RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521321.5

ENTPD4-208, Transcript of ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4, human

TSL 4

Gene ENTPD4, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ENTPD4-208	ENST00000521321	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.81	■■■■□ 3.8
ENTPD4-208	ENST00000521321	ABCC9	O60706	1549 aa		35.41	■■■■□ 3.26
ENTPD4-208	ENST00000521321	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.97	■■■■□ 3.19
ENTPD4-208	ENST00000521321	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.63	■■■□□ 2.97
ENTPD4-208	ENST00000521321	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.51	■■■□□ 2.95
ENTPD4-208	ENST00000521321	NACAD	O15069	1562 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ENTPD4-208	ENST00000521321	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.9	■■■□□ 2.86
ENTPD4-208	ENST00000521321	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ENTPD4-208	ENST00000521321	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ENTPD4-208	ENST00000521321	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ENTPD4-208	ENST00000521321	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ENTPD4-208	ENST00000521321	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ENTPD4-208	ENST00000521321	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
ENTPD4-208	ENST00000521321	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ENTPD4-208	ENST00000521321	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.96	■■■□□ 2.71
ENTPD4-208	ENST00000521321	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.95	■■■□□ 2.7
ENTPD4-208	ENST00000521321	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.84	■■■□□ 2.69
ENTPD4-208	ENST00000521321	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
ENTPD4-208	ENST00000521321	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ENTPD4-208	ENST00000521321	CUX2	O14529	1486 aa		30.71	■■■□□ 2.51
ENTPD4-208	ENST00000521321	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.68	■■■□□ 2.5
ENTPD4-208	ENST00000521321	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.58	■■■□□ 2.49
ENTPD4-208	ENST00000521321	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.51	■■■□□ 2.48
ENTPD4-208	ENST00000521321	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.39	■■■□□ 2.46
ENTPD4-208	ENST00000521321	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.38	■■■□□ 2.45
ENTPD4-208	ENST00000521321	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.35	■■■□□ 2.45
ENTPD4-208	ENST00000521321	NES	P48681	1621 aa		30.31	■■■□□ 2.44
ENTPD4-208	ENST00000521321	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.17	■■■□□ 2.42
ENTPD4-208	ENST00000521321	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.14	■■■□□ 2.42
ENTPD4-208	ENST00000521321	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.09	■■■□□ 2.41
ENTPD4-208	ENST00000521321	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
ENTPD4-208	ENST00000521321	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.01	■■■□□ 2.39
ENTPD4-208	ENST00000521321	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ENTPD4-208	ENST00000521321	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.87	■■■□□ 2.37
ENTPD4-208	ENST00000521321	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.85	■■■□□ 2.37
ENTPD4-208	ENST00000521321	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.71	■■■□□ 2.35
ENTPD4-208	ENST00000521321	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.64	■■■□□ 2.34
ENTPD4-208	ENST00000521321	WDR62	O43379	1518 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ENTPD4-208	ENST00000521321	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ENTPD4-208	ENST00000521321	WIZ	O95785	1651 aa		29.48	■■■□□ 2.31
ENTPD4-208	ENST00000521321	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.42	■■■□□ 2.3
ENTPD4-208	ENST00000521321	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ENTPD4-208	ENST00000521321	CFTR	P13569	1480 aa		29.29	■■■□□ 2.28
ENTPD4-208	ENST00000521321	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.22	■■■□□ 2.27
ENTPD4-208	ENST00000521321	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
ENTPD4-208	ENST00000521321	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
ENTPD4-208	ENST00000521321	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
ENTPD4-208	ENST00000521321	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ENTPD4-208	ENST00000521321	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ENTPD4-208	ENST00000521321	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ENTPD4-208	ENST00000521321	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
ENTPD4-208	ENST00000521321	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ENTPD4-208	ENST00000521321	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ENTPD4-208	ENST00000521321	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.79	■■■□□ 2.2
ENTPD4-208	ENST00000521321	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ENTPD4-208	ENST00000521321	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.76	■■■□□ 2.19
ENTPD4-208	ENST00000521321	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
ENTPD4-208	ENST00000521321	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ENTPD4-208	ENST00000521321	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ENTPD4-208	ENST00000521321	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ENTPD4-208	ENST00000521321	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.54	■■■□□ 2.16	6e-8	■■■□□ 18.6
ENTPD4-208	ENST00000521321	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
ENTPD4-208	ENST00000521321	CHD1	O14646	1710 aa		28.49	■■■□□ 2.15
ENTPD4-208	ENST00000521321	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ENTPD4-208	ENST00000521321	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
ENTPD4-208	ENST00000521321	FBLN2	P98095	1184 aa		28.4	■■■□□ 2.14
ENTPD4-208	ENST00000521321	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ENTPD4-208	ENST00000521321	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
ENTPD4-208	ENST00000521321	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
ENTPD4-208	ENST00000521321	SOGA1	O94964	1423 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ENTPD4-208	ENST00000521321	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.24	■■■□□ 2.11
ENTPD4-208	ENST00000521321	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.23	■■■□□ 2.11
ENTPD4-208	ENST00000521321	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.21	■■■□□ 2.11
ENTPD4-208	ENST00000521321	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.2	■■■□□ 2.1
ENTPD4-208	ENST00000521321	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
ENTPD4-208	ENST00000521321	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
ENTPD4-208	ENST00000521321	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ENTPD4-208	ENST00000521321	CUX1	P39880	1505 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ENTPD4-208	ENST00000521321	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.1	■■■□□ 2.09
ENTPD4-208	ENST00000521321	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.08	■■■□□ 2.09
ENTPD4-208	ENST00000521321	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ENTPD4-208	ENST00000521321	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ENTPD4-208	ENST00000521321	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ENTPD4-208	ENST00000521321	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ENTPD4-208	ENST00000521321	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ENTPD4-208	ENST00000521321	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ENTPD4-208	ENST00000521321	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ENTPD4-208	ENST00000521321	NUP160	Q12769	1436 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ENTPD4-208	ENST00000521321	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ENTPD4-208	ENST00000521321	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ENTPD4-208	ENST00000521321	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.67	■■■□□ 2.02
ENTPD4-208	ENST00000521321	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ENTPD4-208	ENST00000521321	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ENTPD4-208	ENST00000521321	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.54	■■■□□ 2
ENTPD4-208	ENST00000521321	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.52	■■■□□ 2
ENTPD4-208	ENST00000521321	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ENTPD4-208	ENST00000521321	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
ENTPD4-208	ENST00000521321	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
ENTPD4-208	ENST00000521321	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.4	■■□□□ 1.98
ENTPD4-208	ENST00000521321	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.37	■■□□□ 1.97

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