RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522937.1

ADAMTS2-204, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS2, Length 455 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS2-204ENST00000522937 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.64■■■■■ 4.26
ADAMTS2-204ENST00000522937 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.1■■■■□ 3.53
ADAMTS2-204ENST00000522937 ABCC9O60706 1549 aa36.56■■■■□ 3.44
ADAMTS2-204ENST00000522937 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.06■■■■□ 3.2
ADAMTS2-204ENST00000522937 NACADO15069 1562 aa34.96■■■■□ 3.19
ADAMTS2-204ENST00000522937 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.92■■■■□ 3.18
ADAMTS2-204ENST00000522937 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.67■■■■□ 3.14
ADAMTS2-204ENST00000522937 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
ADAMTS2-204ENST00000522937 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.43■■■■□ 3.1
ADAMTS2-204ENST00000522937 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.23■■■■□ 3.07
ADAMTS2-204ENST00000522937 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.06
ADAMTS2-204ENST00000522937 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.99■■■■□ 3.03
ADAMTS2-204ENST00000522937 SCRIBQ14160 1630 aa33.85■■■■□ 3.01
ADAMTS2-204ENST00000522937 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.78■■■■□ 3
ADAMTS2-204ENST00000522937 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.63■■■□□ 2.97
ADAMTS2-204ENST00000522937 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
ADAMTS2-204ENST00000522937 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.05■■■□□ 2.88
ADAMTS2-204ENST00000522937 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.88■■■□□ 2.85
ADAMTS2-204ENST00000522937 SMARCA4P51532 1647 aa32.35■■■□□ 2.77
ADAMTS2-204ENST00000522937 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
ADAMTS2-204ENST00000522937 NCAPD3P42695 1498 aa32.27■■■□□ 2.76
ADAMTS2-204ENST00000522937 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.24■■■□□ 2.75
ADAMTS2-204ENST00000522937 SMARCA2P51531 1590 aa32.2■■■□□ 2.75
ADAMTS2-204ENST00000522937 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.08■■■□□ 2.73
ADAMTS2-204ENST00000522937 HMGXB3Q12766 1538 aa32.07■■■□□ 2.72
ADAMTS2-204ENST00000522937 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.03■■■□□ 2.72
ADAMTS2-204ENST00000522937 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
ADAMTS2-204ENST00000522937 WIZO95785 1651 aa31.71■■■□□ 2.67
ADAMTS2-204ENST00000522937 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
ADAMTS2-204ENST00000522937 NESP48681 1621 aa31.56■■■□□ 2.64
ADAMTS2-204ENST00000522937 ERCC6Q03468 1493 aa31.54■■■□□ 2.64
ADAMTS2-204ENST00000522937 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.44■■■□□ 2.62
ADAMTS2-204ENST00000522937 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
ADAMTS2-204ENST00000522937 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.32■■■□□ 2.6
ADAMTS2-204ENST00000522937 CUX2O14529 1486 aa31.28■■■□□ 2.6
ADAMTS2-204ENST00000522937 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.26■■■□□ 2.6
ADAMTS2-204ENST00000522937 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.16■■■□□ 2.58
ADAMTS2-204ENST00000522937 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
ADAMTS2-204ENST00000522937 CFTRP13569 1480 aa31.08■■■□□ 2.57
ADAMTS2-204ENST00000522937 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.01■■■□□ 2.56
ADAMTS2-204ENST00000522937 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.95■■■□□ 2.55
ADAMTS2-204ENST00000522937 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.95■■■□□ 2.54
ADAMTS2-204ENST00000522937 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.94■■■□□ 2.54
ADAMTS2-204ENST00000522937 WDR62O43379 1518 aa30.84■■■□□ 2.53
ADAMTS2-204ENST00000522937 PRDM2Q13029 1718 aa30.79■■■□□ 2.52
ADAMTS2-204ENST00000522937 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
ADAMTS2-204ENST00000522937 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
ADAMTS2-204ENST00000522937 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.63■■■□□ 2.49
ADAMTS2-204ENST00000522937 TOPBP1Q92547 1522 aa30.43■■■□□ 2.46
ADAMTS2-204ENST00000522937 ABCC8Q09428 1581 aa30.43■■■□□ 2.46
ADAMTS2-204ENST00000522937 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.37■■■□□ 2.45
ADAMTS2-204ENST00000522937 IFT140Q96RY7 1462 aa30.31■■■□□ 2.44
ADAMTS2-204ENST00000522937 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
ADAMTS2-204ENST00000522937 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
ADAMTS2-204ENST00000522937 CUX1P39880 1505 aa30.12■■■□□ 2.41
ADAMTS2-204ENST00000522937 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ADAMTS2-204ENST00000522937 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.05■■■□□ 2.4
ADAMTS2-204ENST00000522937 SOGA1O94964 1423 aa30.05■■■□□ 2.4
ADAMTS2-204ENST00000522937 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
ADAMTS2-204ENST00000522937 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.03■■■□□ 2.4
ADAMTS2-204ENST00000522937 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
ADAMTS2-204ENST00000522937 OSCARQ8IYS5 282 aa29.98■■■□□ 2.39
ADAMTS2-204ENST00000522937 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
ADAMTS2-204ENST00000522937 WDR97A6NE52 1622 aa29.85■■■□□ 2.37
ADAMTS2-204ENST00000522937 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.37
ADAMTS2-204ENST00000522937 TOP2BQ02880 1626 aa29.78■■■□□ 2.36
ADAMTS2-204ENST00000522937 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.78■■■□□ 2.36
ADAMTS2-204ENST00000522937 SYNJ1O43426 1573 aa29.76■■■□□ 2.35
ADAMTS2-204ENST00000522937 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.75■■■□□ 2.35
ADAMTS2-204ENST00000522937 GRIN2BQ13224 1484 aa29.72■■■□□ 2.35
ADAMTS2-204ENST00000522937 FBLN2P98095 1184 aa29.71■■■□□ 2.35
ADAMTS2-204ENST00000522937 CHD1O14646 1710 aa29.71■■■□□ 2.35
ADAMTS2-204ENST00000522937 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.7■■■□□ 2.35
ADAMTS2-204ENST00000522937 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.69■■■□□ 2.34
ADAMTS2-204ENST00000522937 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ADAMTS2-204ENST00000522937 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.63■■■□□ 2.33
ADAMTS2-204ENST00000522937 PBRM1Q86U86 1689 aa29.61■■■□□ 2.33
ADAMTS2-204ENST00000522937 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
ADAMTS2-204ENST00000522937 SYNJ2O15056 1496 aa29.55■■■□□ 2.32
ADAMTS2-204ENST00000522937 TRIM41Q8WV44 630 aa29.52■■■□□ 2.32
ADAMTS2-204ENST00000522937 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.49■■■□□ 2.31
ADAMTS2-204ENST00000522937 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.49■■■□□ 2.31
ADAMTS2-204ENST00000522937 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.49■■■□□ 2.31
ADAMTS2-204ENST00000522937 ARHGEF11O15085 1522 aa29.46■■■□□ 2.31
ADAMTS2-204ENST00000522937 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.39■■■□□ 2.3
ADAMTS2-204ENST00000522937 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.39■■■□□ 2.3
ADAMTS2-204ENST00000522937 ADAMTS12P58397 1594 aa29.38■■■□□ 2.29
ADAMTS2-204ENST00000522937 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.34■■■□□ 2.29
ADAMTS2-204ENST00000522937 GRIN2AQ12879 1464 aa29.32■■■□□ 2.28
ADAMTS2-204ENST00000522937 KIF27Q86VH2 1401 aa29.24■■■□□ 2.27
ADAMTS2-204ENST00000522937 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.23■■■□□ 2.27
ADAMTS2-204ENST00000522937 ARAP1Q96P48 1450 aa29.21■■■□□ 2.27
ADAMTS2-204ENST00000522937 NUP160Q12769 1436 aa29.2■■■□□ 2.27
ADAMTS2-204ENST00000522937 CEP170Q5SW79 1584 aa29.18■■■□□ 2.26
ADAMTS2-204ENST00000522937 IGF1RP08069 1367 aa29.15■■■□□ 2.26
ADAMTS2-204ENST00000522937 CUL7Q14999 1698 aa29.06■■■□□ 2.24
ADAMTS2-204ENST00000522937 SHROOM2Q13796 1616 aa29■■■□□ 2.23
ADAMTS2-204ENST00000522937 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.98■■■□□ 2.23
ADAMTS2-204ENST00000522937 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.96■■■□□ 2.23
ADAMTS2-204ENST00000522937 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms