RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526786.5

EEF1D-217, Transcript of eukaryotic translation elongation factor 1 delta, humanhuman

TSL 2

Gene EEF1D, Length 1,246 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1D-217ENST00000526786 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.04■■■■■ 6.56
EEF1D-217ENST00000526786 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.68■■■■■ 5.54
EEF1D-217ENST00000526786 ABCC9O60706 1549 aa48.99■■■■■ 5.43
EEF1D-217ENST00000526786 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.18■■■■■ 5.14
EEF1D-217ENST00000526786 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.9■■■■■ 5.1
EEF1D-217ENST00000526786 NACADO15069 1562 aa46.81■■■■■ 5.08
EEF1D-217ENST00000526786 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
EEF1D-217ENST00000526786 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.44■■■■■ 5.02
EEF1D-217ENST00000526786 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.23■■■■■ 4.99
EEF1D-217ENST00000526786 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.9■■■■■ 4.942e-7■■■□□ 14.6
EEF1D-217ENST00000526786 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.85■■■■■ 4.93
EEF1D-217ENST00000526786 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.55■■■■■ 4.88
EEF1D-217ENST00000526786 SCRIBQ14160 1630 aa45.52■■■■■ 4.88
EEF1D-217ENST00000526786 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.19■■■■■ 4.82
EEF1D-217ENST00000526786 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.85■■■■■ 4.77
EEF1D-217ENST00000526786 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
EEF1D-217ENST00000526786 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.21■■■■■ 4.67
EEF1D-217ENST00000526786 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.96■■■■■ 4.63
EEF1D-217ENST00000526786 SMARCA4P51532 1647 aa43.46■■■■■ 4.55
EEF1D-217ENST00000526786 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.54
EEF1D-217ENST00000526786 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.32■■■■■ 4.52
EEF1D-217ENST00000526786 NCAPD3P42695 1498 aa43.27■■■■■ 4.52
EEF1D-217ENST00000526786 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.26■■■■■ 4.52
EEF1D-217ENST00000526786 SMARCA2P51531 1590 aa43.16■■■■■ 4.5
EEF1D-217ENST00000526786 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.97■■■■■ 4.47
EEF1D-217ENST00000526786 HMGXB3Q12766 1538 aa42.95■■■■■ 4.47
EEF1D-217ENST00000526786 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
EEF1D-217ENST00000526786 WIZO95785 1651 aa42.77■■■■■ 4.44
EEF1D-217ENST00000526786 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
EEF1D-217ENST00000526786 NESP48681 1621 aa42.38■■■■■ 4.37
EEF1D-217ENST00000526786 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
EEF1D-217ENST00000526786 ERCC6Q03468 1493 aa42.17■■■■■ 4.34
EEF1D-217ENST00000526786 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.06■■■■■ 4.32
EEF1D-217ENST00000526786 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.06■■■■■ 4.32
EEF1D-217ENST00000526786 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.86■■■■■ 4.29
EEF1D-217ENST00000526786 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.85■■■■■ 4.29
EEF1D-217ENST00000526786 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
EEF1D-217ENST00000526786 CFTRP13569 1480 aa41.74■■■■■ 4.27
EEF1D-217ENST00000526786 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.74■■■■■ 4.27
EEF1D-217ENST00000526786 CUX2O14529 1486 aa41.64■■■■■ 4.26
EEF1D-217ENST00000526786 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
EEF1D-217ENST00000526786 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.56■■■■■ 4.24
EEF1D-217ENST00000526786 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.47■■■■■ 4.23
EEF1D-217ENST00000526786 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.42■■■■■ 4.22
EEF1D-217ENST00000526786 PRDM2Q13029 1718 aa41.24■■■■■ 4.19
EEF1D-217ENST00000526786 WDR62O43379 1518 aa41.24■■■■■ 4.19
EEF1D-217ENST00000526786 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
EEF1D-217ENST00000526786 TOPBP1Q92547 1522 aa40.88■■■■■ 4.13
EEF1D-217ENST00000526786 ABCC8Q09428 1581 aa40.78■■■■■ 4.12
EEF1D-217ENST00000526786 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.76■■■■■ 4.12
EEF1D-217ENST00000526786 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.65■■■■■ 4.1
EEF1D-217ENST00000526786 IFT140Q96RY7 1462 aa40.6■■■■■ 4.09
EEF1D-217ENST00000526786 CUX1P39880 1505 aa40.56■■■■■ 4.08
EEF1D-217ENST00000526786 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
EEF1D-217ENST00000526786 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
EEF1D-217ENST00000526786 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.45■■■■■ 4.07
EEF1D-217ENST00000526786 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.43■■■■■ 4.06
EEF1D-217ENST00000526786 SOGA1O94964 1423 aa40.42■■■■■ 4.06
EEF1D-217ENST00000526786 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
EEF1D-217ENST00000526786 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.33■■■■■ 4.059e-8■■■■■ 45.4
EEF1D-217ENST00000526786 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.042e-6■■■□□ 16.6
EEF1D-217ENST00000526786 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
EEF1D-217ENST00000526786 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
EEF1D-217ENST00000526786 SYNJ1O43426 1573 aa40.16■■■■■ 4.02
EEF1D-217ENST00000526786 TOP2BQ02880 1626 aa40.11■■■■■ 4.01
EEF1D-217ENST00000526786 OSCARQ8IYS5 282 aa40.09■■■■■ 4.01
EEF1D-217ENST00000526786 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.07■■■■■ 4.01
EEF1D-217ENST00000526786 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.98■■■■□ 3.99
EEF1D-217ENST00000526786 WDR97A6NE52 1622 aa39.96■■■■□ 3.99
EEF1D-217ENST00000526786 FBLN2P98095 1184 aa39.96■■■■□ 3.99
EEF1D-217ENST00000526786 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.91■■■■□ 3.98
EEF1D-217ENST00000526786 GRIN2BQ13224 1484 aa39.88■■■■□ 3.98
EEF1D-217ENST00000526786 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.87■■■■□ 3.97
EEF1D-217ENST00000526786 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.79■■■■□ 3.96
EEF1D-217ENST00000526786 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
EEF1D-217ENST00000526786 CHD1O14646 1710 aa39.76■■■■□ 3.96
EEF1D-217ENST00000526786 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
EEF1D-217ENST00000526786 PBRM1Q86U86 1689 aa39.72■■■■□ 3.95
EEF1D-217ENST00000526786 SYNJ2O15056 1496 aa39.62■■■■□ 3.93
EEF1D-217ENST00000526786 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.46■■■■□ 3.91
EEF1D-217ENST00000526786 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.42■■■■□ 3.9
EEF1D-217ENST00000526786 KIF27Q86VH2 1401 aa39.42■■■■□ 3.9
EEF1D-217ENST00000526786 ADAMTS12P58397 1594 aa39.42■■■■□ 3.9
EEF1D-217ENST00000526786 TRIM41Q8WV44 630 aa39.4■■■■□ 3.9
EEF1D-217ENST00000526786 GRIN2AQ12879 1464 aa39.37■■■■□ 3.89
EEF1D-217ENST00000526786 IGF1RP08069 1367 aa39.36■■■■□ 3.89
EEF1D-217ENST00000526786 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.34■■■■□ 3.89
EEF1D-217ENST00000526786 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.34■■■■□ 3.89
EEF1D-217ENST00000526786 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.34■■■■□ 3.89
EEF1D-217ENST00000526786 ARHGEF11O15085 1522 aa39.33■■■■□ 3.89
EEF1D-217ENST00000526786 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.31■■■■□ 3.88
EEF1D-217ENST00000526786 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.19■■■■□ 3.86
EEF1D-217ENST00000526786 CEP170Q5SW79 1584 aa39.18■■■■□ 3.86
EEF1D-217ENST00000526786 NUP160Q12769 1436 aa39.18■■■■□ 3.86
EEF1D-217ENST00000526786 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.16■■■■□ 3.86
EEF1D-217ENST00000526786 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.11■■■■□ 3.85
EEF1D-217ENST00000526786 CUL7Q14999 1698 aa39.04■■■■□ 3.84
EEF1D-217ENST00000526786 ARAP1Q96P48 1450 aa39.04■■■■□ 3.84
EEF1D-217ENST00000526786 JPH4Q96JJ6 628 aa38.94■■■■□ 3.82
EEF1D-217ENST00000526786 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.91■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms