RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525147.5

MUS81-204, Transcript of MUS81 structure-specific endonuclease subunit, human

TSL 5

Gene MUS81, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUS81-204	ENST00000525147	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.88	■■■■□ 3.97
MUS81-204	ENST00000525147	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.77	■■■■□ 3.32
MUS81-204	ENST00000525147	ABCC9	O60706	1549 aa		35.52	■■■■□ 3.28
MUS81-204	ENST00000525147	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.99	■■■■□ 3.03
MUS81-204	ENST00000525147	NACAD	O15069	1562 aa		33.82	■■■■□ 3
MUS81-204	ENST00000525147	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.5	■■■□□ 2.95
MUS81-204	ENST00000525147	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.48	■■■□□ 2.95
MUS81-204	ENST00000525147	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.22	■■■□□ 2.91
MUS81-204	ENST00000525147	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.11	■■■□□ 2.89
MUS81-204	ENST00000525147	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.08	■■■□□ 2.89
MUS81-204	ENST00000525147	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
MUS81-204	ENST00000525147	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.05	■■■□□ 2.88
MUS81-204	ENST00000525147	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.92	■■■□□ 2.86
MUS81-204	ENST00000525147	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MUS81-204	ENST00000525147	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MUS81-204	ENST00000525147	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.15	■■■□□ 2.74
MUS81-204	ENST00000525147	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
MUS81-204	ENST00000525147	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MUS81-204	ENST00000525147	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.22	■■■□□ 2.59
MUS81-204	ENST00000525147	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.08	■■■□□ 2.57
MUS81-204	ENST00000525147	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.05	■■■□□ 2.56
MUS81-204	ENST00000525147	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.05	■■■□□ 2.56
MUS81-204	ENST00000525147	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.98	■■■□□ 2.55
MUS81-204	ENST00000525147	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.97	■■■□□ 2.55
MUS81-204	ENST00000525147	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.83	■■■□□ 2.53
MUS81-204	ENST00000525147	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.78	■■■□□ 2.52
MUS81-204	ENST00000525147	CUX2	O14529	1486 aa		30.72	■■■□□ 2.51
MUS81-204	ENST00000525147	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.72	■■■□□ 2.51
MUS81-204	ENST00000525147	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.66	■■■□□ 2.5
MUS81-204	ENST00000525147	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.55	■■■□□ 2.48
MUS81-204	ENST00000525147	NES	P48681	1621 aa		30.53	■■■□□ 2.48
MUS81-204	ENST00000525147	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.48	■■■□□ 2.47
MUS81-204	ENST00000525147	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.32	■■■□□ 2.44
MUS81-204	ENST00000525147	WIZ	O95785	1651 aa		30.27	■■■□□ 2.44
MUS81-204	ENST00000525147	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.26	■■■□□ 2.43
MUS81-204	ENST00000525147	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.26	■■■□□ 2.43
MUS81-204	ENST00000525147	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.16	■■■□□ 2.42
MUS81-204	ENST00000525147	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.11	■■■□□ 2.41
MUS81-204	ENST00000525147	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.99	■■■□□ 2.39
MUS81-204	ENST00000525147	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
MUS81-204	ENST00000525147	CFTR	P13569	1480 aa		29.93	■■■□□ 2.38
MUS81-204	ENST00000525147	WDR62	O43379	1518 aa		29.92	■■■□□ 2.38
MUS81-204	ENST00000525147	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.89	■■■□□ 2.38
MUS81-204	ENST00000525147	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.87	■■■□□ 2.37
MUS81-204	ENST00000525147	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.61	■■■□□ 2.33
MUS81-204	ENST00000525147	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.61	■■■□□ 2.33
MUS81-204	ENST00000525147	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.58	■■■□□ 2.33
MUS81-204	ENST00000525147	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.38	■■■□□ 2.29
MUS81-204	ENST00000525147	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.33	■■■□□ 2.29
MUS81-204	ENST00000525147	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.33	■■■□□ 2.29
MUS81-204	ENST00000525147	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.3	■■■□□ 2.28
MUS81-204	ENST00000525147	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.22	■■■□□ 2.27
MUS81-204	ENST00000525147	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
MUS81-204	ENST00000525147	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MUS81-204	ENST00000525147	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
MUS81-204	ENST00000525147	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
MUS81-204	ENST00000525147	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
MUS81-204	ENST00000525147	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.93	■■■□□ 2.22	5e-12	■■■■■ 49.3
MUS81-204	ENST00000525147	SOGA1	O94964	1423 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MUS81-204	ENST00000525147	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MUS81-204	ENST00000525147	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MUS81-204	ENST00000525147	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MUS81-204	ENST00000525147	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MUS81-204	ENST00000525147	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MUS81-204	ENST00000525147	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MUS81-204	ENST00000525147	CUX1	P39880	1505 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MUS81-204	ENST00000525147	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MUS81-204	ENST00000525147	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
MUS81-204	ENST00000525147	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
MUS81-204	ENST00000525147	CHD1	O14646	1710 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MUS81-204	ENST00000525147	FBLN2	P98095	1184 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MUS81-204	ENST00000525147	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
MUS81-204	ENST00000525147	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.66	■■■□□ 2.18
MUS81-204	ENST00000525147	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MUS81-204	ENST00000525147	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
MUS81-204	ENST00000525147	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MUS81-204	ENST00000525147	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MUS81-204	ENST00000525147	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MUS81-204	ENST00000525147	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MUS81-204	ENST00000525147	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.53	■■■□□ 2.16
MUS81-204	ENST00000525147	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MUS81-204	ENST00000525147	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MUS81-204	ENST00000525147	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.49	■■■□□ 2.15
MUS81-204	ENST00000525147	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MUS81-204	ENST00000525147	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MUS81-204	ENST00000525147	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.43	■■■□□ 2.14
MUS81-204	ENST00000525147	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MUS81-204	ENST00000525147	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.27	■■■□□ 2.12
MUS81-204	ENST00000525147	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MUS81-204	ENST00000525147	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.23	■■■□□ 2.11
MUS81-204	ENST00000525147	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.23	■■■□□ 2.11
MUS81-204	ENST00000525147	NUP160	Q12769	1436 aa		28.19	■■■□□ 2.1
MUS81-204	ENST00000525147	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
MUS81-204	ENST00000525147	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.11	■■■□□ 2.09
MUS81-204	ENST00000525147	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MUS81-204	ENST00000525147	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MUS81-204	ENST00000525147	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MUS81-204	ENST00000525147	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MUS81-204	ENST00000525147	IGF1R	P08069	1367 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MUS81-204	ENST00000525147	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05

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