RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534242.5

SHARPIN-209, Transcript of SHANK associated RH domain interactor, humanhuman

TSL 2

Gene SHARPIN, Length 933 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPIN-209ENST00000534242 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.31■■■■■ 6.77
SHARPIN-209ENST00000534242 ABCC9O60706 1549 aa51.38■■■■■ 5.82
SHARPIN-209ENST00000534242 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.37■■■■■ 5.81
SHARPIN-209ENST00000534242 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.9■■■■■ 5.42
SHARPIN-209ENST00000534242 NACADO15069 1562 aa48.59■■■■■ 5.37
SHARPIN-209ENST00000534242 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.35■■■■■ 5.33
SHARPIN-209ENST00000534242 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.17■■■■■ 5.3
SHARPIN-209ENST00000534242 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.95■■■■■ 5.27
SHARPIN-209ENST00000534242 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.85■■■■■ 5.25
SHARPIN-209ENST00000534242 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.74■■■■■ 5.23
SHARPIN-209ENST00000534242 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.52■■■■■ 5.2
SHARPIN-209ENST00000534242 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.48■■■■■ 5.19
SHARPIN-209ENST00000534242 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.35■■■■■ 5.17
SHARPIN-209ENST00000534242 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.87■■■■■ 5.09
SHARPIN-209ENST00000534242 SCRIBQ14160 1630 aa46.83■■■■■ 5.09
SHARPIN-209ENST00000534242 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.39■■■■■ 5.02
SHARPIN-209ENST00000534242 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5.01
SHARPIN-209ENST00000534242 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.28■■■■■ 5
SHARPIN-209ENST00000534242 NCAPD3P42695 1498 aa44.88■■■■■ 4.78
SHARPIN-209ENST00000534242 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.74■■■■■ 4.75
SHARPIN-209ENST00000534242 SMARCA4P51532 1647 aa44.68■■■■■ 4.74
SHARPIN-209ENST00000534242 SMARCA2P51531 1590 aa44.6■■■■■ 4.73
SHARPIN-209ENST00000534242 HMGXB3Q12766 1538 aa44.53■■■■■ 4.72
SHARPIN-209ENST00000534242 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
SHARPIN-209ENST00000534242 ERCC6Q03468 1493 aa44.35■■■■■ 4.69
SHARPIN-209ENST00000534242 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.3■■■■■ 4.68
SHARPIN-209ENST00000534242 CUX2O14529 1486 aa44.27■■■■■ 4.68
SHARPIN-209ENST00000534242 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.26■■■■■ 4.68
SHARPIN-209ENST00000534242 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.19■■■■■ 4.66
SHARPIN-209ENST00000534242 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.16■■■■■ 4.66
SHARPIN-209ENST00000534242 NESP48681 1621 aa44.14■■■■■ 4.66
SHARPIN-209ENST00000534242 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.84■■■■■ 4.61
SHARPIN-209ENST00000534242 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
SHARPIN-209ENST00000534242 WIZO95785 1651 aa43.61■■■■■ 4.57
SHARPIN-209ENST00000534242 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.6■■■■■ 4.57
SHARPIN-209ENST00000534242 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.53■■■■■ 4.56
SHARPIN-209ENST00000534242 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.52■■■■■ 4.56
SHARPIN-209ENST00000534242 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
SHARPIN-209ENST00000534242 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.22■■■■■ 4.51
SHARPIN-209ENST00000534242 WDR62O43379 1518 aa43.12■■■■■ 4.49
SHARPIN-209ENST00000534242 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
SHARPIN-209ENST00000534242 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.05■■■■■ 4.48
SHARPIN-209ENST00000534242 CFTRP13569 1480 aa43.03■■■■■ 4.48
SHARPIN-209ENST00000534242 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.01■■■■■ 4.48
SHARPIN-209ENST00000534242 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
SHARPIN-209ENST00000534242 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.61■■■■■ 4.41
SHARPIN-209ENST00000534242 PRDM2Q13029 1718 aa42.51■■■■■ 4.4
SHARPIN-209ENST00000534242 TRIM41Q8WV44 630 aa42.27■■■■■ 4.36
SHARPIN-209ENST00000534242 OSCARQ8IYS5 282 aa42.25■■■■■ 4.35
SHARPIN-209ENST00000534242 TOPBP1Q92547 1522 aa42.2■■■■■ 4.35
SHARPIN-209ENST00000534242 IFT140Q96RY7 1462 aa42.19■■■■■ 4.34
SHARPIN-209ENST00000534242 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
SHARPIN-209ENST00000534242 ABCC8Q09428 1581 aa42.1■■■■■ 4.33
SHARPIN-209ENST00000534242 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.04■■■■■ 4.32
SHARPIN-209ENST00000534242 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
SHARPIN-209ENST00000534242 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
SHARPIN-209ENST00000534242 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
SHARPIN-209ENST00000534242 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.75■■■■■ 4.274e-9■■■■■ 46.5
SHARPIN-209ENST00000534242 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.67■■■■■ 4.26
SHARPIN-209ENST00000534242 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.67■■■■■ 4.26
SHARPIN-209ENST00000534242 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.67■■■■■ 4.26
SHARPIN-209ENST00000534242 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.63■■■■■ 4.25
SHARPIN-209ENST00000534242 SOGA1O94964 1423 aa41.59■■■■■ 4.25
SHARPIN-209ENST00000534242 ARHGEF11O15085 1522 aa41.57■■■■■ 4.25
SHARPIN-209ENST00000534242 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.53■■■■■ 4.24
SHARPIN-209ENST00000534242 CHD1O14646 1710 aa41.52■■■■■ 4.24
SHARPIN-209ENST00000534242 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
SHARPIN-209ENST00000534242 CUX1P39880 1505 aa41.49■■■■■ 4.23
SHARPIN-209ENST00000534242 FBLN2P98095 1184 aa41.46■■■■■ 4.23
SHARPIN-209ENST00000534242 WDR97A6NE52 1622 aa41.39■■■■■ 4.22
SHARPIN-209ENST00000534242 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
SHARPIN-209ENST00000534242 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.33■■■■■ 4.21
SHARPIN-209ENST00000534242 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.26■■■■■ 4.2
SHARPIN-209ENST00000534242 GRIN2BQ13224 1484 aa41.22■■■■■ 4.19
SHARPIN-209ENST00000534242 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
SHARPIN-209ENST00000534242 ARAP1Q96P48 1450 aa41.17■■■■■ 4.18
SHARPIN-209ENST00000534242 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
SHARPIN-209ENST00000534242 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.09■■■■■ 4.17
SHARPIN-209ENST00000534242 SYNJ2O15056 1496 aa41.09■■■■■ 4.17
SHARPIN-209ENST00000534242 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.08■■■■■ 4.17
SHARPIN-209ENST00000534242 SYNJ1O43426 1573 aa41.07■■■■■ 4.16
SHARPIN-209ENST00000534242 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.06■■■■■ 4.16
SHARPIN-209ENST00000534242 PBRM1Q86U86 1689 aa41.01■■■■■ 4.16
SHARPIN-209ENST00000534242 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.97■■■■■ 4.15
SHARPIN-209ENST00000534242 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.9■■■■■ 4.14
SHARPIN-209ENST00000534242 TOP2BQ02880 1626 aa40.82■■■■■ 4.13
SHARPIN-209ENST00000534242 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.82■■■■■ 4.12
SHARPIN-209ENST00000534242 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
SHARPIN-209ENST00000534242 GRIN2AQ12879 1464 aa40.7■■■■■ 4.11
SHARPIN-209ENST00000534242 ADAMTS12P58397 1594 aa40.67■■■■■ 4.1
SHARPIN-209ENST00000534242 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.57■■■■■ 4.08
SHARPIN-209ENST00000534242 NUP160Q12769 1436 aa40.57■■■■■ 4.08
SHARPIN-209ENST00000534242 CEP170Q5SW79 1584 aa40.54■■■■■ 4.08
SHARPIN-209ENST00000534242 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.53■■■■■ 4.08
SHARPIN-209ENST00000534242 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.46■■■■■ 4.07
SHARPIN-209ENST00000534242 SHROOM2Q13796 1616 aa40.35■■■■■ 4.05
SHARPIN-209ENST00000534242 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
SHARPIN-209ENST00000534242 JPH4Q96JJ6 628 aa40.14■■■■■ 4.02
SHARPIN-209ENST00000534242 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.1■■■■■ 4.01
SHARPIN-209ENST00000534242 KIF27Q86VH2 1401 aa40.05■■■■■ 4
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