RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536323.5

PRPSAP2-216, Transcript of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase associated protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRPSAP2, Length 1,872 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPSAP2-216ENST00000536323 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.11■■■■□ 3.69
PRPSAP2-216ENST00000536323 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.26■■■■□ 3.07
PRPSAP2-216ENST00000536323 ABCC9O60706 1549 aa34.19■■■■□ 3.06
PRPSAP2-216ENST00000536323 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.62■■■□□ 2.81
PRPSAP2-216ENST00000536323 NACADO15069 1562 aa32.4■■■□□ 2.78
PRPSAP2-216ENST00000536323 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.1■■■□□ 2.73
PRPSAP2-216ENST00000536323 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.07■■■□□ 2.72
PRPSAP2-216ENST00000536323 MYO15BQ96JP2 1530 aa32■■■□□ 2.71
PRPSAP2-216ENST00000536323 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.83■■■□□ 2.69
PRPSAP2-216ENST00000536323 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.68
PRPSAP2-216ENST00000536323 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.64■■■□□ 2.65
PRPSAP2-216ENST00000536323 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
PRPSAP2-216ENST00000536323 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.55■■■□□ 2.64
PRPSAP2-216ENST00000536323 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.32■■■□□ 2.6
PRPSAP2-216ENST00000536323 SCRIBQ14160 1630 aa31.11■■■□□ 2.57
PRPSAP2-216ENST00000536323 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.92■■■□□ 2.54
PRPSAP2-216ENST00000536323 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
PRPSAP2-216ENST00000536323 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.85■■■□□ 2.53
PRPSAP2-216ENST00000536323 NCAPD3P42695 1498 aa29.91■■■□□ 2.38
PRPSAP2-216ENST00000536323 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.78■■■□□ 2.36
PRPSAP2-216ENST00000536323 SMARCA4P51532 1647 aa29.73■■■□□ 2.35
PRPSAP2-216ENST00000536323 SMARCA2P51531 1590 aa29.72■■■□□ 2.35
PRPSAP2-216ENST00000536323 HMGXB3Q12766 1538 aa29.69■■■□□ 2.34
PRPSAP2-216ENST00000536323 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
PRPSAP2-216ENST00000536323 CUX2O14529 1486 aa29.58■■■□□ 2.33
PRPSAP2-216ENST00000536323 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.58■■■□□ 2.33
PRPSAP2-216ENST00000536323 ERCC6Q03468 1493 aa29.55■■■□□ 2.32
PRPSAP2-216ENST00000536323 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.5■■■□□ 2.31
PRPSAP2-216ENST00000536323 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PRPSAP2-216ENST00000536323 NESP48681 1621 aa29.36■■■□□ 2.29
PRPSAP2-216ENST00000536323 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.33■■■□□ 2.29
PRPSAP2-216ENST00000536323 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.24■■■□□ 2.27
PRPSAP2-216ENST00000536323 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PRPSAP2-216ENST00000536323 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.06■■■□□ 2.24
PRPSAP2-216ENST00000536323 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29■■■□□ 2.23
PRPSAP2-216ENST00000536323 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.98■■■□□ 2.23
PRPSAP2-216ENST00000536323 WIZO95785 1651 aa28.96■■■□□ 2.23
PRPSAP2-216ENST00000536323 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.8■■■□□ 2.2
PRPSAP2-216ENST00000536323 WDR62O43379 1518 aa28.74■■■□□ 2.19
PRPSAP2-216ENST00000536323 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PRPSAP2-216ENST00000536323 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.67■■■□□ 2.18
PRPSAP2-216ENST00000536323 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
PRPSAP2-216ENST00000536323 CFTRP13569 1480 aa28.64■■■□□ 2.18
PRPSAP2-216ENST00000536323 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.63■■■□□ 2.17
PRPSAP2-216ENST00000536323 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
PRPSAP2-216ENST00000536323 PRDM2Q13029 1718 aa28.36■■■□□ 2.13
PRPSAP2-216ENST00000536323 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.3■■■□□ 2.12
PRPSAP2-216ENST00000536323 OSCARQ8IYS5 282 aa28.19■■■□□ 2.1
PRPSAP2-216ENST00000536323 TRIM41Q8WV44 630 aa28.17■■■□□ 2.1
PRPSAP2-216ENST00000536323 IFT140Q96RY7 1462 aa28.12■■■□□ 2.09
PRPSAP2-216ENST00000536323 ABCC8Q09428 1581 aa28.09■■■□□ 2.09
PRPSAP2-216ENST00000536323 TOPBP1Q92547 1522 aa28.09■■■□□ 2.09
PRPSAP2-216ENST00000536323 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
PRPSAP2-216ENST00000536323 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.99■■■□□ 2.07
PRPSAP2-216ENST00000536323 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PRPSAP2-216ENST00000536323 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PRPSAP2-216ENST00000536323 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.8■■■□□ 2.04
PRPSAP2-216ENST00000536323 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.8■■■□□ 2.04
PRPSAP2-216ENST00000536323 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.8■■■□□ 2.04
PRPSAP2-216ENST00000536323 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
PRPSAP2-216ENST00000536323 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.034e-7■■■■■ 63.2
PRPSAP2-216ENST00000536323 ARHGEF11O15085 1522 aa27.72■■■□□ 2.03
PRPSAP2-216ENST00000536323 CHD1O14646 1710 aa27.67■■■□□ 2.02
PRPSAP2-216ENST00000536323 SOGA1O94964 1423 aa27.66■■■□□ 2.02
PRPSAP2-216ENST00000536323 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.65■■■□□ 2.02
PRPSAP2-216ENST00000536323 WDR97A6NE52 1622 aa27.63■■■□□ 2.01
PRPSAP2-216ENST00000536323 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.6■■■□□ 2.01
PRPSAP2-216ENST00000536323 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
PRPSAP2-216ENST00000536323 CUX1P39880 1505 aa27.56■■■□□ 2
PRPSAP2-216ENST00000536323 FBLN2P98095 1184 aa27.55■■■□□ 2
PRPSAP2-216ENST00000536323 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.49■■□□□ 1.99
PRPSAP2-216ENST00000536323 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.48■■□□□ 1.99
PRPSAP2-216ENST00000536323 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PRPSAP2-216ENST00000536323 GRIN2BQ13224 1484 aa27.44■■□□□ 1.98
PRPSAP2-216ENST00000536323 ARAP1Q96P48 1450 aa27.44■■□□□ 1.98
PRPSAP2-216ENST00000536323 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.39■■□□□ 1.98
PRPSAP2-216ENST00000536323 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PRPSAP2-216ENST00000536323 SYNJ1O43426 1573 aa27.38■■□□□ 1.97
PRPSAP2-216ENST00000536323 SYNJ2O15056 1496 aa27.36■■□□□ 1.97
PRPSAP2-216ENST00000536323 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
PRPSAP2-216ENST00000536323 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.33■■□□□ 1.97
PRPSAP2-216ENST00000536323 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.32■■□□□ 1.96
PRPSAP2-216ENST00000536323 PBRM1Q86U86 1689 aa27.3■■□□□ 1.96
PRPSAP2-216ENST00000536323 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.27■■□□□ 1.96
PRPSAP2-216ENST00000536323 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.94
PRPSAP2-216ENST00000536323 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PRPSAP2-216ENST00000536323 TOP2BQ02880 1626 aa27.15■■□□□ 1.94
PRPSAP2-216ENST00000536323 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.15■■□□□ 1.94
PRPSAP2-216ENST00000536323 GRIN2AQ12879 1464 aa27.09■■□□□ 1.93
PRPSAP2-216ENST00000536323 ADAMTS12P58397 1594 aa27.06■■□□□ 1.92
PRPSAP2-216ENST00000536323 NUP160Q12769 1436 aa27.01■■□□□ 1.92
PRPSAP2-216ENST00000536323 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27■■□□□ 1.91
PRPSAP2-216ENST00000536323 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.99■■□□□ 1.91
PRPSAP2-216ENST00000536323 CEP170Q5SW79 1584 aa26.96■■□□□ 1.91
PRPSAP2-216ENST00000536323 SHROOM2Q13796 1616 aa26.9■■□□□ 1.9
PRPSAP2-216ENST00000536323 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.89■■□□□ 1.9
PRPSAP2-216ENST00000536323 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PRPSAP2-216ENST00000536323 JPH4Q96JJ6 628 aa26.71■■□□□ 1.87
PRPSAP2-216ENST00000536323 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.68■■□□□ 1.86
PRPSAP2-216ENST00000536323 KIF27Q86VH2 1401 aa26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms