RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534145.1

SIGIRR-221, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene SIGIRR, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-221ENST00000534145 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.72■■■■■ 6.99
SIGIRR-221ENST00000534145 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.42■■■■■ 5.98
SIGIRR-221ENST00000534145 ABCC9O60706 1549 aa51.61■■■■■ 5.85
SIGIRR-221ENST00000534145 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.5■■■■■ 5.52
SIGIRR-221ENST00000534145 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.34■■■■■ 5.49
SIGIRR-221ENST00000534145 NACADO15069 1562 aa49.32■■■■■ 5.49
SIGIRR-221ENST00000534145 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.83■■■■■ 5.41
SIGIRR-221ENST00000534145 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.81■■■■■ 5.4
SIGIRR-221ENST00000534145 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.52■■■■■ 5.36
SIGIRR-221ENST00000534145 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.5■■■■■ 5.35
SIGIRR-221ENST00000534145 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.17■■■■■ 5.3
SIGIRR-221ENST00000534145 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.97■■■■■ 5.27
SIGIRR-221ENST00000534145 SCRIBQ14160 1630 aa47.82■■■■■ 5.25
SIGIRR-221ENST00000534145 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.63■■■■■ 5.22
SIGIRR-221ENST00000534145 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.37■■■■■ 5.17
SIGIRR-221ENST00000534145 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
SIGIRR-221ENST00000534145 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.68■■■■■ 5.06
SIGIRR-221ENST00000534145 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.38■■■■■ 5.02
SIGIRR-221ENST00000534145 SMARCA4P51532 1647 aa45.68■■■■■ 4.9
SIGIRR-221ENST00000534145 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.56■■■■■ 4.88
SIGIRR-221ENST00000534145 NCAPD3P42695 1498 aa45.47■■■■■ 4.87
SIGIRR-221ENST00000534145 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.46■■■■■ 4.87
SIGIRR-221ENST00000534145 SMARCA2P51531 1590 aa45.42■■■■■ 4.86
SIGIRR-221ENST00000534145 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.26■■■■■ 4.84
SIGIRR-221ENST00000534145 HMGXB3Q12766 1538 aa45.24■■■■■ 4.83
SIGIRR-221ENST00000534145 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.17■■■■■ 4.82
SIGIRR-221ENST00000534145 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
SIGIRR-221ENST00000534145 WIZO95785 1651 aa44.83■■■■■ 4.77
SIGIRR-221ENST00000534145 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
SIGIRR-221ENST00000534145 NESP48681 1621 aa44.55■■■■■ 4.72
SIGIRR-221ENST00000534145 ERCC6Q03468 1493 aa44.53■■■■■ 4.72
SIGIRR-221ENST00000534145 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.39■■■■■ 4.7
SIGIRR-221ENST00000534145 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
SIGIRR-221ENST00000534145 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.15■■■■■ 4.66
SIGIRR-221ENST00000534145 CUX2O14529 1486 aa44.13■■■■■ 4.65
SIGIRR-221ENST00000534145 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.11■■■■■ 4.65
SIGIRR-221ENST00000534145 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.08■■■■■ 4.65
SIGIRR-221ENST00000534145 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
SIGIRR-221ENST00000534145 CFTRP13569 1480 aa43.8■■■■■ 4.6
SIGIRR-221ENST00000534145 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.75■■■■■ 4.59
SIGIRR-221ENST00000534145 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.67■■■■■ 4.58
SIGIRR-221ENST00000534145 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.66■■■■■ 4.58
SIGIRR-221ENST00000534145 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.65■■■■■ 4.58
SIGIRR-221ENST00000534145 PRDM2Q13029 1718 aa43.63■■■■■ 4.58
SIGIRR-221ENST00000534145 WDR62O43379 1518 aa43.51■■■■■ 4.56
SIGIRR-221ENST00000534145 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
SIGIRR-221ENST00000534145 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
SIGIRR-221ENST00000534145 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.18■■■■■ 4.5
SIGIRR-221ENST00000534145 TOPBP1Q92547 1522 aa42.93■■■■■ 4.46
SIGIRR-221ENST00000534145 ABCC8Q09428 1581 aa42.91■■■■■ 4.46
SIGIRR-221ENST00000534145 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.87■■■■■ 4.45
SIGIRR-221ENST00000534145 IFT140Q96RY7 1462 aa42.74■■■■■ 4.43
SIGIRR-221ENST00000534145 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
SIGIRR-221ENST00000534145 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
SIGIRR-221ENST00000534145 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
SIGIRR-221ENST00000534145 CUX1P39880 1505 aa42.47■■■■■ 4.39
SIGIRR-221ENST00000534145 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.39
SIGIRR-221ENST00000534145 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.4■■■■■ 4.38
SIGIRR-221ENST00000534145 SOGA1O94964 1423 aa42.38■■■■■ 4.38
SIGIRR-221ENST00000534145 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.38■■■■■ 4.38
SIGIRR-221ENST00000534145 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.31■■■■■ 4.364e-6■□□□□ 10.8
SIGIRR-221ENST00000534145 OSCARQ8IYS5 282 aa42.28■■■■■ 4.36
SIGIRR-221ENST00000534145 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
SIGIRR-221ENST00000534145 WDR97A6NE52 1622 aa42.13■■■■■ 4.34
SIGIRR-221ENST00000534145 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.08■■■■■ 4.33
SIGIRR-221ENST00000534145 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.07■■■■■ 4.33
SIGIRR-221ENST00000534145 CHD1O14646 1710 aa42.06■■■■■ 4.32
SIGIRR-221ENST00000534145 TOP2BQ02880 1626 aa42.05■■■■■ 4.32
SIGIRR-221ENST00000534145 SYNJ1O43426 1573 aa42.01■■■■■ 4.32
SIGIRR-221ENST00000534145 FBLN2P98095 1184 aa41.95■■■■■ 4.31
SIGIRR-221ENST00000534145 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.94■■■■■ 4.3
SIGIRR-221ENST00000534145 PBRM1Q86U86 1689 aa41.93■■■■■ 4.3
SIGIRR-221ENST00000534145 GRIN2BQ13224 1484 aa41.92■■■■■ 4.3
SIGIRR-221ENST00000534145 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.92■■■■■ 4.3
SIGIRR-221ENST00000534145 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.88■■■■■ 4.29
SIGIRR-221ENST00000534145 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.84■■■■■ 4.29
SIGIRR-221ENST00000534145 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
SIGIRR-221ENST00000534145 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
SIGIRR-221ENST00000534145 TRIM41Q8WV44 630 aa41.71■■■■■ 4.27
SIGIRR-221ENST00000534145 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.68■■■■■ 4.26
SIGIRR-221ENST00000534145 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.68■■■■■ 4.26
SIGIRR-221ENST00000534145 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.68■■■■■ 4.26
SIGIRR-221ENST00000534145 SYNJ2O15056 1496 aa41.67■■■■■ 4.26
SIGIRR-221ENST00000534145 ARHGEF11O15085 1522 aa41.58■■■■■ 4.25
SIGIRR-221ENST00000534145 ADAMTS12P58397 1594 aa41.47■■■■■ 4.23
SIGIRR-221ENST00000534145 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.46■■■■■ 4.23
SIGIRR-221ENST00000534145 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.45■■■■■ 4.23
SIGIRR-221ENST00000534145 GRIN2AQ12879 1464 aa41.37■■■■■ 4.21
SIGIRR-221ENST00000534145 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.36■■■■■ 4.21
SIGIRR-221ENST00000534145 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.26■■■■■ 4.2
SIGIRR-221ENST00000534145 KIF27Q86VH2 1401 aa41.23■■■■■ 4.19
SIGIRR-221ENST00000534145 ARAP1Q96P48 1450 aa41.21■■■■■ 4.19
SIGIRR-221ENST00000534145 CEP170Q5SW79 1584 aa41.2■■■■■ 4.19
SIGIRR-221ENST00000534145 NUP160Q12769 1436 aa41.16■■■■■ 4.18
SIGIRR-221ENST00000534145 IGF1RP08069 1367 aa41.07■■■■■ 4.16
SIGIRR-221ENST00000534145 CUL7Q14999 1698 aa41.07■■■■■ 4.16
SIGIRR-221ENST00000534145 SHROOM2Q13796 1616 aa40.95■■■■■ 4.15
SIGIRR-221ENST00000534145 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.9■■■■■ 4.14
SIGIRR-221ENST00000534145 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.86■■■■■ 4.13
SIGIRR-221ENST00000534145 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.86■■■■■ 4.13
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