RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524770.5

GMDS-AS1-203, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 565 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.314e-11■■■■■ 41.7
GMDS-AS1-203ENST00000524770 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP19.69■□□□□ 0.744e-11■■■■■ 102.5
GMDS-AS1-203ENST00000524770 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP19.36■□□□□ 0.697e-10■□□□□ 10.5
GMDS-AS1-203ENST00000524770 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.911e-9■■□□□ 12.8
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.523e-9■■□□□ 13.3
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.24e-9■■□□□ 13.8
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.725e-9■■■■■ 39.6
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.918e-9■■□□□ 11.8
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.562e-8■■■■□ 20.4
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 44.5
GMDS-AS1-203ENST00000524770 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.983e-8■■■■■ 71.2
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.093e-8■■■■■ 27.2
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP19.04■□□□□ 0.647e-8■■■■□ 21.9
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.837e-8■■■□□ 17.4
GMDS-AS1-203ENST00000524770 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.457e-8■■■■■ 72.9
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.82■□□□□ 0.288e-8■■■■■ 41.9
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.98e-8■■■■■ 54
GMDS-AS1-203ENST00000524770 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 29.1
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 188.2
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 39.7
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.43e-7■■■■■ 31.3
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 31.4
GMDS-AS1-203ENST00000524770 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.717e-7■■■■□ 21.7
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.087e-7■■■■■ 29.3
GMDS-AS1-203ENST00000524770 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.028e-7■■■■■ 124.2
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 30
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.051e-6■■□□□ 12.3
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 34.3
GMDS-AS1-203ENST00000524770 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 31.2
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 35.7
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.711e-6■■■■□ 24.2
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP19.75■□□□□ 0.751e-6■■■□□ 18.6
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.36■■■□□ 2.451e-6■□□□□ 8.7
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.26■■■□□ 2.591e-6■■■■□ 20.7
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 62.9
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.12e-6■□□□□ 9.4
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP19.82■□□□□ 0.763e-6■■■■□ 19.3
GMDS-AS1-203ENST00000524770 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.013e-6■■■■□ 20.1
GMDS-AS1-203ENST00000524770 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.823e-6■□□□□ 10.7
GMDS-AS1-203ENST00000524770 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.193e-6■■□□□ 13
GMDS-AS1-203ENST00000524770 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.174e-6■■■■□ 22.1
GMDS-AS1-203ENST00000524770 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.215e-6■■■■□ 25
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.195e-6■■■□□ 15.1
GMDS-AS1-203ENST00000524770 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.176e-6■■■■■ 31.4
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.18e-6■■■■□ 20.3
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.019e-6■■■□□ 17.7
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.841e-5■■■■□ 24.6
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