RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530270.2

RAB30-AS1-205, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB30-AS1, Length 1,116 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-205ENST00000530270 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.9■■■■□ 3.18
RAB30-AS1-205ENST00000530270 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
RAB30-AS1-205ENST00000530270 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
RAB30-AS1-205ENST00000530270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.32■■■□□ 2.28
RAB30-AS1-205ENST00000530270 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.51■■■□□ 2.15
RAB30-AS1-205ENST00000530270 FOXD1Q16676 465 aa27.63■■■□□ 2.01
RAB30-AS1-205ENST00000530270 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.01■■□□□ 1.91
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ADRA2BP18089 450 aa26.96■■□□□ 1.91
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.52■■□□□ 1.84
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ABCC9O60706 1549 aa26.4■■□□□ 1.82
RAB30-AS1-205ENST00000530270 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
RAB30-AS1-205ENST00000530270 MSH5O43196 834 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB30-AS1-205ENST00000530270 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB30-AS1-205ENST00000530270 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.2■■□□□ 1.62
RAB30-AS1-205ENST00000530270 KCNA4P22459 653 aa25.17■■□□□ 1.62
RAB30-AS1-205ENST00000530270 NACADO15069 1562 aa25.01■■□□□ 1.59
RAB30-AS1-205ENST00000530270 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.72■■□□□ 1.55
RAB30-AS1-205ENST00000530270 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.69■■□□□ 1.54
RAB30-AS1-205ENST00000530270 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.65■■□□□ 1.54
RAB30-AS1-205ENST00000530270 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.64■■□□□ 1.53
RAB30-AS1-205ENST00000530270 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
RAB30-AS1-205ENST00000530270 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RAB30-AS1-205ENST00000530270 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
RAB30-AS1-205ENST00000530270 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.42■■□□□ 1.5
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.38■■□□□ 1.49
RAB30-AS1-205ENST00000530270 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RAB30-AS1-205ENST00000530270 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RAB30-AS1-205ENST00000530270 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.28■■□□□ 1.48
RAB30-AS1-205ENST00000530270 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.19■■□□□ 1.46
RAB30-AS1-205ENST00000530270 SCRIBQ14160 1630 aa24.05■■□□□ 1.44
RAB30-AS1-205ENST00000530270 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.92■■□□□ 1.42
RAB30-AS1-205ENST00000530270 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.88■■□□□ 1.41
RAB30-AS1-205ENST00000530270 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.85■■□□□ 1.41
RAB30-AS1-205ENST00000530270 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.81■■□□□ 1.4
RAB30-AS1-205ENST00000530270 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
RAB30-AS1-205ENST00000530270 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ZBTB22O15209 634 aa23.21■■□□□ 1.31
RAB30-AS1-205ENST00000530270 NCAPD3P42695 1498 aa23■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-205ENST00000530270 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-205ENST00000530270 SMARCA4P51532 1647 aa22.96■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-205ENST00000530270 SMARCA2P51531 1590 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB30-AS1-205ENST00000530270 HMGXB3Q12766 1538 aa22.92■■□□□ 1.26
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.92■■□□□ 1.26
RAB30-AS1-205ENST00000530270 SLC4A2P04920 1241 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CUX2O14529 1486 aa22.88■■□□□ 1.25
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ERCC6Q03468 1493 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB30-AS1-205ENST00000530270 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RAB30-AS1-205ENST00000530270 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-205ENST00000530270 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RAB30-AS1-205ENST00000530270 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.74■■□□□ 1.23
RAB30-AS1-205ENST00000530270 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.7■■□□□ 1.22
RAB30-AS1-205ENST00000530270 NESP48681 1621 aa22.64■■□□□ 1.22
RAB30-AS1-205ENST00000530270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.6■■□□□ 1.21
RAB30-AS1-205ENST00000530270 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB30-AS1-205ENST00000530270 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RAB30-AS1-205ENST00000530270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.5■■□□□ 1.19
RAB30-AS1-205ENST00000530270 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
RAB30-AS1-205ENST00000530270 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.4■■□□□ 1.18
RAB30-AS1-205ENST00000530270 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
RAB30-AS1-205ENST00000530270 WIZO95785 1651 aa22.35■■□□□ 1.17
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.27■■□□□ 1.16
RAB30-AS1-205ENST00000530270 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB30-AS1-205ENST00000530270 WDR62O43379 1518 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB30-AS1-205ENST00000530270 POTEDQ86YR6 584 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB30-AS1-205ENST00000530270 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB30-AS1-205ENST00000530270 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RAB30-AS1-205ENST00000530270 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB30-AS1-205ENST00000530270 PRDM2Q13029 1718 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CFTRP13569 1480 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB30-AS1-205ENST00000530270 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RAB30-AS1-205ENST00000530270 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RAB30-AS1-205ENST00000530270 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RAB30-AS1-205ENST00000530270 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RAB30-AS1-205ENST00000530270 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RAB30-AS1-205ENST00000530270 TRIM41Q8WV44 630 aa21.78■■□□□ 1.08
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.74■■□□□ 1.07
RAB30-AS1-205ENST00000530270 RNF39Q9H2S5 420 aa21.72■■□□□ 1.07
RAB30-AS1-205ENST00000530270 OSCARQ8IYS5 282 aa21.71■■□□□ 1.07
RAB30-AS1-205ENST00000530270 IFT140Q96RY7 1462 aa21.68■■□□□ 1.06
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ABCC8Q09428 1581 aa21.65■■□□□ 1.06
RAB30-AS1-205ENST00000530270 TOPBP1Q92547 1522 aa21.65■■□□□ 1.06
RAB30-AS1-205ENST00000530270 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.61■■□□□ 1.05
RAB30-AS1-205ENST00000530270 APLP2Q06481 763 aa21.6■■□□□ 1.05
RAB30-AS1-205ENST00000530270 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
RAB30-AS1-205ENST00000530270 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.55■■□□□ 1.04
RAB30-AS1-205ENST00000530270 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.55■■□□□ 1.04
RAB30-AS1-205ENST00000530270 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.55■■□□□ 1.04
RAB30-AS1-205ENST00000530270 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RAB30-AS1-205ENST00000530270 CHD1O14646 1710 aa21.49■■□□□ 1.03
RAB30-AS1-205ENST00000530270 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RAB30-AS1-205ENST00000530270 ARHGEF11O15085 1522 aa21.44■■□□□ 1.02
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