RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539074.1

POLD4-211, Transcript of DNA polymerase delta 4, accessory subunit, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene POLD4, Length 714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4-211ENST00000539074 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.23■■■■■ 4.03
POLD4-211ENST00000539074 ABCC9O60706 1549 aa36.44■■■■□ 3.42
POLD4-211ENST00000539074 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.23■■■■□ 3.39
POLD4-211ENST00000539074 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.6■■■■□ 3.13
POLD4-211ENST00000539074 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.31■■■■□ 3.08
POLD4-211ENST00000539074 NACADO15069 1562 aa34.29■■■■□ 3.08
POLD4-211ENST00000539074 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.01■■■■□ 3.03
POLD4-211ENST00000539074 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
POLD4-211ENST00000539074 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.77■■■■□ 3
POLD4-211ENST00000539074 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.74■■■□□ 2.99
POLD4-211ENST00000539074 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.57■■■□□ 2.96
POLD4-211ENST00000539074 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
POLD4-211ENST00000539074 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.23■■■□□ 2.91
POLD4-211ENST00000539074 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.15■■■□□ 2.9
POLD4-211ENST00000539074 SCRIBQ14160 1630 aa33.01■■■□□ 2.87
POLD4-211ENST00000539074 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.91■■■□□ 2.86
POLD4-211ENST00000539074 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.86■■■□□ 2.85
POLD4-211ENST00000539074 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
POLD4-211ENST00000539074 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.69■■■□□ 2.66
POLD4-211ENST00000539074 NCAPD3P42695 1498 aa31.65■■■□□ 2.66
POLD4-211ENST00000539074 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.52■■■□□ 2.64
POLD4-211ENST00000539074 CUX2O14529 1486 aa31.52■■■□□ 2.64
POLD4-211ENST00000539074 ERCC6Q03468 1493 aa31.51■■■□□ 2.63
POLD4-211ENST00000539074 SMARCA2P51531 1590 aa31.45■■■□□ 2.63
POLD4-211ENST00000539074 SMARCA4P51532 1647 aa31.45■■■□□ 2.62
POLD4-211ENST00000539074 HMGXB3Q12766 1538 aa31.43■■■□□ 2.62
POLD4-211ENST00000539074 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
POLD4-211ENST00000539074 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
POLD4-211ENST00000539074 NESP48681 1621 aa31.23■■■□□ 2.59
POLD4-211ENST00000539074 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.14■■■□□ 2.58
POLD4-211ENST00000539074 MROH2BQ7Z745 1585 aa31■■■□□ 2.55
POLD4-211ENST00000539074 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
POLD4-211ENST00000539074 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.99■■■□□ 2.55
POLD4-211ENST00000539074 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.83■■■□□ 2.53
POLD4-211ENST00000539074 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.81■■■□□ 2.52
POLD4-211ENST00000539074 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.66■■■□□ 2.5
POLD4-211ENST00000539074 WIZO95785 1651 aa30.61■■■□□ 2.49
POLD4-211ENST00000539074 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.58■■■□□ 2.49
POLD4-211ENST00000539074 WDR62O43379 1518 aa30.52■■■□□ 2.48
POLD4-211ENST00000539074 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.42■■■□□ 2.46
POLD4-211ENST00000539074 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.35■■■□□ 2.45
POLD4-211ENST00000539074 CFTRP13569 1480 aa30.28■■■□□ 2.44
POLD4-211ENST00000539074 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
POLD4-211ENST00000539074 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
POLD4-211ENST00000539074 TRIM41Q8WV44 630 aa30.24■■■□□ 2.43
POLD4-211ENST00000539074 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
POLD4-211ENST00000539074 OSCARQ8IYS5 282 aa29.98■■■□□ 2.39
POLD4-211ENST00000539074 PRDM2Q13029 1718 aa29.97■■■□□ 2.39
POLD4-211ENST00000539074 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.86■■■□□ 2.37
POLD4-211ENST00000539074 IFT140Q96RY7 1462 aa29.8■■■□□ 2.36
POLD4-211ENST00000539074 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
POLD4-211ENST00000539074 TOPBP1Q92547 1522 aa29.75■■■□□ 2.35
POLD4-211ENST00000539074 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.67■■■□□ 2.34
POLD4-211ENST00000539074 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.67■■■□□ 2.34
POLD4-211ENST00000539074 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.67■■■□□ 2.34
POLD4-211ENST00000539074 ABCC8Q09428 1581 aa29.65■■■□□ 2.34
POLD4-211ENST00000539074 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
POLD4-211ENST00000539074 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.63■■■□□ 2.33
POLD4-211ENST00000539074 ARHGEF11O15085 1522 aa29.56■■■□□ 2.32
POLD4-211ENST00000539074 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
POLD4-211ENST00000539074 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.312e-8■■■■■ 71
POLD4-211ENST00000539074 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
POLD4-211ENST00000539074 CHD1O14646 1710 aa29.42■■■□□ 2.3
POLD4-211ENST00000539074 FBLN2P98095 1184 aa29.31■■■□□ 2.28
POLD4-211ENST00000539074 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.3■■■□□ 2.28
POLD4-211ENST00000539074 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.3■■■□□ 2.28
POLD4-211ENST00000539074 SOGA1O94964 1423 aa29.26■■■□□ 2.27
POLD4-211ENST00000539074 ARAP1Q96P48 1450 aa29.25■■■□□ 2.27
POLD4-211ENST00000539074 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
POLD4-211ENST00000539074 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.22■■■□□ 2.27
POLD4-211ENST00000539074 WDR97A6NE52 1622 aa29.2■■■□□ 2.27
POLD4-211ENST00000539074 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.19■■■□□ 2.26
POLD4-211ENST00000539074 CUX1P39880 1505 aa29.15■■■□□ 2.26
POLD4-211ENST00000539074 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
POLD4-211ENST00000539074 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.1■■■□□ 2.25
POLD4-211ENST00000539074 SYNJ1O43426 1573 aa29.07■■■□□ 2.24
POLD4-211ENST00000539074 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
POLD4-211ENST00000539074 GRIN2BQ13224 1484 aa29.06■■■□□ 2.24
POLD4-211ENST00000539074 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
POLD4-211ENST00000539074 SYNJ2O15056 1496 aa29■■■□□ 2.23
POLD4-211ENST00000539074 PBRM1Q86U86 1689 aa28.94■■■□□ 2.22
POLD4-211ENST00000539074 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.92■■■□□ 2.22
POLD4-211ENST00000539074 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.87■■■□□ 2.21
POLD4-211ENST00000539074 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.87■■■□□ 2.21
POLD4-211ENST00000539074 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
POLD4-211ENST00000539074 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.19
POLD4-211ENST00000539074 GRIN2AQ12879 1464 aa28.7■■■□□ 2.18
POLD4-211ENST00000539074 ADAMTS12P58397 1594 aa28.67■■■□□ 2.18
POLD4-211ENST00000539074 TOP2BQ02880 1626 aa28.62■■■□□ 2.17
POLD4-211ENST00000539074 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.62■■■□□ 2.17
POLD4-211ENST00000539074 CEP170Q5SW79 1584 aa28.61■■■□□ 2.17
POLD4-211ENST00000539074 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.61■■■□□ 2.17
POLD4-211ENST00000539074 NUP160Q12769 1436 aa28.6■■■□□ 2.17
POLD4-211ENST00000539074 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.55■■■□□ 2.16
POLD4-211ENST00000539074 SHROOM2Q13796 1616 aa28.51■■■□□ 2.15
POLD4-211ENST00000539074 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.5■■■□□ 2.15
POLD4-211ENST00000539074 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
POLD4-211ENST00000539074 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
POLD4-211ENST00000539074 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.28■■■□□ 2.12
POLD4-211ENST00000539074 JPH4Q96JJ6 628 aa28.25■■■□□ 2.11
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