RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529518.1

AC068389.2-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC068389.2, Length 430 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC068389.2-201ENST00000529518 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.3■■■■■ 4.36
AC068389.2-201ENST00000529518 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.64■■■■□ 3.62
AC068389.2-201ENST00000529518 ABCC9O60706 1549 aa36.94■■■■□ 3.5
AC068389.2-201ENST00000529518 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.47■■■■□ 3.27
AC068389.2-201ENST00000529518 NACADO15069 1562 aa35.41■■■■□ 3.26
AC068389.2-201ENST00000529518 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.33■■■■□ 3.25
AC068389.2-201ENST00000529518 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
AC068389.2-201ENST00000529518 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.17■■■■□ 3.22
AC068389.2-201ENST00000529518 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.99■■■■□ 3.19
AC068389.2-201ENST00000529518 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.72■■■■□ 3.15
AC068389.2-201ENST00000529518 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.5■■■■□ 3.11
AC068389.2-201ENST00000529518 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.45■■■■□ 3.11
AC068389.2-201ENST00000529518 SCRIBQ14160 1630 aa34.34■■■■□ 3.09
AC068389.2-201ENST00000529518 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.04■■■■□ 3.04
AC068389.2-201ENST00000529518 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.02■■■■□ 3.04
AC068389.2-201ENST00000529518 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
AC068389.2-201ENST00000529518 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.41■■■□□ 2.94
AC068389.2-201ENST00000529518 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.19■■■□□ 2.9
AC068389.2-201ENST00000529518 SMARCA4P51532 1647 aa32.84■■■□□ 2.85
AC068389.2-201ENST00000529518 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
AC068389.2-201ENST00000529518 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.69■■■□□ 2.82
AC068389.2-201ENST00000529518 NCAPD3P42695 1498 aa32.68■■■□□ 2.82
AC068389.2-201ENST00000529518 SMARCA2P51531 1590 aa32.62■■■□□ 2.81
AC068389.2-201ENST00000529518 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.62■■■□□ 2.81
AC068389.2-201ENST00000529518 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.53■■■□□ 2.8
AC068389.2-201ENST00000529518 HMGXB3Q12766 1538 aa32.51■■■□□ 2.8
AC068389.2-201ENST00000529518 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
AC068389.2-201ENST00000529518 WIZO95785 1651 aa32.25■■■□□ 2.75
AC068389.2-201ENST00000529518 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
AC068389.2-201ENST00000529518 NESP48681 1621 aa31.95■■■□□ 2.71
AC068389.2-201ENST00000529518 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
AC068389.2-201ENST00000529518 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.83■■■□□ 2.69
AC068389.2-201ENST00000529518 ERCC6Q03468 1493 aa31.81■■■□□ 2.68
AC068389.2-201ENST00000529518 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.71■■■□□ 2.67
AC068389.2-201ENST00000529518 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.59■■■□□ 2.65
AC068389.2-201ENST00000529518 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.57■■■□□ 2.64
AC068389.2-201ENST00000529518 CUX2O14529 1486 aa31.53■■■□□ 2.64
AC068389.2-201ENST00000529518 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.52■■■□□ 2.64
AC068389.2-201ENST00000529518 CFTRP13569 1480 aa31.52■■■□□ 2.64
AC068389.2-201ENST00000529518 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
AC068389.2-201ENST00000529518 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.36■■■□□ 2.61
AC068389.2-201ENST00000529518 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.32■■■□□ 2.6
AC068389.2-201ENST00000529518 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.3■■■□□ 2.6
AC068389.2-201ENST00000529518 PRDM2Q13029 1718 aa31.27■■■□□ 2.6
AC068389.2-201ENST00000529518 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
AC068389.2-201ENST00000529518 WDR62O43379 1518 aa31.22■■■□□ 2.59
AC068389.2-201ENST00000529518 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
AC068389.2-201ENST00000529518 TOPBP1Q92547 1522 aa30.85■■■□□ 2.53
AC068389.2-201ENST00000529518 ABCC8Q09428 1581 aa30.8■■■□□ 2.52
AC068389.2-201ENST00000529518 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.8■■■□□ 2.52
AC068389.2-201ENST00000529518 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.69■■■□□ 2.5
AC068389.2-201ENST00000529518 IFT140Q96RY7 1462 aa30.67■■■□□ 2.5
AC068389.2-201ENST00000529518 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
AC068389.2-201ENST00000529518 CUX1P39880 1505 aa30.58■■■□□ 2.49
AC068389.2-201ENST00000529518 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
AC068389.2-201ENST00000529518 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
AC068389.2-201ENST00000529518 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.5■■■□□ 2.47
AC068389.2-201ENST00000529518 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.46■■■□□ 2.47
AC068389.2-201ENST00000529518 SOGA1O94964 1423 aa30.44■■■□□ 2.46
AC068389.2-201ENST00000529518 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
AC068389.2-201ENST00000529518 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.45
AC068389.2-201ENST00000529518 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.33■■■□□ 2.45
AC068389.2-201ENST00000529518 TOP2BQ02880 1626 aa30.29■■■□□ 2.44
AC068389.2-201ENST00000529518 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
AC068389.2-201ENST00000529518 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.29■■■□□ 2.44
AC068389.2-201ENST00000529518 SYNJ1O43426 1573 aa30.29■■■□□ 2.44
AC068389.2-201ENST00000529518 WDR97A6NE52 1622 aa30.27■■■□□ 2.44
AC068389.2-201ENST00000529518 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.19■■■□□ 2.42
AC068389.2-201ENST00000529518 OSCARQ8IYS5 282 aa30.19■■■□□ 2.42
AC068389.2-201ENST00000529518 GRIN2BQ13224 1484 aa30.1■■■□□ 2.41
AC068389.2-201ENST00000529518 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.1■■■□□ 2.41
AC068389.2-201ENST00000529518 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.09■■■□□ 2.41
AC068389.2-201ENST00000529518 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.08■■■□□ 2.41
AC068389.2-201ENST00000529518 CHD1O14646 1710 aa30.08■■■□□ 2.41
AC068389.2-201ENST00000529518 PBRM1Q86U86 1689 aa30.05■■■□□ 2.4
AC068389.2-201ENST00000529518 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
AC068389.2-201ENST00000529518 FBLN2P98095 1184 aa29.98■■■□□ 2.39
AC068389.2-201ENST00000529518 SYNJ2O15056 1496 aa29.92■■■□□ 2.38
AC068389.2-201ENST00000529518 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
AC068389.2-201ENST00000529518 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.81■■■□□ 2.36
AC068389.2-201ENST00000529518 ADAMTS12P58397 1594 aa29.81■■■□□ 2.36
AC068389.2-201ENST00000529518 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.76■■■□□ 2.35
AC068389.2-201ENST00000529518 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.76■■■□□ 2.35
AC068389.2-201ENST00000529518 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.76■■■□□ 2.35
AC068389.2-201ENST00000529518 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.76■■■□□ 2.35
AC068389.2-201ENST00000529518 ARHGEF11O15085 1522 aa29.74■■■□□ 2.35
AC068389.2-201ENST00000529518 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.73■■■□□ 2.35
AC068389.2-201ENST00000529518 GRIN2AQ12879 1464 aa29.73■■■□□ 2.35
AC068389.2-201ENST00000529518 KIF27Q86VH2 1401 aa29.7■■■□□ 2.34
AC068389.2-201ENST00000529518 TRIM41Q8WV44 630 aa29.62■■■□□ 2.33
AC068389.2-201ENST00000529518 IGF1RP08069 1367 aa29.61■■■□□ 2.33
AC068389.2-201ENST00000529518 NUP160Q12769 1436 aa29.61■■■□□ 2.33
AC068389.2-201ENST00000529518 CEP170Q5SW79 1584 aa29.6■■■□□ 2.33
AC068389.2-201ENST00000529518 CUL7Q14999 1698 aa29.52■■■□□ 2.32
AC068389.2-201ENST00000529518 ARAP1Q96P48 1450 aa29.49■■■□□ 2.31
AC068389.2-201ENST00000529518 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.45■■■□□ 2.3
AC068389.2-201ENST00000529518 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.44■■■□□ 2.3
AC068389.2-201ENST00000529518 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.41■■■□□ 2.3
AC068389.2-201ENST00000529518 SHROOM2Q13796 1616 aa29.4■■■□□ 2.3
AC068389.2-201ENST00000529518 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms