RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521404.5

MEG3-217, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-217ENST00000521404 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.72■■■■□ 3.79
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MEG3-217ENST00000521404 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.75■■■□□ 2.83
MEG3-217ENST00000521404 NACADO15069 1562 aa32.64■■■□□ 2.82
MEG3-217ENST00000521404 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.45■■■□□ 2.79
MEG3-217ENST00000521404 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.39■■■□□ 2.78
MEG3-217ENST00000521404 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
MEG3-217ENST00000521404 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.08■■■□□ 2.73
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MEG3-217ENST00000521404 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.84■■■□□ 2.69
MEG3-217ENST00000521404 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.71■■■□□ 2.67
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MEG3-217ENST00000521404 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.49■■■□□ 2.63
MEG3-217ENST00000521404 SCRIBQ14160 1630 aa31.44■■■□□ 2.62
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MEG3-217ENST00000521404 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.88■■■□□ 2.53
MEG3-217ENST00000521404 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.77■■■□□ 2.52
MEG3-217ENST00000521404 NCAPD3P42695 1498 aa30.15■■■□□ 2.42
MEG3-217ENST00000521404 SMARCA4P51532 1647 aa30.09■■■□□ 2.41
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MEG3-217ENST00000521404 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
MEG3-217ENST00000521404 SMARCA2P51531 1590 aa30.03■■■□□ 2.4
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MEG3-217ENST00000521404 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.86■■■□□ 2.37
MEG3-217ENST00000521404 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
MEG3-217ENST00000521404 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.78■■■□□ 2.36
MEG3-217ENST00000521404 ERCC6Q03468 1493 aa29.5■■■□□ 2.31
MEG3-217ENST00000521404 NESP48681 1621 aa29.41■■■□□ 2.3
MEG3-217ENST00000521404 WIZO95785 1651 aa29.4■■■□□ 2.3
MEG3-217ENST00000521404 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.38■■■□□ 2.29
MEG3-217ENST00000521404 CUX2O14529 1486 aa29.37■■■□□ 2.29
MEG3-217ENST00000521404 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
MEG3-217ENST00000521404 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.23■■■□□ 2.27
MEG3-217ENST00000521404 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.23■■■□□ 2.27
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MEG3-217ENST00000521404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
MEG3-217ENST00000521404 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.03■■■□□ 2.24
MEG3-217ENST00000521404 CFTRP13569 1480 aa28.97■■■□□ 2.23
MEG3-217ENST00000521404 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.92■■■□□ 2.22
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MEG3-217ENST00000521404 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.86■■■□□ 2.21
MEG3-217ENST00000521404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.86■■■□□ 2.21
MEG3-217ENST00000521404 WDR62O43379 1518 aa28.82■■■□□ 2.2
MEG3-217ENST00000521404 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.79■■■□□ 2.2
MEG3-217ENST00000521404 PRDM2Q13029 1718 aa28.62■■■□□ 2.17
MEG3-217ENST00000521404 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
MEG3-217ENST00000521404 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
MEG3-217ENST00000521404 ABCC8Q09428 1581 aa28.41■■■□□ 2.14
MEG3-217ENST00000521404 TOPBP1Q92547 1522 aa28.34■■■□□ 2.13
MEG3-217ENST00000521404 IFT140Q96RY7 1462 aa28.3■■■□□ 2.12
MEG3-217ENST00000521404 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.28■■■□□ 2.12
MEG3-217ENST00000521404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
MEG3-217ENST00000521404 OSCARQ8IYS5 282 aa28.11■■■□□ 2.09
MEG3-217ENST00000521404 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.08
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MEG3-217ENST00000521404 SOGA1O94964 1423 aa27.98■■■□□ 2.07
MEG3-217ENST00000521404 CUX1P39880 1505 aa27.96■■■□□ 2.07
MEG3-217ENST00000521404 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
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MEG3-217ENST00000521404 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.92■■■□□ 2.06
MEG3-217ENST00000521404 WDR97A6NE52 1622 aa27.89■■■□□ 2.06
MEG3-217ENST00000521404 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
MEG3-217ENST00000521404 GRIN2BQ13224 1484 aa27.71■■■□□ 2.03
MEG3-217ENST00000521404 TRIM41Q8WV44 630 aa27.71■■■□□ 2.03
MEG3-217ENST00000521404 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.7■■■□□ 2.02
MEG3-217ENST00000521404 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
MEG3-217ENST00000521404 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
MEG3-217ENST00000521404 FBLN2P98095 1184 aa27.68■■■□□ 2.02
MEG3-217ENST00000521404 CHD1O14646 1710 aa27.68■■■□□ 2.02
MEG3-217ENST00000521404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.67■■■□□ 2.02
MEG3-217ENST00000521404 TOP2BQ02880 1626 aa27.65■■■□□ 2.02
MEG3-217ENST00000521404 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.65■■■□□ 2.02
MEG3-217ENST00000521404 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.63■■■□□ 2.01
MEG3-217ENST00000521404 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
MEG3-217ENST00000521404 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.58■■■□□ 2.01
MEG3-217ENST00000521404 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.58■■■□□ 2.01
MEG3-217ENST00000521404 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.58■■■□□ 2.01
MEG3-217ENST00000521404 ARHGEF11O15085 1522 aa27.58■■■□□ 2.01
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MEG3-217ENST00000521404 SYNJ2O15056 1496 aa27.57■■■□□ 2
MEG3-217ENST00000521404 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.57■■■□□ 2
MEG3-217ENST00000521404 PBRM1Q86U86 1689 aa27.53■■■□□ 2
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MEG3-217ENST00000521404 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.35■■□□□ 1.97
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MEG3-217ENST00000521404 IGF1RP08069 1367 aa27.1■■□□□ 1.93
MEG3-217ENST00000521404 SHROOM2Q13796 1616 aa27.05■■□□□ 1.92
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MEG3-217ENST00000521404 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.97■■□□□ 1.91
MEG3-217ENST00000521404 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.94■■□□□ 1.9
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