RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527368.5

C11orf80-209, Transcript of chromosome 11 open reading frame 80, humanhuman

TSL 5

Gene C11orf80, Length 812 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C11orf80-209ENST00000527368 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.37■■■■■ 4.69
C11orf80-209ENST00000527368 OSCARQ8IYS5 282 aa44.24■■■■■ 4.67
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C11orf80-209ENST00000527368 CHD1O14646 1710 aa43.03■■■■■ 4.48
C11orf80-209ENST00000527368 ARAP1Q96P48 1450 aa43.01■■■■■ 4.48
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C11orf80-209ENST00000527368 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.88■■■■■ 4.46
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C11orf80-209ENST00000527368 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.68■■■■■ 4.42
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C11orf80-209ENST00000527368 GRIN2BQ13224 1484 aa42.46■■■■■ 4.39
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C11orf80-209ENST00000527368 CEP170Q5SW79 1584 aa41.79■■■■■ 4.28
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C11orf80-209ENST00000527368 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
C11orf80-209ENST00000527368 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.67■■■■■ 4.26
C11orf80-209ENST00000527368 SHROOM2Q13796 1616 aa41.62■■■■■ 4.25
C11orf80-209ENST00000527368 TOP2BQ02880 1626 aa41.55■■■■■ 4.24
C11orf80-209ENST00000527368 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.52■■■■■ 4.24
C11orf80-209ENST00000527368 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
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C11orf80-209ENST00000527368 JPH4Q96JJ6 628 aa41.45■■■■■ 4.23
C11orf80-209ENST00000527368 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.39■■■■■ 4.22
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