RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526481.6

CTSB-211, Transcript of cathepsin B, humanhuman

TSL 5

Gene CTSB, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSB-211ENST00000526481 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.44■■■■□ 3.1
CTSB-211ENST00000526481 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CTSB-211ENST00000526481 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.12■■■□□ 2.89
CTSB-211ENST00000526481 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.45■■■□□ 2.47
CTSB-211ENST00000526481 ABCC9O60706 1549 aa29.2■■■□□ 2.27
CTSB-211ENST00000526481 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CTSB-211ENST00000526481 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CTSB-211ENST00000526481 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CTSB-211ENST00000526481 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.48■■■□□ 2.15
CTSB-211ENST00000526481 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.4■■■□□ 2.14
CTSB-211ENST00000526481 NACADO15069 1562 aa28.39■■■□□ 2.14
CTSB-211ENST00000526481 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.36■■■□□ 2.13
CTSB-211ENST00000526481 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.31■■■□□ 2.12
CTSB-211ENST00000526481 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.89■■■□□ 2.06
CTSB-211ENST00000526481 SCRIBQ14160 1630 aa27.88■■■□□ 2.05
CTSB-211ENST00000526481 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.59■■■□□ 2.01
CTSB-211ENST00000526481 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.52■■■□□ 2
CTSB-211ENST00000526481 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
CTSB-211ENST00000526481 FOXD1Q16676 465 aa27.07■■□□□ 1.92
CTSB-211ENST00000526481 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.81■■□□□ 1.88
CTSB-211ENST00000526481 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.73■■□□□ 1.87
CTSB-211ENST00000526481 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CTSB-211ENST00000526481 SMARCA4P51532 1647 aa26.68■■□□□ 1.86
CTSB-211ENST00000526481 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CTSB-211ENST00000526481 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.61■■□□□ 1.85
CTSB-211ENST00000526481 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.47■■□□□ 1.83
CTSB-211ENST00000526481 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CTSB-211ENST00000526481 WIZO95785 1651 aa26.41■■□□□ 1.82
CTSB-211ENST00000526481 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.36■■□□□ 1.81
CTSB-211ENST00000526481 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.3■■□□□ 1.8
CTSB-211ENST00000526481 SMARCA2P51531 1590 aa26.29■■□□□ 1.8
CTSB-211ENST00000526481 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.22■■□□□ 1.79
CTSB-211ENST00000526481 HMGXB3Q12766 1538 aa26.16■■□□□ 1.78
CTSB-211ENST00000526481 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CTSB-211ENST00000526481 NCAPD3P42695 1498 aa26.14■■□□□ 1.78
CTSB-211ENST00000526481 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CTSB-211ENST00000526481 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CTSB-211ENST00000526481 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.84■■□□□ 1.73
CTSB-211ENST00000526481 ADRA2BP18089 450 aa25.77■■□□□ 1.72
CTSB-211ENST00000526481 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.74■■□□□ 1.71
CTSB-211ENST00000526481 PRDM2Q13029 1718 aa25.49■■□□□ 1.67
CTSB-211ENST00000526481 NESP48681 1621 aa25.48■■□□□ 1.67
CTSB-211ENST00000526481 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.43■■□□□ 1.66
CTSB-211ENST00000526481 CFTRP13569 1480 aa25.41■■□□□ 1.66
CTSB-211ENST00000526481 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CTSB-211ENST00000526481 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.4■■□□□ 1.66
CTSB-211ENST00000526481 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.29■■□□□ 1.64
CTSB-211ENST00000526481 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.18■■□□□ 1.62
CTSB-211ENST00000526481 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.13■■□□□ 1.61
CTSB-211ENST00000526481 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.09■■□□□ 1.61
CTSB-211ENST00000526481 ABCC8Q09428 1581 aa25.08■■□□□ 1.61
CTSB-211ENST00000526481 ERCC6Q03468 1493 aa25.07■■□□□ 1.6
CTSB-211ENST00000526481 MSH5O43196 834 aa25.04■■□□□ 1.6
CTSB-211ENST00000526481 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CTSB-211ENST00000526481 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.96■■□□□ 1.59
CTSB-211ENST00000526481 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CTSB-211ENST00000526481 SYNJ1O43426 1573 aa24.94■■□□□ 1.58
CTSB-211ENST00000526481 CUX1P39880 1505 aa24.93■■□□□ 1.58
CTSB-211ENST00000526481 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.92■■□□□ 1.58
CTSB-211ENST00000526481 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.9■■□□□ 1.58
CTSB-211ENST00000526481 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
CTSB-211ENST00000526481 WDR62O43379 1518 aa24.89■■□□□ 1.57
CTSB-211ENST00000526481 TOPBP1Q92547 1522 aa24.87■■□□□ 1.57
CTSB-211ENST00000526481 TOP2BQ02880 1626 aa24.86■■□□□ 1.57
CTSB-211ENST00000526481 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.73■■□□□ 1.55
CTSB-211ENST00000526481 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CTSB-211ENST00000526481 WDR97A6NE52 1622 aa24.64■■□□□ 1.53
CTSB-211ENST00000526481 CUX2O14529 1486 aa24.64■■□□□ 1.53
CTSB-211ENST00000526481 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTSB-211ENST00000526481 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.59■■□□□ 1.53
CTSB-211ENST00000526481 TRIM41Q8WV44 630 aa24.59■■□□□ 1.53
CTSB-211ENST00000526481 SOGA1O94964 1423 aa24.52■■□□□ 1.52
CTSB-211ENST00000526481 IFT140Q96RY7 1462 aa24.51■■□□□ 1.51
CTSB-211ENST00000526481 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.49■■□□□ 1.51
CTSB-211ENST00000526481 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.44■■□□□ 1.5
CTSB-211ENST00000526481 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CTSB-211ENST00000526481 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CTSB-211ENST00000526481 PBRM1Q86U86 1689 aa24.38■■□□□ 1.49
CTSB-211ENST00000526481 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.37■■□□□ 1.49
CTSB-211ENST00000526481 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CTSB-211ENST00000526481 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.482e-8■□□□□ 10.6
CTSB-211ENST00000526481 KIF27Q86VH2 1401 aa24.29■■□□□ 1.48
CTSB-211ENST00000526481 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.28■■□□□ 1.48
CTSB-211ENST00000526481 GRIN2BQ13224 1484 aa24.19■■□□□ 1.46
CTSB-211ENST00000526481 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.19■■□□□ 1.46
CTSB-211ENST00000526481 EEA1Q15075 1411 aa24.18■■□□□ 1.46
CTSB-211ENST00000526481 ADAMTS12P58397 1594 aa24.17■■□□□ 1.46
CTSB-211ENST00000526481 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CTSB-211ENST00000526481 CUL7Q14999 1698 aa24.15■■□□□ 1.46
CTSB-211ENST00000526481 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.15■■□□□ 1.46
CTSB-211ENST00000526481 IGF1RP08069 1367 aa24.11■■□□□ 1.45
CTSB-211ENST00000526481 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CTSB-211ENST00000526481 CHD1O14646 1710 aa24.07■■□□□ 1.44
CTSB-211ENST00000526481 KIF21BO75037 1637 aa24.04■■□□□ 1.44
CTSB-211ENST00000526481 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.02■■□□□ 1.44
CTSB-211ENST00000526481 PRXQ9BXM0 1461 aa24.01■■□□□ 1.43
CTSB-211ENST00000526481 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24■■□□□ 1.43
CTSB-211ENST00000526481 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.99■■□□□ 1.43
CTSB-211ENST00000526481 SYNJ2O15056 1496 aa23.98■■□□□ 1.43
CTSB-211ENST00000526481 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms