RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529362.1

GATD1-210, Transcript of glutamine amidotransferase like class 1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene GATD1, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1-210ENST00000529362 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.53■■■■■ 6.8
GATD1-210ENST00000529362 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.07■■■■■ 5.77
GATD1-210ENST00000529362 ABCC9O60706 1549 aa49.74■■■■■ 5.55
GATD1-210ENST00000529362 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
GATD1-210ENST00000529362 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.88■■■■■ 5.25
GATD1-210ENST00000529362 NACADO15069 1562 aa47.87■■■■■ 5.25
GATD1-210ENST00000529362 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.75■■■■■ 5.23
GATD1-210ENST00000529362 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.65■■■■■ 5.22
GATD1-210ENST00000529362 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.56■■■■■ 5.2
GATD1-210ENST00000529362 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.05■■■■■ 5.12
GATD1-210ENST00000529362 SCRIBQ14160 1630 aa46.67■■■■■ 5.06
GATD1-210ENST00000529362 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.61■■■■■ 5.05
GATD1-210ENST00000529362 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.45■■■■■ 5.03
GATD1-210ENST00000529362 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.9■■■■■ 4.94
GATD1-210ENST00000529362 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.48■■■■■ 4.87
GATD1-210ENST00000529362 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
GATD1-210ENST00000529362 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.04■■■■■ 4.8
GATD1-210ENST00000529362 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.87■■■■■ 4.77
GATD1-210ENST00000529362 SMARCA4P51532 1647 aa44.64■■■■■ 4.74
GATD1-210ENST00000529362 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
GATD1-210ENST00000529362 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.41■■■■■ 4.7
GATD1-210ENST00000529362 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.27■■■■■ 4.68
GATD1-210ENST00000529362 SMARCA2P51531 1590 aa44.18■■■■■ 4.66
GATD1-210ENST00000529362 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.18■■■■■ 4.66
GATD1-210ENST00000529362 NCAPD3P42695 1498 aa44.16■■■■■ 4.66
GATD1-210ENST00000529362 HMGXB3Q12766 1538 aa44.03■■■■■ 4.64
GATD1-210ENST00000529362 WIZO95785 1651 aa43.97■■■■■ 4.63
GATD1-210ENST00000529362 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
GATD1-210ENST00000529362 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
GATD1-210ENST00000529362 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
GATD1-210ENST00000529362 NESP48681 1621 aa43.18■■■■■ 4.5
GATD1-210ENST00000529362 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.99■■■■■ 4.47
GATD1-210ENST00000529362 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.92■■■■■ 4.46
GATD1-210ENST00000529362 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.86■■■■■ 4.45
GATD1-210ENST00000529362 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
GATD1-210ENST00000529362 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.73■■■■■ 4.43
GATD1-210ENST00000529362 ERCC6Q03468 1493 aa42.72■■■■■ 4.43
GATD1-210ENST00000529362 CFTRP13569 1480 aa42.71■■■■■ 4.43
GATD1-210ENST00000529362 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.57■■■■■ 4.41
GATD1-210ENST00000529362 PRDM2Q13029 1718 aa42.54■■■■■ 4.4
GATD1-210ENST00000529362 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
GATD1-210ENST00000529362 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.43■■■■■ 4.38
GATD1-210ENST00000529362 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.33■■■■■ 4.37
GATD1-210ENST00000529362 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.23■■■■■ 4.35
GATD1-210ENST00000529362 CUX2O14529 1486 aa42.22■■■■■ 4.35
GATD1-210ENST00000529362 WDR62O43379 1518 aa42.15■■■■■ 4.34
GATD1-210ENST00000529362 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
GATD1-210ENST00000529362 TOPBP1Q92547 1522 aa41.81■■■■■ 4.28
GATD1-210ENST00000529362 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.78■■■■■ 4.28
GATD1-210ENST00000529362 CUX1P39880 1505 aa41.65■■■■■ 4.26
GATD1-210ENST00000529362 ABCC8Q09428 1581 aa41.64■■■■■ 4.26
GATD1-210ENST00000529362 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
GATD1-210ENST00000529362 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.41■■■■■ 4.22
GATD1-210ENST00000529362 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
GATD1-210ENST00000529362 IFT140Q96RY7 1462 aa41.41■■■■■ 4.22
GATD1-210ENST00000529362 SYNJ1O43426 1573 aa41.39■■■■■ 4.22
GATD1-210ENST00000529362 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.35■■■■■ 4.21
GATD1-210ENST00000529362 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
GATD1-210ENST00000529362 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
GATD1-210ENST00000529362 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.32■■■■■ 4.2
GATD1-210ENST00000529362 TOP2BQ02880 1626 aa41.31■■■■■ 4.2
GATD1-210ENST00000529362 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
GATD1-210ENST00000529362 SOGA1O94964 1423 aa41.2■■■■■ 4.19
GATD1-210ENST00000529362 WDR97A6NE52 1622 aa41.2■■■■■ 4.19
GATD1-210ENST00000529362 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.07■■■■■ 4.166e-6■■■■□ 25.1
GATD1-210ENST00000529362 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
GATD1-210ENST00000529362 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.99■■■■■ 4.15
GATD1-210ENST00000529362 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.91■■■■■ 4.14
GATD1-210ENST00000529362 PBRM1Q86U86 1689 aa40.83■■■■■ 4.13
GATD1-210ENST00000529362 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.77■■■■■ 4.12
GATD1-210ENST00000529362 GRIN2BQ13224 1484 aa40.71■■■■■ 4.11
GATD1-210ENST00000529362 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.71■■■■■ 4.11
GATD1-210ENST00000529362 CHD1O14646 1710 aa40.68■■■■■ 4.1
GATD1-210ENST00000529362 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.6■■■■■ 4.09
GATD1-210ENST00000529362 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
GATD1-210ENST00000529362 ADAMTS12P58397 1594 aa40.48■■■■■ 4.07
GATD1-210ENST00000529362 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.48■■■■■ 4.07
GATD1-210ENST00000529362 SYNJ2O15056 1496 aa40.45■■■■■ 4.07
GATD1-210ENST00000529362 KIF27Q86VH2 1401 aa40.39■■■■■ 4.06
GATD1-210ENST00000529362 OSCARQ8IYS5 282 aa40.38■■■■■ 4.05
GATD1-210ENST00000529362 TRIM41Q8WV44 630 aa40.37■■■■■ 4.05
GATD1-210ENST00000529362 FBLN2P98095 1184 aa40.36■■■■■ 4.05
GATD1-210ENST00000529362 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.32■■■■■ 4.04
GATD1-210ENST00000529362 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.28■■■■■ 4.04
GATD1-210ENST00000529362 IGF1RP08069 1367 aa40.26■■■■■ 4.04
GATD1-210ENST00000529362 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
GATD1-210ENST00000529362 GRIN2AQ12879 1464 aa40.25■■■■■ 4.03
GATD1-210ENST00000529362 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.2■■■■■ 4.03
GATD1-210ENST00000529362 CUL7Q14999 1698 aa40.19■■■■■ 4.02
GATD1-210ENST00000529362 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.17■■■■■ 4.02
GATD1-210ENST00000529362 CEP170Q5SW79 1584 aa40.14■■■■■ 4.02
GATD1-210ENST00000529362 NUP160Q12769 1436 aa40.07■■■■■ 4
GATD1-210ENST00000529362 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.98■■■■□ 3.99
GATD1-210ENST00000529362 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.98■■■■□ 3.99
GATD1-210ENST00000529362 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.98■■■■□ 3.99
GATD1-210ENST00000529362 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.98■■■■□ 3.99
GATD1-210ENST00000529362 ARHGEF11O15085 1522 aa39.95■■■■□ 3.99
GATD1-210ENST00000529362 SHROOM2Q13796 1616 aa39.82■■■■□ 3.96
GATD1-210ENST00000529362 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.8■■■■□ 3.96
GATD1-210ENST00000529362 PRXQ9BXM0 1461 aa39.78■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101 ms