RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.55■■■■■ 5.2
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.33■■■■■ 4.37
SLC43A3-217ENST00000530005 ABCC9O60706 1549 aa41.58■■■■■ 4.25
SLC43A3-217ENST00000530005 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.91■■■■□ 3.98
SLC43A3-217ENST00000530005 NACADO15069 1562 aa39.84■■■■□ 3.97
SLC43A3-217ENST00000530005 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.67■■■■□ 3.94
SLC43A3-217ENST00000530005 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.59■■■■□ 3.93
SLC43A3-217ENST00000530005 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
SLC43A3-217ENST00000530005 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.35■■■■□ 3.89
SLC43A3-217ENST00000530005 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.05■■■■□ 3.84
SLC43A3-217ENST00000530005 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.82■■■■□ 3.81
SLC43A3-217ENST00000530005 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.8■■■■□ 3.8
SLC43A3-217ENST00000530005 SCRIBQ14160 1630 aa38.59■■■■□ 3.77
SLC43A3-217ENST00000530005 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.42■■■■□ 3.74
SLC43A3-217ENST00000530005 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.32■■■■□ 3.73
SLC43A3-217ENST00000530005 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
SLC43A3-217ENST00000530005 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.62■■■■□ 3.61
SLC43A3-217ENST00000530005 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.39■■■■□ 3.58
SLC43A3-217ENST00000530005 SMARCA4P51532 1647 aa36.92■■■■□ 3.5
SLC43A3-217ENST00000530005 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
SLC43A3-217ENST00000530005 NCAPD3P42695 1498 aa36.8■■■■□ 3.48
SLC43A3-217ENST00000530005 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.78■■■■□ 3.48
SLC43A3-217ENST00000530005 SMARCA2P51531 1590 aa36.69■■■■□ 3.46
SLC43A3-217ENST00000530005 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.66■■■■□ 3.46
SLC43A3-217ENST00000530005 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.6■■■■□ 3.45
SLC43A3-217ENST00000530005 HMGXB3Q12766 1538 aa36.59■■■■□ 3.45
SLC43A3-217ENST00000530005 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
SLC43A3-217ENST00000530005 WIZO95785 1651 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC43A3-217ENST00000530005 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
SLC43A3-217ENST00000530005 NESP48681 1621 aa35.96■■■■□ 3.35
SLC43A3-217ENST00000530005 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.33
SLC43A3-217ENST00000530005 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.82■■■■□ 3.33
SLC43A3-217ENST00000530005 ERCC6Q03468 1493 aa35.8■■■■□ 3.32
SLC43A3-217ENST00000530005 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.69■■■■□ 3.3
SLC43A3-217ENST00000530005 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.57■■■■□ 3.28
SLC43A3-217ENST00000530005 CUX2O14529 1486 aa35.55■■■■□ 3.28
SLC43A3-217ENST00000530005 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.5■■■■□ 3.27
SLC43A3-217ENST00000530005 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
SLC43A3-217ENST00000530005 CFTRP13569 1480 aa35.46■■■■□ 3.27
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.41■■■■□ 3.26
SLC43A3-217ENST00000530005 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.27■■■■□ 3.24
SLC43A3-217ENST00000530005 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.23■■■■□ 3.23
SLC43A3-217ENST00000530005 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.23■■■■□ 3.23
SLC43A3-217ENST00000530005 WDR62O43379 1518 aa35.14■■■■□ 3.22
SLC43A3-217ENST00000530005 PRDM2Q13029 1718 aa35.14■■■■□ 3.22
SLC43A3-217ENST00000530005 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
SLC43A3-217ENST00000530005 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
SLC43A3-217ENST00000530005 TOPBP1Q92547 1522 aa34.7■■■■□ 3.15
SLC43A3-217ENST00000530005 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.7■■■■□ 3.15
SLC43A3-217ENST00000530005 ABCC8Q09428 1581 aa34.65■■■■□ 3.14
SLC43A3-217ENST00000530005 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.63■■■■□ 3.13
SLC43A3-217ENST00000530005 IFT140Q96RY7 1462 aa34.51■■■■□ 3.11
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
SLC43A3-217ENST00000530005 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
SLC43A3-217ENST00000530005 CUX1P39880 1505 aa34.4■■■■□ 3.1
SLC43A3-217ENST00000530005 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
SLC43A3-217ENST00000530005 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC43A3-217ENST00000530005 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.25■■■■□ 3.07
SLC43A3-217ENST00000530005 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
SLC43A3-217ENST00000530005 SOGA1O94964 1423 aa34.22■■■■□ 3.07
SLC43A3-217ENST00000530005 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.17■■■■□ 3.061e-8■■■■■ 37.2
SLC43A3-217ENST00000530005 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
SLC43A3-217ENST00000530005 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.06■■■■□ 3.04
SLC43A3-217ENST00000530005 WDR97A6NE52 1622 aa34.04■■■■□ 3.04
SLC43A3-217ENST00000530005 TOP2BQ02880 1626 aa34.03■■■■□ 3.04
SLC43A3-217ENST00000530005 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.03■■■■□ 3.04
SLC43A3-217ENST00000530005 SYNJ1O43426 1573 aa34.02■■■■□ 3.04
SLC43A3-217ENST00000530005 OSCARQ8IYS5 282 aa34.02■■■■□ 3.04
SLC43A3-217ENST00000530005 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.95■■■■□ 3.03
SLC43A3-217ENST00000530005 GRIN2BQ13224 1484 aa33.85■■■■□ 3.01
SLC43A3-217ENST00000530005 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.84■■■■□ 3.01
SLC43A3-217ENST00000530005 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.84■■■■□ 3.01
SLC43A3-217ENST00000530005 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.84■■■■□ 3.01
SLC43A3-217ENST00000530005 CHD1O14646 1710 aa33.83■■■■□ 3.01
SLC43A3-217ENST00000530005 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
SLC43A3-217ENST00000530005 PBRM1Q86U86 1689 aa33.76■■■■□ 3
SLC43A3-217ENST00000530005 FBLN2P98095 1184 aa33.7■■■□□ 2.99
SLC43A3-217ENST00000530005 SYNJ2O15056 1496 aa33.66■■■□□ 2.98
SLC43A3-217ENST00000530005 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
SLC43A3-217ENST00000530005 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.53■■■□□ 2.96
SLC43A3-217ENST00000530005 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.52■■■□□ 2.96
SLC43A3-217ENST00000530005 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.52■■■□□ 2.96
SLC43A3-217ENST00000530005 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.52■■■□□ 2.96
SLC43A3-217ENST00000530005 ADAMTS12P58397 1594 aa33.51■■■□□ 2.96
SLC43A3-217ENST00000530005 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.51■■■□□ 2.95
SLC43A3-217ENST00000530005 ARHGEF11O15085 1522 aa33.5■■■□□ 2.95
SLC43A3-217ENST00000530005 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.44■■■□□ 2.94
SLC43A3-217ENST00000530005 GRIN2AQ12879 1464 aa33.43■■■□□ 2.94
SLC43A3-217ENST00000530005 TRIM41Q8WV44 630 aa33.38■■■□□ 2.93
SLC43A3-217ENST00000530005 KIF27Q86VH2 1401 aa33.35■■■□□ 2.93
SLC43A3-217ENST00000530005 NUP160Q12769 1436 aa33.33■■■□□ 2.93
SLC43A3-217ENST00000530005 IGF1RP08069 1367 aa33.29■■■□□ 2.92
SLC43A3-217ENST00000530005 CEP170Q5SW79 1584 aa33.29■■■□□ 2.92
SLC43A3-217ENST00000530005 ARAP1Q96P48 1450 aa33.24■■■□□ 2.91
SLC43A3-217ENST00000530005 CUL7Q14999 1698 aa33.16■■■□□ 2.9
SLC43A3-217ENST00000530005 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.16■■■□□ 2.9
SLC43A3-217ENST00000530005 SHROOM2Q13796 1616 aa33.09■■■□□ 2.89
SLC43A3-217ENST00000530005 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.05■■■□□ 2.88
SLC43A3-217ENST00000530005 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.05■■■□□ 2.88
SLC43A3-217ENST00000530005 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.04■■■□□ 2.88
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