RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538037.5

PUS1-207, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PUS1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-207ENST00000538037 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.93■■■■■ 6.38
PUS1-207ENST00000538037 ABCC9O60706 1549 aa49.71■■■■■ 5.55
PUS1-207ENST00000538037 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.28■■■■■ 5.48
PUS1-207ENST00000538037 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.16■■■■■ 5.14
PUS1-207ENST00000538037 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.09■■■■■ 5.13
PUS1-207ENST00000538037 NACADO15069 1562 aa46.73■■■■■ 5.07
PUS1-207ENST00000538037 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.48■■■■■ 5.03
PUS1-207ENST00000538037 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.33■■■■■ 5.01
PUS1-207ENST00000538037 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.06■■■■■ 4.96
PUS1-207ENST00000538037 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.03■■■■■ 4.96
PUS1-207ENST00000538037 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.88■■■■■ 4.94
PUS1-207ENST00000538037 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
PUS1-207ENST00000538037 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.33■■■■■ 4.85
PUS1-207ENST00000538037 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.07■■■■■ 4.81
PUS1-207ENST00000538037 SCRIBQ14160 1630 aa44.92■■■■■ 4.78
PUS1-207ENST00000538037 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.86■■■■■ 4.77
PUS1-207ENST00000538037 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.8■■■■■ 4.76
PUS1-207ENST00000538037 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
PUS1-207ENST00000538037 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.42■■■■■ 4.54
PUS1-207ENST00000538037 NCAPD3P42695 1498 aa43.25■■■■■ 4.51
PUS1-207ENST00000538037 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.06■■■■■ 4.48
PUS1-207ENST00000538037 CUX2O14529 1486 aa42.91■■■■■ 4.46
PUS1-207ENST00000538037 SMARCA4P51532 1647 aa42.85■■■■■ 4.45
PUS1-207ENST00000538037 ERCC6Q03468 1493 aa42.82■■■■■ 4.45
PUS1-207ENST00000538037 SMARCA2P51531 1590 aa42.8■■■■■ 4.44
PUS1-207ENST00000538037 HMGXB3Q12766 1538 aa42.78■■■■■ 4.44
PUS1-207ENST00000538037 NESP48681 1621 aa42.67■■■■■ 4.42
PUS1-207ENST00000538037 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.41
PUS1-207ENST00000538037 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
PUS1-207ENST00000538037 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.48■■■■■ 4.39
PUS1-207ENST00000538037 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.35■■■■■ 4.37
PUS1-207ENST00000538037 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
PUS1-207ENST00000538037 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.19■■■■■ 4.34
PUS1-207ENST00000538037 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.99■■■■■ 4.31
PUS1-207ENST00000538037 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.98■■■■■ 4.31
PUS1-207ENST00000538037 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.9■■■■■ 4.3
PUS1-207ENST00000538037 WIZO95785 1651 aa41.77■■■■■ 4.28
PUS1-207ENST00000538037 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.65■■■■■ 4.26
PUS1-207ENST00000538037 WDR62O43379 1518 aa41.56■■■■■ 4.24
PUS1-207ENST00000538037 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
PUS1-207ENST00000538037 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.39■■■■■ 4.22
PUS1-207ENST00000538037 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.38■■■■■ 4.21
PUS1-207ENST00000538037 CFTRP13569 1480 aa41.35■■■■■ 4.21
PUS1-207ENST00000538037 TRIM41Q8WV44 630 aa41.26■■■■■ 4.2
PUS1-207ENST00000538037 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
PUS1-207ENST00000538037 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
PUS1-207ENST00000538037 OSCARQ8IYS5 282 aa40.99■■■■■ 4.15
PUS1-207ENST00000538037 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.83■■■■■ 4.13
PUS1-207ENST00000538037 PRDM2Q13029 1718 aa40.71■■■■■ 4.11
PUS1-207ENST00000538037 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
PUS1-207ENST00000538037 IFT140Q96RY7 1462 aa40.61■■■■■ 4.09
PUS1-207ENST00000538037 TOPBP1Q92547 1522 aa40.57■■■■■ 4.09
PUS1-207ENST00000538037 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
PUS1-207ENST00000538037 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
PUS1-207ENST00000538037 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
PUS1-207ENST00000538037 ABCC8Q09428 1581 aa40.4■■■■■ 4.06
PUS1-207ENST00000538037 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.33■■■■■ 4.05
PUS1-207ENST00000538037 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
PUS1-207ENST00000538037 ARHGEF11O15085 1522 aa40.27■■■■■ 4.04
PUS1-207ENST00000538037 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.049e-7■■■■■ 27.5
PUS1-207ENST00000538037 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
PUS1-207ENST00000538037 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
PUS1-207ENST00000538037 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.07■■■■■ 4.01
PUS1-207ENST00000538037 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.05■■■■■ 4
PUS1-207ENST00000538037 CHD1O14646 1710 aa40.04■■■■■ 4
PUS1-207ENST00000538037 FBLN2P98095 1184 aa39.98■■■■□ 3.99
PUS1-207ENST00000538037 SOGA1O94964 1423 aa39.98■■■■□ 3.99
PUS1-207ENST00000538037 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
PUS1-207ENST00000538037 ARAP1Q96P48 1450 aa39.9■■■■□ 3.98
PUS1-207ENST00000538037 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.82■■■■□ 3.97
PUS1-207ENST00000538037 CUX1P39880 1505 aa39.79■■■■□ 3.96
PUS1-207ENST00000538037 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.75■■■■□ 3.95
PUS1-207ENST00000538037 WDR97A6NE52 1622 aa39.69■■■■□ 3.94
PUS1-207ENST00000538037 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.66■■■■□ 3.94
PUS1-207ENST00000538037 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
PUS1-207ENST00000538037 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
PUS1-207ENST00000538037 GRIN2BQ13224 1484 aa39.62■■■■□ 3.93
PUS1-207ENST00000538037 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
PUS1-207ENST00000538037 SYNJ2O15056 1496 aa39.51■■■■□ 3.92
PUS1-207ENST00000538037 SYNJ1O43426 1573 aa39.5■■■■□ 3.91
PUS1-207ENST00000538037 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.44■■■■□ 3.9
PUS1-207ENST00000538037 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.37■■■■□ 3.89
PUS1-207ENST00000538037 PBRM1Q86U86 1689 aa39.33■■■■□ 3.89
PUS1-207ENST00000538037 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.29■■■■□ 3.88
PUS1-207ENST00000538037 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
PUS1-207ENST00000538037 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.13■■■■□ 3.85
PUS1-207ENST00000538037 GRIN2AQ12879 1464 aa39.11■■■■□ 3.85
PUS1-207ENST00000538037 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.08■■■■□ 3.85
PUS1-207ENST00000538037 NUP160Q12769 1436 aa39.04■■■■□ 3.84
PUS1-207ENST00000538037 TOP2BQ02880 1626 aa39■■■■□ 3.83
PUS1-207ENST00000538037 ADAMTS12P58397 1594 aa38.99■■■■□ 3.83
PUS1-207ENST00000538037 CEP170Q5SW79 1584 aa38.99■■■■□ 3.83
PUS1-207ENST00000538037 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.98■■■■□ 3.83
PUS1-207ENST00000538037 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.94■■■■□ 3.82
PUS1-207ENST00000538037 SHROOM2Q13796 1616 aa38.85■■■■□ 3.81
PUS1-207ENST00000538037 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.83■■■■□ 3.81
PUS1-207ENST00000538037 JPH4Q96JJ6 628 aa38.68■■■■□ 3.78
PUS1-207ENST00000538037 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
PUS1-207ENST00000538037 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
PUS1-207ENST00000538037 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.47■■■■□ 3.75
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