RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524778.1

USP33-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 33, humanhuman

TSL 5

Gene USP33, Length 389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33-212ENST00000524778 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.87■■■■■ 5.09
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USP33-212ENST00000524778 NACADO15069 1562 aa38.84■■■■□ 3.81
USP33-212ENST00000524778 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.82■■■■□ 3.8
USP33-212ENST00000524778 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.8■■■■□ 3.8
USP33-212ENST00000524778 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.73■■■■□ 3.79
USP33-212ENST00000524778 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.91■■■■□ 3.66
USP33-212ENST00000524778 SCRIBQ14160 1630 aa37.78■■■■□ 3.64
USP33-212ENST00000524778 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.57■■■■□ 3.6
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USP33-212ENST00000524778 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.27■■■■□ 3.56
USP33-212ENST00000524778 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
USP33-212ENST00000524778 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.45■■■■□ 3.43
USP33-212ENST00000524778 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.35■■■■□ 3.41
USP33-212ENST00000524778 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
USP33-212ENST00000524778 SMARCA4P51532 1647 aa36.23■■■■□ 3.39
USP33-212ENST00000524778 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.23■■■■□ 3.39
USP33-212ENST00000524778 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.12■■■■□ 3.37
USP33-212ENST00000524778 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.92■■■■□ 3.34
USP33-212ENST00000524778 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
USP33-212ENST00000524778 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.9■■■■□ 3.34
USP33-212ENST00000524778 SMARCA2P51531 1590 aa35.89■■■■□ 3.34
USP33-212ENST00000524778 NCAPD3P42695 1498 aa35.86■■■■□ 3.33
USP33-212ENST00000524778 WIZO95785 1651 aa35.76■■■■□ 3.32
USP33-212ENST00000524778 HMGXB3Q12766 1538 aa35.67■■■■□ 3.3
USP33-212ENST00000524778 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
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USP33-212ENST00000524778 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
USP33-212ENST00000524778 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.02■■■■□ 3.2
USP33-212ENST00000524778 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.83■■■■□ 3.17
USP33-212ENST00000524778 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.79■■■■□ 3.16
USP33-212ENST00000524778 NESP48681 1621 aa34.79■■■■□ 3.16
USP33-212ENST00000524778 CFTRP13569 1480 aa34.72■■■■□ 3.15
USP33-212ENST00000524778 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.55■■■■□ 3.12
USP33-212ENST00000524778 PRDM2Q13029 1718 aa34.5■■■■□ 3.11
USP33-212ENST00000524778 ERCC6Q03468 1493 aa34.41■■■■□ 3.1
USP33-212ENST00000524778 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.4■■■■□ 3.1
USP33-212ENST00000524778 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.39■■■■□ 3.1
USP33-212ENST00000524778 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.27■■■■□ 3.08
USP33-212ENST00000524778 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
USP33-212ENST00000524778 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.13■■■■□ 3.05
USP33-212ENST00000524778 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
USP33-212ENST00000524778 WDR62O43379 1518 aa34■■■■□ 3.03
USP33-212ENST00000524778 ABCC8Q09428 1581 aa33.98■■■■□ 3.03
USP33-212ENST00000524778 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.9■■■■□ 3.02
USP33-212ENST00000524778 TOPBP1Q92547 1522 aa33.9■■■■□ 3.02
USP33-212ENST00000524778 CUX2O14529 1486 aa33.9■■■■□ 3.02
USP33-212ENST00000524778 CUX1P39880 1505 aa33.84■■■■□ 3.01
USP33-212ENST00000524778 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.81■■■■□ 3
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USP33-212ENST00000524778 SYNJ1O43426 1573 aa33.69■■■□□ 2.98
USP33-212ENST00000524778 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.69■■■□□ 2.98
USP33-212ENST00000524778 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
USP33-212ENST00000524778 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.63■■■□□ 2.97
USP33-212ENST00000524778 IFT140Q96RY7 1462 aa33.56■■■□□ 2.96
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USP33-212ENST00000524778 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.39■■■□□ 2.94
USP33-212ENST00000524778 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.36■■■□□ 2.93
USP33-212ENST00000524778 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
USP33-212ENST00000524778 WDR97A6NE52 1622 aa33.33■■■□□ 2.93
USP33-212ENST00000524778 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
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USP33-212ENST00000524778 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.15■■■□□ 2.9
USP33-212ENST00000524778 KIF27Q86VH2 1401 aa33.08■■■□□ 2.89
USP33-212ENST00000524778 GRIN2BQ13224 1484 aa33.07■■■□□ 2.88
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USP33-212ENST00000524778 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.97■■■□□ 2.87
USP33-212ENST00000524778 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.97■■■□□ 2.87
USP33-212ENST00000524778 IGF1RP08069 1367 aa32.95■■■□□ 2.86
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USP33-212ENST00000524778 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.79■■■□□ 2.84
USP33-212ENST00000524778 EEA1Q15075 1411 aa32.79■■■□□ 2.84
USP33-212ENST00000524778 SYNJ2O15056 1496 aa32.79■■■□□ 2.84
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USP33-212ENST00000524778 CHD1O14646 1710 aa32.74■■■□□ 2.83
USP33-212ENST00000524778 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.73■■■□□ 2.83
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USP33-212ENST00000524778 OSCARQ8IYS5 282 aa32.67■■■□□ 2.82
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USP33-212ENST00000524778 NUP160Q12769 1436 aa32.49■■■□□ 2.79
USP33-212ENST00000524778 CEP170Q5SW79 1584 aa32.45■■■□□ 2.78
USP33-212ENST00000524778 KIF21BO75037 1637 aa32.4■■■□□ 2.78
USP33-212ENST00000524778 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.39■■■□□ 2.78
USP33-212ENST00000524778 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.34■■■□□ 2.77
USP33-212ENST00000524778 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.32■■■□□ 2.76
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