RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533952.5

MDK-212, Transcript of midkine, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene MDK, Length 477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDK-212ENST00000533952 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.43■■■■■ 5.5
MDK-212ENST00000533952 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.15■■■■■ 4.66
MDK-212ENST00000533952 ABCC9O60706 1549 aa43.73■■■■■ 4.59
MDK-212ENST00000533952 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.84■■■■■ 4.29
MDK-212ENST00000533952 NACADO15069 1562 aa41.66■■■■■ 4.26
MDK-212ENST00000533952 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.58■■■■■ 4.25
MDK-212ENST00000533952 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
MDK-212ENST00000533952 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
MDK-212ENST00000533952 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.86■■■■■ 4.13
MDK-212ENST00000533952 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.84■■■■■ 4.13
MDK-212ENST00000533952 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.8■■■■■ 4.12
MDK-212ENST00000533952 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.59■■■■■ 4.09
MDK-212ENST00000533952 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.56■■■■■ 4.08
MDK-212ENST00000533952 SCRIBQ14160 1630 aa40.27■■■■■ 4.04
MDK-212ENST00000533952 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.11■■■■■ 4.01
MDK-212ENST00000533952 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
MDK-212ENST00000533952 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.51■■■■□ 3.92
MDK-212ENST00000533952 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.36■■■■□ 3.89
MDK-212ENST00000533952 SMARCA4P51532 1647 aa38.46■■■■□ 3.75
MDK-212ENST00000533952 NCAPD3P42695 1498 aa38.44■■■■□ 3.74
MDK-212ENST00000533952 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.39■■■■□ 3.74
MDK-212ENST00000533952 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
MDK-212ENST00000533952 SMARCA2P51531 1590 aa38.33■■■■□ 3.73
MDK-212ENST00000533952 HMGXB3Q12766 1538 aa38.2■■■■□ 3.71
MDK-212ENST00000533952 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.09■■■■□ 3.69
MDK-212ENST00000533952 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.08■■■■□ 3.69
MDK-212ENST00000533952 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
MDK-212ENST00000533952 ERCC6Q03468 1493 aa37.77■■■■□ 3.64
MDK-212ENST00000533952 NESP48681 1621 aa37.69■■■■□ 3.62
MDK-212ENST00000533952 WIZO95785 1651 aa37.65■■■■□ 3.62
MDK-212ENST00000533952 CUX2O14529 1486 aa37.52■■■■□ 3.6
MDK-212ENST00000533952 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.51■■■■□ 3.6
MDK-212ENST00000533952 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
MDK-212ENST00000533952 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.31■■■■□ 3.56
MDK-212ENST00000533952 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.3■■■■□ 3.56
MDK-212ENST00000533952 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
MDK-212ENST00000533952 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.21■■■■□ 3.55
MDK-212ENST00000533952 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
MDK-212ENST00000533952 CFTRP13569 1480 aa36.97■■■■□ 3.51
MDK-212ENST00000533952 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.97■■■■□ 3.51
MDK-212ENST00000533952 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.94■■■■□ 3.5
MDK-212ENST00000533952 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.89■■■■□ 3.5
MDK-212ENST00000533952 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.89■■■■□ 3.5
MDK-212ENST00000533952 WDR62O43379 1518 aa36.82■■■■□ 3.48
MDK-212ENST00000533952 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.8■■■■□ 3.48
MDK-212ENST00000533952 PRDM2Q13029 1718 aa36.62■■■■□ 3.45
MDK-212ENST00000533952 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
MDK-212ENST00000533952 TOPBP1Q92547 1522 aa36.23■■■■□ 3.39
MDK-212ENST00000533952 ABCC8Q09428 1581 aa36.2■■■■□ 3.39
MDK-212ENST00000533952 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
MDK-212ENST00000533952 IFT140Q96RY7 1462 aa36.14■■■■□ 3.38
MDK-212ENST00000533952 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.14■■■■□ 3.38
MDK-212ENST00000533952 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
MDK-212ENST00000533952 OSCARQ8IYS5 282 aa35.9■■■■□ 3.34
MDK-212ENST00000533952 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
MDK-212ENST00000533952 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
MDK-212ENST00000533952 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
MDK-212ENST00000533952 CUX1P39880 1505 aa35.77■■■■□ 3.32
MDK-212ENST00000533952 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.75■■■■□ 3.312e-8■■□□□ 14.3
MDK-212ENST00000533952 SOGA1O94964 1423 aa35.74■■■■□ 3.31
MDK-212ENST00000533952 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.74■■■■□ 3.31
MDK-212ENST00000533952 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.73■■■■□ 3.31
MDK-212ENST00000533952 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
MDK-212ENST00000533952 TRIM41Q8WV44 630 aa35.57■■■■□ 3.28
MDK-212ENST00000533952 WDR97A6NE52 1622 aa35.54■■■■□ 3.28
MDK-212ENST00000533952 CHD1O14646 1710 aa35.48■■■■□ 3.27
MDK-212ENST00000533952 FBLN2P98095 1184 aa35.47■■■■□ 3.27
MDK-212ENST00000533952 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.41■■■■□ 3.26
MDK-212ENST00000533952 GRIN2BQ13224 1484 aa35.39■■■■□ 3.26
MDK-212ENST00000533952 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.37■■■■□ 3.25
MDK-212ENST00000533952 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.36■■■■□ 3.25
MDK-212ENST00000533952 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
MDK-212ENST00000533952 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.34■■■■□ 3.25
MDK-212ENST00000533952 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.34■■■■□ 3.25
MDK-212ENST00000533952 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.34■■■■□ 3.25
MDK-212ENST00000533952 TOP2BQ02880 1626 aa35.32■■■■□ 3.25
MDK-212ENST00000533952 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.32■■■■□ 3.24
MDK-212ENST00000533952 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.31■■■■□ 3.24
MDK-212ENST00000533952 ARHGEF11O15085 1522 aa35.29■■■■□ 3.24
MDK-212ENST00000533952 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
MDK-212ENST00000533952 SYNJ1O43426 1573 aa35.28■■■■□ 3.24
MDK-212ENST00000533952 PBRM1Q86U86 1689 aa35.25■■■■□ 3.23
MDK-212ENST00000533952 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.24■■■■□ 3.23
MDK-212ENST00000533952 SYNJ2O15056 1496 aa35.22■■■■□ 3.23
MDK-212ENST00000533952 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.08■■■■□ 3.21
MDK-212ENST00000533952 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.03■■■■□ 3.2
MDK-212ENST00000533952 ARAP1Q96P48 1450 aa34.97■■■■□ 3.19
MDK-212ENST00000533952 ADAMTS12P58397 1594 aa34.96■■■■□ 3.19
MDK-212ENST00000533952 GRIN2AQ12879 1464 aa34.93■■■■□ 3.18
MDK-212ENST00000533952 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.92■■■■□ 3.18
MDK-212ENST00000533952 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.9■■■■□ 3.18
MDK-212ENST00000533952 NUP160Q12769 1436 aa34.79■■■■□ 3.16
MDK-212ENST00000533952 CEP170Q5SW79 1584 aa34.76■■■■□ 3.16
MDK-212ENST00000533952 KIF27Q86VH2 1401 aa34.68■■■■□ 3.14
MDK-212ENST00000533952 IGF1RP08069 1367 aa34.58■■■■□ 3.13
MDK-212ENST00000533952 SHROOM2Q13796 1616 aa34.56■■■■□ 3.12
MDK-212ENST00000533952 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.56■■■■□ 3.12
MDK-212ENST00000533952 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
MDK-212ENST00000533952 CUL7Q14999 1698 aa34.5■■■■□ 3.11
MDK-212ENST00000533952 JPH4Q96JJ6 628 aa34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms