15
PHB2-210ENST00000544888 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
PHB2-210ENST00000544888 SYNJ2O15056 1496 aa34.7■■■■□ 3.15
PHB2-210ENST00000544888 SYNJ1O43426 1573 aa34.67■■■■□ 3.14
PHB2-210ENST00000544888 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.61■■■■□ 3.13
PHB2-210ENST00000544888 TOP2BQ02880 1626 aa34.59■■■■□ 3.13
PHB2-210ENST00000544888 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.56■■■■□ 3.12
PHB2-210ENST00000544888 ADAMTS12P58397 1594 aa34.41■■■■□ 3.1
PHB2-210ENST00000544888 GRIN2AQ12879 1464 aa34.39■■■■□ 3.1
PHB2-210ENST00000544888 CEP170Q5SW79 1584 aa34.3■■■■□ 3.08
PHB2-210ENST00000544888 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
PHB2-210ENST00000544888 NUP160Q12769 1436 aa34.28■■■■□ 3.08
PHB2-210ENST00000544888 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.27■■■■□ 3.08
PHB2-210ENST00000544888 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.27■■■■□ 3.08
PHB2-210ENST00000544888 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.23■■■■□ 3.07
PHB2-210ENST00000544888 SHROOM2Q13796 1616 aa34.15■■■■□ 3.06
PHB2-210ENST00000544888 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.94■■■■□ 3.02
PHB2-210ENST00000544888 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
PHB2-210ENST00000544888 JPH4Q96JJ6 628 aa33.87■■■■□ 3.01
PHB2-210ENST00000544888 IGF1RP08069 1367 aa33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.6 ms