RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532827.1

C8orf82-204, Transcript of chromosome 8 open reading frame 82, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene C8orf82, Length 802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf82-204ENST00000532827 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.18■■■■■ 6.74
C8orf82-204ENST00000532827 ABCC9O60706 1549 aa51.5■■■■■ 5.84
C8orf82-204ENST00000532827 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.44■■■■■ 5.83
C8orf82-204ENST00000532827 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.99■■■■■ 5.43
C8orf82-204ENST00000532827 NACADO15069 1562 aa48.6■■■■■ 5.37
C8orf82-204ENST00000532827 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.45■■■■■ 5.35
C8orf82-204ENST00000532827 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.17■■■■■ 5.3
C8orf82-204ENST00000532827 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.15■■■■■ 5.3
C8orf82-204ENST00000532827 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.87■■■■■ 5.25
C8orf82-204ENST00000532827 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.85■■■■■ 5.25
C8orf82-204ENST00000532827 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.71■■■■■ 5.23
C8orf82-204ENST00000532827 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
C8orf82-204ENST00000532827 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.2■■■■■ 5.15
C8orf82-204ENST00000532827 SCRIBQ14160 1630 aa46.94■■■■■ 5.11
C8orf82-204ENST00000532827 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.93■■■■■ 5.1
C8orf82-204ENST00000532827 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.56■■■■■ 5.04
C8orf82-204ENST00000532827 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.42■■■■■ 5.02
C8orf82-204ENST00000532827 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.42■■■■■ 5.02
C8orf82-204ENST00000532827 NCAPD3P42695 1498 aa44.82■■■■■ 4.77
C8orf82-204ENST00000532827 SMARCA4P51532 1647 aa44.71■■■■■ 4.75
C8orf82-204ENST00000532827 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.67■■■■■ 4.74
C8orf82-204ENST00000532827 SMARCA2P51531 1590 aa44.59■■■■■ 4.73
C8orf82-204ENST00000532827 HMGXB3Q12766 1538 aa44.55■■■■■ 4.72
C8orf82-204ENST00000532827 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.54■■■■■ 4.72
C8orf82-204ENST00000532827 ERCC6Q03468 1493 aa44.5■■■■■ 4.71
C8orf82-204ENST00000532827 CUX2O14529 1486 aa44.48■■■■■ 4.71
C8orf82-204ENST00000532827 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
C8orf82-204ENST00000532827 NESP48681 1621 aa44.32■■■■■ 4.69
C8orf82-204ENST00000532827 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
C8orf82-204ENST00000532827 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.22■■■■■ 4.67
C8orf82-204ENST00000532827 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.19■■■■■ 4.66
C8orf82-204ENST00000532827 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
C8orf82-204ENST00000532827 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.91■■■■■ 4.62
C8orf82-204ENST00000532827 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.81■■■■■ 4.6
C8orf82-204ENST00000532827 WIZO95785 1651 aa43.72■■■■■ 4.59
C8orf82-204ENST00000532827 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.59■■■■■ 4.57
C8orf82-204ENST00000532827 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.43■■■■■ 4.54
C8orf82-204ENST00000532827 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.27■■■■■ 4.52
C8orf82-204ENST00000532827 WDR62O43379 1518 aa43.2■■■■■ 4.51
C8orf82-204ENST00000532827 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.49
C8orf82-204ENST00000532827 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.06■■■■■ 4.48
C8orf82-204ENST00000532827 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
C8orf82-204ENST00000532827 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.99■■■■■ 4.47
C8orf82-204ENST00000532827 CFTRP13569 1480 aa42.94■■■■■ 4.46
C8orf82-204ENST00000532827 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
C8orf82-204ENST00000532827 PRDM2Q13029 1718 aa42.67■■■■■ 4.42
C8orf82-204ENST00000532827 TRIM41Q8WV44 630 aa42.54■■■■■ 4.4
C8orf82-204ENST00000532827 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.51■■■■■ 4.4
C8orf82-204ENST00000532827 OSCARQ8IYS5 282 aa42.32■■■■■ 4.37
C8orf82-204ENST00000532827 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
C8orf82-204ENST00000532827 IFT140Q96RY7 1462 aa42.2■■■■■ 4.35
C8orf82-204ENST00000532827 TOPBP1Q92547 1522 aa42.17■■■■■ 4.34
C8orf82-204ENST00000532827 ABCC8Q09428 1581 aa42.04■■■■■ 4.32
C8orf82-204ENST00000532827 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.03■■■■■ 4.32
C8orf82-204ENST00000532827 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
C8orf82-204ENST00000532827 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.93■■■■■ 4.3
C8orf82-204ENST00000532827 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.93■■■■■ 4.3
C8orf82-204ENST00000532827 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.93■■■■■ 4.3
C8orf82-204ENST00000532827 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
C8orf82-204ENST00000532827 CHD1O14646 1710 aa41.78■■■■■ 4.28
C8orf82-204ENST00000532827 ARHGEF11O15085 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
C8orf82-204ENST00000532827 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
C8orf82-204ENST00000532827 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.73■■■■■ 4.27
C8orf82-204ENST00000532827 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.66■■■■■ 4.26
C8orf82-204ENST00000532827 CUX1P39880 1505 aa41.52■■■■■ 4.24
C8orf82-204ENST00000532827 SOGA1O94964 1423 aa41.48■■■■■ 4.23
C8orf82-204ENST00000532827 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
C8orf82-204ENST00000532827 FBLN2P98095 1184 aa41.43■■■■■ 4.22
C8orf82-204ENST00000532827 WDR97A6NE52 1622 aa41.43■■■■■ 4.22
C8orf82-204ENST00000532827 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
C8orf82-204ENST00000532827 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.34■■■■■ 4.21
C8orf82-204ENST00000532827 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.34■■■■■ 4.21
C8orf82-204ENST00000532827 ARAP1Q96P48 1450 aa41.32■■■■■ 4.2
C8orf82-204ENST00000532827 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
C8orf82-204ENST00000532827 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.2■■■■■ 4.19
C8orf82-204ENST00000532827 GRIN2BQ13224 1484 aa41.17■■■■■ 4.18
C8orf82-204ENST00000532827 PBRM1Q86U86 1689 aa41.17■■■■■ 4.18
C8orf82-204ENST00000532827 SYNJ1O43426 1573 aa41.16■■■■■ 4.18
C8orf82-204ENST00000532827 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
C8orf82-204ENST00000532827 SYNJ2O15056 1496 aa41.08■■■■■ 4.17
C8orf82-204ENST00000532827 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.04■■■■■ 4.16
C8orf82-204ENST00000532827 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
C8orf82-204ENST00000532827 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.01■■■■■ 4.16
C8orf82-204ENST00000532827 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.96■■■■■ 4.15
C8orf82-204ENST00000532827 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
C8orf82-204ENST00000532827 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.82■■■■■ 4.12
C8orf82-204ENST00000532827 TOP2BQ02880 1626 aa40.74■■■■■ 4.11
C8orf82-204ENST00000532827 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.73■■■■■ 4.11
C8orf82-204ENST00000532827 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.73■■■■■ 4.11
C8orf82-204ENST00000532827 ADAMTS12P58397 1594 aa40.72■■■■■ 4.11
C8orf82-204ENST00000532827 GRIN2AQ12879 1464 aa40.66■■■■■ 4.1
C8orf82-204ENST00000532827 CEP170Q5SW79 1584 aa40.65■■■■■ 4.1
C8orf82-204ENST00000532827 NUP160Q12769 1436 aa40.52■■■■■ 4.08
C8orf82-204ENST00000532827 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.47■■■■■ 4.07
C8orf82-204ENST00000532827 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.46■■■■■ 4.07
C8orf82-204ENST00000532827 SHROOM2Q13796 1616 aa40.43■■■■■ 4.06
C8orf82-204ENST00000532827 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.17■■■■■ 4.02
C8orf82-204ENST00000532827 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
C8orf82-204ENST00000532827 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.03■■■■■ 4
C8orf82-204ENST00000532827 JPH4Q96JJ6 628 aa40.02■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms