RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526884.1

NFRKB-204, Transcript of nuclear factor related to kappaB binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene NFRKB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFRKB-204ENST00000526884 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.4■■■■■ 6.94
NFRKB-204ENST00000526884 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.26■■■■■ 5.96
NFRKB-204ENST00000526884 ABCC9O60706 1549 aa51.03■■■■■ 5.76
NFRKB-204ENST00000526884 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.19■■■■■ 5.47
NFRKB-204ENST00000526884 NACADO15069 1562 aa49.08■■■■■ 5.45
NFRKB-204ENST00000526884 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.78■■■■■ 5.4
NFRKB-204ENST00000526884 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.63■■■■■ 5.38
NFRKB-204ENST00000526884 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.58■■■■■ 5.37
NFRKB-204ENST00000526884 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.44■■■■■ 5.35
NFRKB-204ENST00000526884 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.15■■■■■ 5.3
NFRKB-204ENST00000526884 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.63■■■■■ 5.22
NFRKB-204ENST00000526884 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.49■■■■■ 5.19
NFRKB-204ENST00000526884 SCRIBQ14160 1630 aa47.43■■■■■ 5.18
NFRKB-204ENST00000526884 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.32■■■■■ 5.17
NFRKB-204ENST00000526884 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.89■■■■■ 5.1
NFRKB-204ENST00000526884 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.42■■■■■ 5.02
NFRKB-204ENST00000526884 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.28■■■■■ 5
NFRKB-204ENST00000526884 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.94■■■■■ 4.95
NFRKB-204ENST00000526884 SMARCA4P51532 1647 aa45.43■■■■■ 4.86
NFRKB-204ENST00000526884 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
NFRKB-204ENST00000526884 SMARCA2P51531 1590 aa45.21■■■■■ 4.83
NFRKB-204ENST00000526884 NCAPD3P42695 1498 aa45.2■■■■■ 4.83
NFRKB-204ENST00000526884 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.16■■■■■ 4.82
NFRKB-204ENST00000526884 HMGXB3Q12766 1538 aa45.07■■■■■ 4.81
NFRKB-204ENST00000526884 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.06■■■■■ 4.8
NFRKB-204ENST00000526884 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.94■■■■■ 4.78
NFRKB-204ENST00000526884 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
NFRKB-204ENST00000526884 WIZO95785 1651 aa44.48■■■■■ 4.71
NFRKB-204ENST00000526884 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.68
NFRKB-204ENST00000526884 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.15■■■■■ 4.66
NFRKB-204ENST00000526884 ERCC6Q03468 1493 aa44.08■■■■■ 4.65
NFRKB-204ENST00000526884 NESP48681 1621 aa44.07■■■■■ 4.65
NFRKB-204ENST00000526884 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
NFRKB-204ENST00000526884 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.81■■■■■ 4.6
NFRKB-204ENST00000526884 CUX2O14529 1486 aa43.81■■■■■ 4.6
NFRKB-204ENST00000526884 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.76■■■■■ 4.6
NFRKB-204ENST00000526884 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.75■■■■■ 4.59
NFRKB-204ENST00000526884 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
NFRKB-204ENST00000526884 CFTRP13569 1480 aa43.56■■■■■ 4.56
NFRKB-204ENST00000526884 PRDM2Q13029 1718 aa43.48■■■■■ 4.55
NFRKB-204ENST00000526884 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.42■■■■■ 4.54
NFRKB-204ENST00000526884 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.35■■■■■ 4.53
NFRKB-204ENST00000526884 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.34■■■■■ 4.53
NFRKB-204ENST00000526884 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.34■■■■■ 4.53
NFRKB-204ENST00000526884 WDR62O43379 1518 aa43.26■■■■■ 4.52
NFRKB-204ENST00000526884 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
NFRKB-204ENST00000526884 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
NFRKB-204ENST00000526884 ABCC8Q09428 1581 aa42.72■■■■■ 4.43
NFRKB-204ENST00000526884 TOPBP1Q92547 1522 aa42.64■■■■■ 4.42
NFRKB-204ENST00000526884 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.64■■■■■ 4.42
NFRKB-204ENST00000526884 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.56■■■■■ 4.4
NFRKB-204ENST00000526884 IFT140Q96RY7 1462 aa42.46■■■■■ 4.39
NFRKB-204ENST00000526884 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
NFRKB-204ENST00000526884 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
NFRKB-204ENST00000526884 CUX1P39880 1505 aa42.2■■■■■ 4.35
NFRKB-204ENST00000526884 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
NFRKB-204ENST00000526884 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
NFRKB-204ENST00000526884 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.1■■■■■ 4.33
NFRKB-204ENST00000526884 WDR97A6NE52 1622 aa42.06■■■■■ 4.32
NFRKB-204ENST00000526884 SOGA1O94964 1423 aa42.01■■■■■ 4.32
NFRKB-204ENST00000526884 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.97■■■■■ 4.31
NFRKB-204ENST00000526884 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.91■■■■■ 4.3
NFRKB-204ENST00000526884 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.87■■■■■ 4.292e-10■■■■□ 22.5
NFRKB-204ENST00000526884 TOP2BQ02880 1626 aa41.87■■■■■ 4.29
NFRKB-204ENST00000526884 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.29
NFRKB-204ENST00000526884 OSCARQ8IYS5 282 aa41.77■■■■■ 4.28
NFRKB-204ENST00000526884 SYNJ1O43426 1573 aa41.76■■■■■ 4.28
NFRKB-204ENST00000526884 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.74■■■■■ 4.27
NFRKB-204ENST00000526884 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
NFRKB-204ENST00000526884 CHD1O14646 1710 aa41.7■■■■■ 4.27
NFRKB-204ENST00000526884 PBRM1Q86U86 1689 aa41.66■■■■■ 4.26
NFRKB-204ENST00000526884 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.65■■■■■ 4.26
NFRKB-204ENST00000526884 GRIN2BQ13224 1484 aa41.63■■■■■ 4.25
NFRKB-204ENST00000526884 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
NFRKB-204ENST00000526884 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.57■■■■■ 4.25
NFRKB-204ENST00000526884 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.56■■■■■ 4.24
NFRKB-204ENST00000526884 SYNJ2O15056 1496 aa41.41■■■■■ 4.22
NFRKB-204ENST00000526884 FBLN2P98095 1184 aa41.34■■■■■ 4.21
NFRKB-204ENST00000526884 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.28■■■■■ 4.2
NFRKB-204ENST00000526884 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
NFRKB-204ENST00000526884 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.26■■■■■ 4.2
NFRKB-204ENST00000526884 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.26■■■■■ 4.2
NFRKB-204ENST00000526884 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.26■■■■■ 4.2
NFRKB-204ENST00000526884 ADAMTS12P58397 1594 aa41.25■■■■■ 4.19
NFRKB-204ENST00000526884 ARHGEF11O15085 1522 aa41.2■■■■■ 4.19
NFRKB-204ENST00000526884 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.2■■■■■ 4.19
NFRKB-204ENST00000526884 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.1■■■■■ 4.17
NFRKB-204ENST00000526884 GRIN2AQ12879 1464 aa41.09■■■■■ 4.17
NFRKB-204ENST00000526884 KIF27Q86VH2 1401 aa41■■■■■ 4.15
NFRKB-204ENST00000526884 TRIM41Q8WV44 630 aa40.94■■■■■ 4.14
NFRKB-204ENST00000526884 NUP160Q12769 1436 aa40.93■■■■■ 4.14
NFRKB-204ENST00000526884 CUL7Q14999 1698 aa40.92■■■■■ 4.14
NFRKB-204ENST00000526884 CEP170Q5SW79 1584 aa40.9■■■■■ 4.14
NFRKB-204ENST00000526884 ARAP1Q96P48 1450 aa40.81■■■■■ 4.12
NFRKB-204ENST00000526884 IGF1RP08069 1367 aa40.76■■■■■ 4.12
NFRKB-204ENST00000526884 SHROOM2Q13796 1616 aa40.75■■■■■ 4.11
NFRKB-204ENST00000526884 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.66■■■■■ 4.1
NFRKB-204ENST00000526884 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.64■■■■■ 4.1
NFRKB-204ENST00000526884 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.54■■■■■ 4.08
NFRKB-204ENST00000526884 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.48■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.8 ms