RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541260.5

CCDC189-204, Transcript of coiled-coil domain containing 189, human

TSL 5 BASIC

Gene CCDC189, Length 1,531 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC189-204	ENST00000541260	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CCDC189-204	ENST00000541260	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.82	■■■■□ 3.33
CCDC189-204	ENST00000541260	ABCC9	O60706	1549 aa		34.7	■■■■□ 3.15
CCDC189-204	ENST00000541260	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
CCDC189-204	ENST00000541260	NACAD	O15069	1562 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCDC189-204	ENST00000541260	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCDC189-204	ENST00000541260	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CCDC189-204	ENST00000541260	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CCDC189-204	ENST00000541260	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CCDC189-204	ENST00000541260	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CCDC189-204	ENST00000541260	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CCDC189-204	ENST00000541260	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CCDC189-204	ENST00000541260	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.49	■■■□□ 2.79
CCDC189-204	ENST00000541260	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CCDC189-204	ENST00000541260	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
CCDC189-204	ENST00000541260	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.57	■■■□□ 2.64
CCDC189-204	ENST00000541260	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CCDC189-204	ENST00000541260	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CCDC189-204	ENST00000541260	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
CCDC189-204	ENST00000541260	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.32	■■■□□ 2.6
CCDC189-204	ENST00000541260	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CCDC189-204	ENST00000541260	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.09	■■■□□ 2.57
CCDC189-204	ENST00000541260	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CCDC189-204	ENST00000541260	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.06	■■■□□ 2.56
CCDC189-204	ENST00000541260	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CCDC189-204	ENST00000541260	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.98	■■■□□ 2.55
CCDC189-204	ENST00000541260	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.9	■■■□□ 2.54
CCDC189-204	ENST00000541260	WIZ	O95785	1651 aa		30.83	■■■□□ 2.53
CCDC189-204	ENST00000541260	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.83	■■■□□ 2.53
CCDC189-204	ENST00000541260	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.57	■■■□□ 2.48
CCDC189-204	ENST00000541260	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.39	■■■□□ 2.46
CCDC189-204	ENST00000541260	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.21	■■■□□ 2.43
CCDC189-204	ENST00000541260	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.15	■■■□□ 2.42
CCDC189-204	ENST00000541260	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.15	■■■□□ 2.42
CCDC189-204	ENST00000541260	NES	P48681	1621 aa		30.13	■■■□□ 2.41
CCDC189-204	ENST00000541260	CFTR	P13569	1480 aa		30.05	■■■□□ 2.4
CCDC189-204	ENST00000541260	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.94	■■■□□ 2.38
CCDC189-204	ENST00000541260	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CCDC189-204	ENST00000541260	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.78	■■■□□ 2.36
CCDC189-204	ENST00000541260	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CCDC189-204	ENST00000541260	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CCDC189-204	ENST00000541260	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.7	■■■□□ 2.34
CCDC189-204	ENST00000541260	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.6	■■■□□ 2.33
CCDC189-204	ENST00000541260	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CCDC189-204	ENST00000541260	CUX2	O14529	1486 aa		29.49	■■■□□ 2.31
CCDC189-204	ENST00000541260	WDR62	O43379	1518 aa		29.49	■■■□□ 2.31
CCDC189-204	ENST00000541260	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.3
CCDC189-204	ENST00000541260	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.39	■■■□□ 2.3
CCDC189-204	ENST00000541260	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.34	■■■□□ 2.29
CCDC189-204	ENST00000541260	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.33	■■■□□ 2.29
CCDC189-204	ENST00000541260	CUX1	P39880	1505 aa		29.23	■■■□□ 2.27
CCDC189-204	ENST00000541260	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.2	■■■□□ 2.26
CCDC189-204	ENST00000541260	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
CCDC189-204	ENST00000541260	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCDC189-204	ENST00000541260	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCDC189-204	ENST00000541260	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCDC189-204	ENST00000541260	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CCDC189-204	ENST00000541260	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CCDC189-204	ENST00000541260	SOGA1	O94964	1423 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CCDC189-204	ENST00000541260	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CCDC189-204	ENST00000541260	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.97	■■■□□ 2.23
CCDC189-204	ENST00000541260	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
CCDC189-204	ENST00000541260	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CCDC189-204	ENST00000541260	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CCDC189-204	ENST00000541260	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CCDC189-204	ENST00000541260	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.79	■■■□□ 2.2	3e-6	■■■■□ 22.9
CCDC189-204	ENST00000541260	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
CCDC189-204	ENST00000541260	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CCDC189-204	ENST00000541260	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CCDC189-204	ENST00000541260	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CCDC189-204	ENST00000541260	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CCDC189-204	ENST00000541260	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCDC189-204	ENST00000541260	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CCDC189-204	ENST00000541260	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CCDC189-204	ENST00000541260	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
CCDC189-204	ENST00000541260	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CCDC189-204	ENST00000541260	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CCDC189-204	ENST00000541260	IGF1R	P08069	1367 aa		28.42	■■■□□ 2.14
CCDC189-204	ENST00000541260	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.4	■■■□□ 2.14
CCDC189-204	ENST00000541260	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.37	■■■□□ 2.13
CCDC189-204	ENST00000541260	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
CCDC189-204	ENST00000541260	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.37	■■■□□ 2.13
CCDC189-204	ENST00000541260	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.36	■■■□□ 2.13
CCDC189-204	ENST00000541260	FBLN2	P98095	1184 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CCDC189-204	ENST00000541260	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CCDC189-204	ENST00000541260	CHD1	O14646	1710 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CCDC189-204	ENST00000541260	CUL7	Q14999	1698 aa		28.28	■■■□□ 2.12
CCDC189-204	ENST00000541260	EEA1	Q15075	1411 aa		28.26	■■■□□ 2.11
CCDC189-204	ENST00000541260	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.26	■■■□□ 2.11
CCDC189-204	ENST00000541260	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.24	■■■□□ 2.11
CCDC189-204	ENST00000541260	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		28.2	■■■□□ 2.1
CCDC189-204	ENST00000541260	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.17	■■■□□ 2.1
CCDC189-204	ENST00000541260	NUP160	Q12769	1436 aa		28.14	■■■□□ 2.1
CCDC189-204	ENST00000541260	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CCDC189-204	ENST00000541260	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CCDC189-204	ENST00000541260	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.08	■■■□□ 2.09
CCDC189-204	ENST00000541260	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CCDC189-204	ENST00000541260	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
CCDC189-204	ENST00000541260	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		27.95	■■■□□ 2.07
CCDC189-204	ENST00000541260	KIF21B	O75037	1637 aa		27.9	■■■□□ 2.06

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