RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526035.5

BBS1-209, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 5

Gene BBS1, Length 822 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-209ENST00000526035 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.69■■■■□ 3.46
BBS1-209ENST00000526035 ABCC9O60706 1549 aa33.53■■■□□ 2.96
BBS1-209ENST00000526035 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.07■■■□□ 2.88
BBS1-209ENST00000526035 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.77■■■□□ 2.68
BBS1-209ENST00000526035 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.7■■■□□ 2.67
BBS1-209ENST00000526035 NACADO15069 1562 aa31.38■■■□□ 2.61
BBS1-209ENST00000526035 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.23■■■□□ 2.59
BBS1-209ENST00000526035 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.17■■■□□ 2.58
BBS1-209ENST00000526035 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.94■■■□□ 2.54
BBS1-209ENST00000526035 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.79■■■□□ 2.52
BBS1-209ENST00000526035 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.78■■■□□ 2.52
BBS1-209ENST00000526035 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
BBS1-209ENST00000526035 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.31■■■□□ 2.44
BBS1-209ENST00000526035 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.26■■■□□ 2.43
BBS1-209ENST00000526035 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.23■■■□□ 2.43
BBS1-209ENST00000526035 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.23■■■□□ 2.43
BBS1-209ENST00000526035 SCRIBQ14160 1630 aa30.18■■■□□ 2.42
BBS1-209ENST00000526035 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
BBS1-209ENST00000526035 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.45■■■□□ 2.31
BBS1-209ENST00000526035 CUX2O14529 1486 aa29.02■■■□□ 2.24
BBS1-209ENST00000526035 ERCC6Q03468 1493 aa28.98■■■□□ 2.23
BBS1-209ENST00000526035 NCAPD3P42695 1498 aa28.97■■■□□ 2.23
BBS1-209ENST00000526035 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.85■■■□□ 2.21
BBS1-209ENST00000526035 SMARCA2P51531 1590 aa28.74■■■□□ 2.19
BBS1-209ENST00000526035 HMGXB3Q12766 1538 aa28.72■■■□□ 2.19
BBS1-209ENST00000526035 SMARCA4P51532 1647 aa28.72■■■□□ 2.19
BBS1-209ENST00000526035 NESP48681 1621 aa28.69■■■□□ 2.18
BBS1-209ENST00000526035 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
BBS1-209ENST00000526035 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
BBS1-209ENST00000526035 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
BBS1-209ENST00000526035 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.4■■■□□ 2.14
BBS1-209ENST00000526035 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.38■■■□□ 2.13
BBS1-209ENST00000526035 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.29■■■□□ 2.12
BBS1-209ENST00000526035 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.26■■■□□ 2.12
BBS1-209ENST00000526035 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.26■■■□□ 2.11
BBS1-209ENST00000526035 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.09■■■□□ 2.09
BBS1-209ENST00000526035 TRIM41Q8WV44 630 aa28.07■■■□□ 2.08
BBS1-209ENST00000526035 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.04■■■□□ 2.08
BBS1-209ENST00000526035 WDR62O43379 1518 aa27.97■■■□□ 2.07
BBS1-209ENST00000526035 WIZO95785 1651 aa27.92■■■□□ 2.06
BBS1-209ENST00000526035 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.86■■■□□ 2.05
BBS1-209ENST00000526035 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.79■■■□□ 2.04
BBS1-209ENST00000526035 CFTRP13569 1480 aa27.68■■■□□ 2.02
BBS1-209ENST00000526035 OSCARQ8IYS5 282 aa27.65■■■□□ 2.02
BBS1-209ENST00000526035 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
BBS1-209ENST00000526035 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
BBS1-209ENST00000526035 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
BBS1-209ENST00000526035 PRDM2Q13029 1718 aa27.33■■□□□ 1.96
BBS1-209ENST00000526035 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.32■■□□□ 1.96
BBS1-209ENST00000526035 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.32■■□□□ 1.96
BBS1-209ENST00000526035 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.32■■□□□ 1.96
BBS1-209ENST00000526035 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
BBS1-209ENST00000526035 IFT140Q96RY7 1462 aa27.3■■□□□ 1.96
BBS1-209ENST00000526035 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.25■■□□□ 1.95
BBS1-209ENST00000526035 TOPBP1Q92547 1522 aa27.21■■□□□ 1.95
BBS1-209ENST00000526035 ARHGEF11O15085 1522 aa27.21■■□□□ 1.95
BBS1-209ENST00000526035 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
BBS1-209ENST00000526035 ABCC8Q09428 1581 aa27.1■■□□□ 1.93
BBS1-209ENST00000526035 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.07■■□□□ 1.92
BBS1-209ENST00000526035 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.06■■□□□ 1.92
BBS1-209ENST00000526035 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.923e-6■■■■□ 24.7
BBS1-209ENST00000526035 CHD1O14646 1710 aa26.99■■□□□ 1.91
BBS1-209ENST00000526035 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
BBS1-209ENST00000526035 FBLN2P98095 1184 aa26.96■■□□□ 1.91
BBS1-209ENST00000526035 ARAP1Q96P48 1450 aa26.92■■□□□ 1.9
BBS1-209ENST00000526035 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
BBS1-209ENST00000526035 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
BBS1-209ENST00000526035 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.83■■□□□ 1.89
BBS1-209ENST00000526035 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
BBS1-209ENST00000526035 SOGA1O94964 1423 aa26.79■■□□□ 1.88
BBS1-209ENST00000526035 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.74■■□□□ 1.87
BBS1-209ENST00000526035 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.69■■□□□ 1.86
BBS1-209ENST00000526035 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.67■■□□□ 1.86
BBS1-209ENST00000526035 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
BBS1-209ENST00000526035 WDR97A6NE52 1622 aa26.66■■□□□ 1.86
BBS1-209ENST00000526035 SYNJ1O43426 1573 aa26.63■■□□□ 1.85
BBS1-209ENST00000526035 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
BBS1-209ENST00000526035 CUX1P39880 1505 aa26.6■■□□□ 1.85
BBS1-209ENST00000526035 GRIN2BQ13224 1484 aa26.6■■□□□ 1.85
BBS1-209ENST00000526035 SYNJ2O15056 1496 aa26.55■■□□□ 1.84
BBS1-209ENST00000526035 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.46■■□□□ 1.83
BBS1-209ENST00000526035 PBRM1Q86U86 1689 aa26.44■■□□□ 1.82
BBS1-209ENST00000526035 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
BBS1-209ENST00000526035 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.35■■□□□ 1.81
BBS1-209ENST00000526035 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.34■■□□□ 1.81
BBS1-209ENST00000526035 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.25■■□□□ 1.79
BBS1-209ENST00000526035 GRIN2AQ12879 1464 aa26.25■■□□□ 1.79
BBS1-209ENST00000526035 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
BBS1-209ENST00000526035 ADAMTS12P58397 1594 aa26.19■■□□□ 1.78
BBS1-209ENST00000526035 CEP170Q5SW79 1584 aa26.17■■□□□ 1.78
BBS1-209ENST00000526035 NUP160Q12769 1436 aa26.17■■□□□ 1.78
BBS1-209ENST00000526035 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
BBS1-209ENST00000526035 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.1■■□□□ 1.77
BBS1-209ENST00000526035 SHROOM2Q13796 1616 aa26.07■■□□□ 1.76
BBS1-209ENST00000526035 TOP2BQ02880 1626 aa26.05■■□□□ 1.76
BBS1-209ENST00000526035 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.05■■□□□ 1.76
BBS1-209ENST00000526035 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26■■□□□ 1.75
BBS1-209ENST00000526035 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
BBS1-209ENST00000526035 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.93■■□□□ 1.74
BBS1-209ENST00000526035 JPH4Q96JJ6 628 aa25.91■■□□□ 1.74
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