RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534112.1

SSH3-211, Transcript of slingshot protein phosphatase 3, humanhuman

TSL 4

Gene SSH3, Length 544 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3-211ENST00000534112 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.73■■■■■ 6.19
SSH3-211ENST00000534112 ABCC9O60706 1549 aa48.57■■■■■ 5.37
SSH3-211ENST00000534112 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.17■■■■■ 5.3
SSH3-211ENST00000534112 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.05■■■■■ 4.96
SSH3-211ENST00000534112 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.89■■■■■ 4.94
SSH3-211ENST00000534112 NACADO15069 1562 aa45.7■■■■■ 4.91
SSH3-211ENST00000534112 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.59■■■■■ 4.89
SSH3-211ENST00000534112 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.27■■■■■ 4.84
SSH3-211ENST00000534112 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.01■■■■■ 4.8
SSH3-211ENST00000534112 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.87■■■■■ 4.77
SSH3-211ENST00000534112 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.73■■■■■ 4.75
SSH3-211ENST00000534112 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
SSH3-211ENST00000534112 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.34■■■■■ 4.69
SSH3-211ENST00000534112 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.1■■■■■ 4.65
SSH3-211ENST00000534112 SCRIBQ14160 1630 aa43.95■■■■■ 4.63
SSH3-211ENST00000534112 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.8■■■■■ 4.6
SSH3-211ENST00000534112 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.78■■■■■ 4.6
SSH3-211ENST00000534112 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
SSH3-211ENST00000534112 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.31■■■■■ 4.36
SSH3-211ENST00000534112 NCAPD3P42695 1498 aa42.27■■■■■ 4.36
SSH3-211ENST00000534112 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.09■■■■■ 4.33
SSH3-211ENST00000534112 ERCC6Q03468 1493 aa41.95■■■■■ 4.31
SSH3-211ENST00000534112 CUX2O14529 1486 aa41.93■■■■■ 4.3
SSH3-211ENST00000534112 SMARCA2P51531 1590 aa41.9■■■■■ 4.3
SSH3-211ENST00000534112 SMARCA4P51532 1647 aa41.89■■■■■ 4.3
SSH3-211ENST00000534112 HMGXB3Q12766 1538 aa41.84■■■■■ 4.29
SSH3-211ENST00000534112 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
SSH3-211ENST00000534112 NESP48681 1621 aa41.65■■■■■ 4.26
SSH3-211ENST00000534112 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
SSH3-211ENST00000534112 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.5■■■■■ 4.23
SSH3-211ENST00000534112 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.4■■■■■ 4.22
SSH3-211ENST00000534112 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.25■■■■■ 4.19
SSH3-211ENST00000534112 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
SSH3-211ENST00000534112 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.12■■■■■ 4.17
SSH3-211ENST00000534112 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.99■■■■■ 4.15
SSH3-211ENST00000534112 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.97■■■■■ 4.15
SSH3-211ENST00000534112 WIZO95785 1651 aa40.82■■■■■ 4.13
SSH3-211ENST00000534112 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.74■■■■■ 4.11
SSH3-211ENST00000534112 WDR62O43379 1518 aa40.62■■■■■ 4.09
SSH3-211ENST00000534112 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.52■■■■■ 4.08
SSH3-211ENST00000534112 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
SSH3-211ENST00000534112 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.48■■■■■ 4.07
SSH3-211ENST00000534112 CFTRP13569 1480 aa40.44■■■■■ 4.06
SSH3-211ENST00000534112 TRIM41Q8WV44 630 aa40.34■■■■■ 4.05
SSH3-211ENST00000534112 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
SSH3-211ENST00000534112 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
SSH3-211ENST00000534112 OSCARQ8IYS5 282 aa40.09■■■■■ 4.01
SSH3-211ENST00000534112 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.93■■■■□ 3.98
SSH3-211ENST00000534112 PRDM2Q13029 1718 aa39.77■■■■□ 3.96
SSH3-211ENST00000534112 IFT140Q96RY7 1462 aa39.75■■■■□ 3.95
SSH3-211ENST00000534112 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
SSH3-211ENST00000534112 TOPBP1Q92547 1522 aa39.67■■■■□ 3.94
SSH3-211ENST00000534112 ABCC8Q09428 1581 aa39.58■■■■□ 3.93
SSH3-211ENST00000534112 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.46■■■■□ 3.91
SSH3-211ENST00000534112 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
SSH3-211ENST00000534112 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
SSH3-211ENST00000534112 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
SSH3-211ENST00000534112 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.9
SSH3-211ENST00000534112 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.36■■■■□ 3.89
SSH3-211ENST00000534112 ARHGEF11O15085 1522 aa39.34■■■■□ 3.89
SSH3-211ENST00000534112 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
SSH3-211ENST00000534112 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
SSH3-211ENST00000534112 FBLN2P98095 1184 aa39.19■■■■□ 3.86
SSH3-211ENST00000534112 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.19■■■■□ 3.86
SSH3-211ENST00000534112 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.15■■■■□ 3.86
SSH3-211ENST00000534112 SOGA1O94964 1423 aa39.13■■■■□ 3.85
SSH3-211ENST00000534112 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
SSH3-211ENST00000534112 CHD1O14646 1710 aa39.09■■■■□ 3.85
SSH3-211ENST00000534112 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.97■■■■□ 3.83
SSH3-211ENST00000534112 ARAP1Q96P48 1450 aa38.95■■■■□ 3.83
SSH3-211ENST00000534112 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.9■■■■□ 3.82
SSH3-211ENST00000534112 CUX1P39880 1505 aa38.89■■■■□ 3.82
SSH3-211ENST00000534112 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
SSH3-211ENST00000534112 WDR97A6NE52 1622 aa38.84■■■■□ 3.81
SSH3-211ENST00000534112 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
SSH3-211ENST00000534112 GRIN2BQ13224 1484 aa38.78■■■■□ 3.8
SSH3-211ENST00000534112 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
SSH3-211ENST00000534112 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.72■■■■□ 3.79
SSH3-211ENST00000534112 SYNJ2O15056 1496 aa38.67■■■■□ 3.78
SSH3-211ENST00000534112 SYNJ1O43426 1573 aa38.67■■■■□ 3.78
SSH3-211ENST00000534112 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.61■■■■□ 3.77
SSH3-211ENST00000534112 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
SSH3-211ENST00000534112 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.53■■■■□ 3.76
SSH3-211ENST00000534112 PBRM1Q86U86 1689 aa38.44■■■■□ 3.74
SSH3-211ENST00000534112 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.41■■■■□ 3.74
SSH3-211ENST00000534112 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.37■■■■□ 3.73
SSH3-211ENST00000534112 GRIN2AQ12879 1464 aa38.26■■■■□ 3.72
SSH3-211ENST00000534112 NUP160Q12769 1436 aa38.17■■■■□ 3.7
SSH3-211ENST00000534112 TOP2BQ02880 1626 aa38.16■■■■□ 3.7
SSH3-211ENST00000534112 ADAMTS12P58397 1594 aa38.14■■■■□ 3.7
SSH3-211ENST00000534112 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.12■■■■□ 3.69
SSH3-211ENST00000534112 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.12■■■■□ 3.69
SSH3-211ENST00000534112 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.12■■■■□ 3.69
SSH3-211ENST00000534112 CEP170Q5SW79 1584 aa38.1■■■■□ 3.69
SSH3-211ENST00000534112 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.01■■■■□ 3.67
SSH3-211ENST00000534112 SHROOM2Q13796 1616 aa37.93■■■■□ 3.66
SSH3-211ENST00000534112 JPH4Q96JJ6 628 aa37.86■■■■□ 3.65
SSH3-211ENST00000534112 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
SSH3-211ENST00000534112 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
SSH3-211ENST00000534112 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.6■■■■□ 3.61
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