RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524998.1

RECQL4-202, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

TSL 3

Gene RECQL4, Length 686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-202ENST00000524998 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.01■■■■■ 5.44
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RECQL4-202ENST00000524998 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.84■■■■■ 4.29
RECQL4-202ENST00000524998 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.58■■■■■ 4.25
RECQL4-202ENST00000524998 NACADO15069 1562 aa41.55■■■■■ 4.24
RECQL4-202ENST00000524998 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.08■■■■■ 4.17
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RECQL4-202ENST00000524998 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.96■■■■■ 4.15
RECQL4-202ENST00000524998 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.73■■■■■ 4.11
RECQL4-202ENST00000524998 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
RECQL4-202ENST00000524998 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.49■■■■■ 4.07
RECQL4-202ENST00000524998 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.47■■■■■ 4.07
RECQL4-202ENST00000524998 SCRIBQ14160 1630 aa40.07■■■■■ 4.01
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RECQL4-202ENST00000524998 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.58■■■■□ 3.93
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RECQL4-202ENST00000524998 SMARCA4P51532 1647 aa38.2■■■■□ 3.71
RECQL4-202ENST00000524998 SMARCA2P51531 1590 aa38.19■■■■□ 3.7
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RECQL4-202ENST00000524998 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
RECQL4-202ENST00000524998 CUX2O14529 1486 aa37.83■■■■□ 3.65
RECQL4-202ENST00000524998 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.8■■■■□ 3.64
RECQL4-202ENST00000524998 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.75■■■■□ 3.63
RECQL4-202ENST00000524998 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.75■■■■□ 3.63
RECQL4-202ENST00000524998 NESP48681 1621 aa37.71■■■■□ 3.63
RECQL4-202ENST00000524998 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.48■■■■□ 3.59
RECQL4-202ENST00000524998 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.36■■■■□ 3.57
RECQL4-202ENST00000524998 WIZO95785 1651 aa37.29■■■■□ 3.56
RECQL4-202ENST00000524998 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
RECQL4-202ENST00000524998 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.24■■■■□ 3.55
RECQL4-202ENST00000524998 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.18■■■■□ 3.54
RECQL4-202ENST00000524998 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
RECQL4-202ENST00000524998 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.97■■■■□ 3.51
RECQL4-202ENST00000524998 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
RECQL4-202ENST00000524998 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.86■■■■□ 3.49
RECQL4-202ENST00000524998 WDR62O43379 1518 aa36.82■■■■□ 3.48
RECQL4-202ENST00000524998 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.82■■■■□ 3.48
RECQL4-202ENST00000524998 CFTRP13569 1480 aa36.79■■■■□ 3.48
RECQL4-202ENST00000524998 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.46■■■■□ 3.43
RECQL4-202ENST00000524998 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
RECQL4-202ENST00000524998 PRDM2Q13029 1718 aa36.34■■■■□ 3.41
RECQL4-202ENST00000524998 TRIM41Q8WV44 630 aa36.23■■■■□ 3.39
RECQL4-202ENST00000524998 OSCARQ8IYS5 282 aa36.22■■■■□ 3.39
RECQL4-202ENST00000524998 IFT140Q96RY7 1462 aa36.11■■■■□ 3.37
RECQL4-202ENST00000524998 TOPBP1Q92547 1522 aa36.09■■■■□ 3.37
RECQL4-202ENST00000524998 ABCC8Q09428 1581 aa36.09■■■■□ 3.37
RECQL4-202ENST00000524998 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
RECQL4-202ENST00000524998 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.96■■■■□ 3.35
RECQL4-202ENST00000524998 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
RECQL4-202ENST00000524998 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.73■■■■□ 3.312e-8■■■■■ 27.5
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RECQL4-202ENST00000524998 SOGA1O94964 1423 aa35.64■■■■□ 3.3
RECQL4-202ENST00000524998 FBLN2P98095 1184 aa35.62■■■■□ 3.29
RECQL4-202ENST00000524998 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
RECQL4-202ENST00000524998 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.6■■■■□ 3.29
RECQL4-202ENST00000524998 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.59■■■■□ 3.29
RECQL4-202ENST00000524998 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.59■■■■□ 3.29
RECQL4-202ENST00000524998 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.59■■■■□ 3.29
RECQL4-202ENST00000524998 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
RECQL4-202ENST00000524998 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.53■■■■□ 3.28
RECQL4-202ENST00000524998 ARHGEF11O15085 1522 aa35.52■■■■□ 3.28
RECQL4-202ENST00000524998 CHD1O14646 1710 aa35.49■■■■□ 3.27
RECQL4-202ENST00000524998 CUX1P39880 1505 aa35.47■■■■□ 3.27
RECQL4-202ENST00000524998 WDR97A6NE52 1622 aa35.39■■■■□ 3.26
RECQL4-202ENST00000524998 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.37■■■■□ 3.25
RECQL4-202ENST00000524998 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.35■■■■□ 3.25
RECQL4-202ENST00000524998 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
RECQL4-202ENST00000524998 GRIN2BQ13224 1484 aa35.3■■■■□ 3.24
RECQL4-202ENST00000524998 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
RECQL4-202ENST00000524998 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.18■■■■□ 3.22
RECQL4-202ENST00000524998 SYNJ1O43426 1573 aa35.16■■■■□ 3.22
RECQL4-202ENST00000524998 SYNJ2O15056 1496 aa35.16■■■■□ 3.22
RECQL4-202ENST00000524998 ARAP1Q96P48 1450 aa35.15■■■■□ 3.22
RECQL4-202ENST00000524998 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.11■■■■□ 3.21
RECQL4-202ENST00000524998 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.08■■■■□ 3.21
RECQL4-202ENST00000524998 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.08■■■■□ 3.21
RECQL4-202ENST00000524998 PBRM1Q86U86 1689 aa35.07■■■■□ 3.2
RECQL4-202ENST00000524998 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
RECQL4-202ENST00000524998 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35■■■■□ 3.19
RECQL4-202ENST00000524998 TOP2BQ02880 1626 aa34.93■■■■□ 3.18
RECQL4-202ENST00000524998 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.89■■■■□ 3.18
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RECQL4-202ENST00000524998 ADAMTS12P58397 1594 aa34.76■■■■□ 3.16
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RECQL4-202ENST00000524998 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.69■■■■□ 3.14
RECQL4-202ENST00000524998 NUP160Q12769 1436 aa34.67■■■■□ 3.14
RECQL4-202ENST00000524998 CEP170Q5SW79 1584 aa34.63■■■■□ 3.13
RECQL4-202ENST00000524998 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.53■■■■□ 3.12
RECQL4-202ENST00000524998 SHROOM2Q13796 1616 aa34.45■■■■□ 3.11
RECQL4-202ENST00000524998 JPH4Q96JJ6 628 aa34.41■■■■□ 3.1
RECQL4-202ENST00000524998 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
RECQL4-202ENST00000524998 KIF27Q86VH2 1401 aa34.36■■■■□ 3.09
RECQL4-202ENST00000524998 IGF1RP08069 1367 aa34.28■■■■□ 3.08
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