RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527409.1

LMNB2-204, Transcript of lamin B2, humanhuman

TSL 5

Gene LMNB2, Length 838 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2-204ENST00000527409 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.18■■■■■ 6.42
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LMNB2-204ENST00000527409 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.92■■■■■ 4.94
LMNB2-204ENST00000527409 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.69■■■■■ 4.9
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LMNB2-204ENST00000527409 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.03■■■■■ 4.8
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LMNB2-204ENST00000527409 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.52■■■■■ 4.72
LMNB2-204ENST00000527409 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
LMNB2-204ENST00000527409 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.76■■■■■ 4.6
LMNB2-204ENST00000527409 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.48■■■■■ 4.55
LMNB2-204ENST00000527409 SMARCA4P51532 1647 aa42.89■■■■■ 4.46
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LMNB2-204ENST00000527409 NCAPD3P42695 1498 aa42.73■■■■■ 4.43
LMNB2-204ENST00000527409 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.69■■■■■ 4.42
LMNB2-204ENST00000527409 SMARCA2P51531 1590 aa42.69■■■■■ 4.42
LMNB2-204ENST00000527409 HMGXB3Q12766 1538 aa42.54■■■■■ 4.4
LMNB2-204ENST00000527409 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.51■■■■■ 4.4
LMNB2-204ENST00000527409 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.49■■■■■ 4.39
LMNB2-204ENST00000527409 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
LMNB2-204ENST00000527409 WIZO95785 1651 aa42.05■■■■■ 4.32
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LMNB2-204ENST00000527409 ERCC6Q03468 1493 aa41.72■■■■■ 4.27
LMNB2-204ENST00000527409 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.69■■■■■ 4.26
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LMNB2-204ENST00000527409 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.44■■■■■ 4.22
LMNB2-204ENST00000527409 CUX2O14529 1486 aa41.41■■■■■ 4.22
LMNB2-204ENST00000527409 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.38■■■■■ 4.22
LMNB2-204ENST00000527409 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.32■■■■■ 4.2
LMNB2-204ENST00000527409 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
LMNB2-204ENST00000527409 CFTRP13569 1480 aa41.16■■■■■ 4.18
LMNB2-204ENST00000527409 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.07■■■■■ 4.16
LMNB2-204ENST00000527409 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.98■■■■■ 4.15
LMNB2-204ENST00000527409 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.98■■■■■ 4.15
LMNB2-204ENST00000527409 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.97■■■■■ 4.15
LMNB2-204ENST00000527409 PRDM2Q13029 1718 aa40.95■■■■■ 4.15
LMNB2-204ENST00000527409 WDR62O43379 1518 aa40.87■■■■■ 4.13
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LMNB2-204ENST00000527409 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.36■■■■■ 4.05
LMNB2-204ENST00000527409 ABCC8Q09428 1581 aa40.33■■■■■ 4.05
LMNB2-204ENST00000527409 TOPBP1Q92547 1522 aa40.31■■■■■ 4.04
LMNB2-204ENST00000527409 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.27■■■■■ 4.04
LMNB2-204ENST00000527409 IFT140Q96RY7 1462 aa40.13■■■■■ 4.01
LMNB2-204ENST00000527409 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
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LMNB2-204ENST00000527409 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
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LMNB2-204ENST00000527409 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.73■■■■□ 3.95
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LMNB2-204ENST00000527409 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.54■■■■□ 3.92
LMNB2-204ENST00000527409 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.54■■■■□ 3.92
LMNB2-204ENST00000527409 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
LMNB2-204ENST00000527409 TOP2BQ02880 1626 aa39.52■■■■□ 3.92
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LMNB2-204ENST00000527409 CHD1O14646 1710 aa39.38■■■■□ 3.89
LMNB2-204ENST00000527409 GRIN2BQ13224 1484 aa39.35■■■■□ 3.89
LMNB2-204ENST00000527409 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.32■■■■□ 3.89
LMNB2-204ENST00000527409 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.32■■■■□ 3.88
LMNB2-204ENST00000527409 PBRM1Q86U86 1689 aa39.31■■■■□ 3.88
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LMNB2-204ENST00000527409 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
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LMNB2-204ENST00000527409 SYNJ2O15056 1496 aa39.14■■■■□ 3.86
LMNB2-204ENST00000527409 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
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LMNB2-204ENST00000527409 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.02■■■■□ 3.84
LMNB2-204ENST00000527409 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.02■■■■□ 3.84
LMNB2-204ENST00000527409 ARHGEF11O15085 1522 aa38.98■■■■□ 3.83
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LMNB2-204ENST00000527409 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.94■■■■□ 3.82
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LMNB2-204ENST00000527409 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.39■■■■□ 3.74
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