RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.99■■■■■ 4.79
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.03■■■■□ 3.84
TSTA3-214ENST00000531473 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
TSTA3-214ENST00000531473 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.52■■■■□ 3.6
TSTA3-214ENST00000531473 ABCC9O60706 1549 aa37.34■■■■□ 3.57
TSTA3-214ENST00000531473 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.12■■■■□ 3.53
TSTA3-214ENST00000531473 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.97■■■■□ 3.51
TSTA3-214ENST00000531473 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.47■■■■□ 3.43
TSTA3-214ENST00000531473 NACADO15069 1562 aa36.39■■■■□ 3.42
TSTA3-214ENST00000531473 SCRIBQ14160 1630 aa36.25■■■■□ 3.39
TSTA3-214ENST00000531473 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.12■■■■□ 3.37
TSTA3-214ENST00000531473 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
TSTA3-214ENST00000531473 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.6■■■■□ 3.29
TSTA3-214ENST00000531473 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.33■■■■□ 3.252e-7■■■■□ 25
TSTA3-214ENST00000531473 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.23■■■■□ 3.23
TSTA3-214ENST00000531473 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.18■■■■□ 3.22
TSTA3-214ENST00000531473 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
TSTA3-214ENST00000531473 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.9■■■■□ 3.18
TSTA3-214ENST00000531473 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
TSTA3-214ENST00000531473 WIZO95785 1651 aa34.64■■■■□ 3.14
TSTA3-214ENST00000531473 SMARCA4P51532 1647 aa34.59■■■■□ 3.13
TSTA3-214ENST00000531473 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
TSTA3-214ENST00000531473 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
TSTA3-214ENST00000531473 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.05■■■■□ 3.04
TSTA3-214ENST00000531473 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.04■■■■□ 3.04
TSTA3-214ENST00000531473 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.98■■■■□ 3.03
TSTA3-214ENST00000531473 SMARCA2P51531 1590 aa33.88■■■■□ 3.01
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.87■■■■□ 3.01
TSTA3-214ENST00000531473 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
TSTA3-214ENST00000531473 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.67■■■□□ 2.98
TSTA3-214ENST00000531473 NCAPD3P42695 1498 aa33.66■■■□□ 2.98
TSTA3-214ENST00000531473 HMGXB3Q12766 1538 aa33.56■■■□□ 2.96
TSTA3-214ENST00000531473 TRIM41Q8WV44 630 aa33.32■■■□□ 2.92
TSTA3-214ENST00000531473 ABCC8Q09428 1581 aa33.29■■■□□ 2.92
TSTA3-214ENST00000531473 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.25■■■□□ 2.91
TSTA3-214ENST00000531473 HRCP23327 699 aa33.02■■■□□ 2.88
TSTA3-214ENST00000531473 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
TSTA3-214ENST00000531473 CFTRP13569 1480 aa32.96■■■□□ 2.87
TSTA3-214ENST00000531473 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.89■■■□□ 2.86
TSTA3-214ENST00000531473 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.88■■■□□ 2.85
TSTA3-214ENST00000531473 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.86■■■□□ 2.85
TSTA3-214ENST00000531473 SYNJ1O43426 1573 aa32.85■■■□□ 2.85
TSTA3-214ENST00000531473 NESP48681 1621 aa32.83■■■□□ 2.85
TSTA3-214ENST00000531473 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.71■■■□□ 2.83
TSTA3-214ENST00000531473 PRDM2Q13029 1718 aa32.68■■■□□ 2.82
TSTA3-214ENST00000531473 SOGA1O94964 1423 aa32.65■■■□□ 2.82
TSTA3-214ENST00000531473 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.6■■■□□ 2.81
TSTA3-214ENST00000531473 CUX1P39880 1505 aa32.6■■■□□ 2.81
TSTA3-214ENST00000531473 TOP2BQ02880 1626 aa32.56■■■□□ 2.8
TSTA3-214ENST00000531473 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.55■■■□□ 2.8
TSTA3-214ENST00000531473 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.49■■■□□ 2.79
TSTA3-214ENST00000531473 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.47■■■□□ 2.79
TSTA3-214ENST00000531473 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.3■■■□□ 2.76
TSTA3-214ENST00000531473 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.29■■■□□ 2.76
TSTA3-214ENST00000531473 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.26■■■□□ 2.76
TSTA3-214ENST00000531473 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.25■■■□□ 2.75
TSTA3-214ENST00000531473 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.23■■■□□ 2.75
TSTA3-214ENST00000531473 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
TSTA3-214ENST00000531473 TOPBP1Q92547 1522 aa32.19■■■□□ 2.74
TSTA3-214ENST00000531473 EEA1Q15075 1411 aa32.17■■■□□ 2.74
TSTA3-214ENST00000531473 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.16■■■□□ 2.74
TSTA3-214ENST00000531473 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.14■■■□□ 2.74
TSTA3-214ENST00000531473 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.09■■■□□ 2.73
TSTA3-214ENST00000531473 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
TSTA3-214ENST00000531473 CUX2O14529 1486 aa32.03■■■□□ 2.72
TSTA3-214ENST00000531473 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
TSTA3-214ENST00000531473 KIF27Q86VH2 1401 aa31.98■■■□□ 2.71
TSTA3-214ENST00000531473 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
TSTA3-214ENST00000531473 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
TSTA3-214ENST00000531473 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.93■■■□□ 2.7
TSTA3-214ENST00000531473 GOLGA3Q08378 1498 aa31.9■■■□□ 2.7
TSTA3-214ENST00000531473 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.88■■■□□ 2.69
TSTA3-214ENST00000531473 KIF21BO75037 1637 aa31.88■■■□□ 2.69
TSTA3-214ENST00000531473 ERCC6Q03468 1493 aa31.87■■■□□ 2.69
TSTA3-214ENST00000531473 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.83■■■□□ 2.69
TSTA3-214ENST00000531473 IGF1RP08069 1367 aa31.81■■■□□ 2.68
TSTA3-214ENST00000531473 PRXQ9BXM0 1461 aa31.81■■■□□ 2.68
TSTA3-214ENST00000531473 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.8■■■□□ 2.68
TSTA3-214ENST00000531473 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
TSTA3-214ENST00000531473 CEP162Q5TB80 1403 aa31.75■■■□□ 2.67
TSTA3-214ENST00000531473 WDR97A6NE52 1622 aa31.74■■■□□ 2.67
TSTA3-214ENST00000531473 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
TSTA3-214ENST00000531473 WDR62O43379 1518 aa31.71■■■□□ 2.67
TSTA3-214ENST00000531473 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
TSTA3-214ENST00000531473 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
TSTA3-214ENST00000531473 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.63■■■□□ 2.65
TSTA3-214ENST00000531473 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.63■■■□□ 2.65
TSTA3-214ENST00000531473 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
TSTA3-214ENST00000531473 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.6■■■□□ 2.65
TSTA3-214ENST00000531473 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.57■■■□□ 2.647e-7■■■■■ 34.5
TSTA3-214ENST00000531473 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.57■■■□□ 2.64
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
TSTA3-214ENST00000531473 CLIP1P30622 1438 aa31.47■■■□□ 2.63
TSTA3-214ENST00000531473 IFT140Q96RY7 1462 aa31.45■■■□□ 2.63
TSTA3-214ENST00000531473 CUL7Q14999 1698 aa31.38■■■□□ 2.61
TSTA3-214ENST00000531473 PBRM1Q86U86 1689 aa31.37■■■□□ 2.61
TSTA3-214ENST00000531473 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
TSTA3-214ENST00000531473 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
TSTA3-214ENST00000531473 GRIN2BQ13224 1484 aa31.26■■■□□ 2.59
TSTA3-214ENST00000531473 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 393.1 ms