RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529463.5

MTSS1-218, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

TSL 4

Gene MTSS1, Length 569 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-218ENST00000529463 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.66■■□□□ 1.22
MTSS1-218ENST00000529463 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.34■□□□□ 0.85
MTSS1-218ENST00000529463 ABCC9O60706 1549 aa20.16■□□□□ 0.82
MTSS1-218ENST00000529463 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.32■□□□□ 0.68
MTSS1-218ENST00000529463 NACADO15069 1562 aa19.22■□□□□ 0.67
MTSS1-218ENST00000529463 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.07■□□□□ 0.64
MTSS1-218ENST00000529463 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.01■□□□□ 0.63
MTSS1-218ENST00000529463 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
MTSS1-218ENST00000529463 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.79■□□□□ 0.6
MTSS1-218ENST00000529463 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.77■□□□□ 0.6
MTSS1-218ENST00000529463 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
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MTSS1-218ENST00000529463 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.58■□□□□ 0.57
MTSS1-218ENST00000529463 SCRIBQ14160 1630 aa18.46■□□□□ 0.55
MTSS1-218ENST00000529463 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.23■□□□□ 0.51
MTSS1-218ENST00000529463 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
MTSS1-218ENST00000529463 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.19■□□□□ 0.5
MTSS1-218ENST00000529463 NCAPD3P42695 1498 aa17.71■□□□□ 0.43
MTSS1-218ENST00000529463 SMARCA2P51531 1590 aa17.66■□□□□ 0.42
MTSS1-218ENST00000529463 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.65■□□□□ 0.42
MTSS1-218ENST00000529463 SMARCA4P51532 1647 aa17.65■□□□□ 0.42
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MTSS1-218ENST00000529463 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.51■□□□□ 0.39
MTSS1-218ENST00000529463 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
MTSS1-218ENST00000529463 ERCC6Q03468 1493 aa17.47■□□□□ 0.39
MTSS1-218ENST00000529463 CUX2O14529 1486 aa17.43■□□□□ 0.38
MTSS1-218ENST00000529463 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.41■□□□□ 0.38
MTSS1-218ENST00000529463 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.32■□□□□ 0.36
MTSS1-218ENST00000529463 NESP48681 1621 aa17.31■□□□□ 0.36
MTSS1-218ENST00000529463 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.25■□□□□ 0.35
MTSS1-218ENST00000529463 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.23■□□□□ 0.35
MTSS1-218ENST00000529463 WIZO95785 1651 aa17.2■□□□□ 0.34
MTSS1-218ENST00000529463 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.18■□□□□ 0.34
MTSS1-218ENST00000529463 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
MTSS1-218ENST00000529463 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.12■□□□□ 0.33
MTSS1-218ENST00000529463 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
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MTSS1-218ENST00000529463 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.04■□□□□ 0.32
MTSS1-218ENST00000529463 CFTRP13569 1480 aa17■□□□□ 0.31
MTSS1-218ENST00000529463 CEP164Q9UPV0 1460 aa17■□□□□ 0.31
MTSS1-218ENST00000529463 WDR62O43379 1518 aa16.98■□□□□ 0.31
MTSS1-218ENST00000529463 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.98■□□□□ 0.31
MTSS1-218ENST00000529463 PRDM2Q13029 1718 aa16.84■□□□□ 0.29
MTSS1-218ENST00000529463 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.83■□□□□ 0.28
MTSS1-218ENST00000529463 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
MTSS1-218ENST00000529463 ABCC8Q09428 1581 aa16.72■□□□□ 0.27
MTSS1-218ENST00000529463 IFT140Q96RY7 1462 aa16.67■□□□□ 0.26
MTSS1-218ENST00000529463 TOPBP1Q92547 1522 aa16.65■□□□□ 0.26
MTSS1-218ENST00000529463 OSCARQ8IYS5 282 aa16.64■□□□□ 0.25
MTSS1-218ENST00000529463 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.62■□□□□ 0.25
MTSS1-218ENST00000529463 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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MTSS1-218ENST00000529463 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
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MTSS1-218ENST00000529463 WDR97A6NE52 1622 aa16.43■□□□□ 0.22
MTSS1-218ENST00000529463 SOGA1O94964 1423 aa16.43■□□□□ 0.22
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MTSS1-218ENST00000529463 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.38■□□□□ 0.21
MTSS1-218ENST00000529463 CUX1P39880 1505 aa16.37■□□□□ 0.21
MTSS1-218ENST00000529463 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
MTSS1-218ENST00000529463 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.34■□□□□ 0.21
MTSS1-218ENST00000529463 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.34■□□□□ 0.21
MTSS1-218ENST00000529463 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.34■□□□□ 0.21
MTSS1-218ENST00000529463 FBLN2P98095 1184 aa16.34■□□□□ 0.21
MTSS1-218ENST00000529463 CHD1O14646 1710 aa16.33■□□□□ 0.21
MTSS1-218ENST00000529463 ARHGEF11O15085 1522 aa16.33■□□□□ 0.2
MTSS1-218ENST00000529463 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
MTSS1-218ENST00000529463 GRIN2BQ13224 1484 aa16.29■□□□□ 0.2
MTSS1-218ENST00000529463 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.29■□□□□ 0.2
MTSS1-218ENST00000529463 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
MTSS1-218ENST00000529463 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.24■□□□□ 0.19
MTSS1-218ENST00000529463 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.23■□□□□ 0.19
MTSS1-218ENST00000529463 SYNJ1O43426 1573 aa16.23■□□□□ 0.19
MTSS1-218ENST00000529463 SYNJ2O15056 1496 aa16.22■□□□□ 0.19
MTSS1-218ENST00000529463 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
MTSS1-218ENST00000529463 PBRM1Q86U86 1689 aa16.19■□□□□ 0.18
MTSS1-218ENST00000529463 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.19■□□□□ 0.18
MTSS1-218ENST00000529463 TOP2BQ02880 1626 aa16.18■□□□□ 0.18
MTSS1-218ENST00000529463 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.18■□□□□ 0.18
MTSS1-218ENST00000529463 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.17■□□□□ 0.18
MTSS1-218ENST00000529463 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.16■□□□□ 0.18
MTSS1-218ENST00000529463 ARAP1Q96P48 1450 aa16.15■□□□□ 0.18
MTSS1-218ENST00000529463 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.06■□□□□ 0.16
MTSS1-218ENST00000529463 GRIN2AQ12879 1464 aa16.06■□□□□ 0.16
MTSS1-218ENST00000529463 ADAMTS12P58397 1594 aa16.05■□□□□ 0.16
MTSS1-218ENST00000529463 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.05■□□□□ 0.16
MTSS1-218ENST00000529463 NUP160Q12769 1436 aa16.01■□□□□ 0.15
MTSS1-218ENST00000529463 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
MTSS1-218ENST00000529463 CEP170Q5SW79 1584 aa15.96■□□□□ 0.14
MTSS1-218ENST00000529463 SHROOM2Q13796 1616 aa15.91■□□□□ 0.14
MTSS1-218ENST00000529463 KIF27Q86VH2 1401 aa15.9■□□□□ 0.14
MTSS1-218ENST00000529463 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.85■□□□□ 0.13
MTSS1-218ENST00000529463 JPH4Q96JJ6 628 aa15.85■□□□□ 0.13
MTSS1-218ENST00000529463 CUL7Q14999 1698 aa15.85■□□□□ 0.13
MTSS1-218ENST00000529463 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
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