RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519671.1

MTSS1-208, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

TSL 4

Gene MTSS1, Length 345 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-208ENST00000519671 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.01■■■□□ 2.07
MTSS1-208ENST00000519671 ABCC9O60706 1549 aa25.53■■□□□ 1.68
MTSS1-208ENST00000519671 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.15■■□□□ 1.62
MTSS1-208ENST00000519671 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.26■■□□□ 1.47
MTSS1-208ENST00000519671 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.11■■□□□ 1.45
MTSS1-208ENST00000519671 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.94■■□□□ 1.42
MTSS1-208ENST00000519671 NACADO15069 1562 aa23.87■■□□□ 1.41
MTSS1-208ENST00000519671 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.4
MTSS1-208ENST00000519671 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.62■■□□□ 1.37
MTSS1-208ENST00000519671 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.45■■□□□ 1.34
MTSS1-208ENST00000519671 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.41■■□□□ 1.34
MTSS1-208ENST00000519671 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
MTSS1-208ENST00000519671 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.04■■□□□ 1.28
MTSS1-208ENST00000519671 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.01■■□□□ 1.27
MTSS1-208ENST00000519671 SCRIBQ14160 1630 aa23■■□□□ 1.27
MTSS1-208ENST00000519671 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.99■■□□□ 1.27
MTSS1-208ENST00000519671 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.97■■□□□ 1.27
MTSS1-208ENST00000519671 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
MTSS1-208ENST00000519671 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.39■■□□□ 1.17
MTSS1-208ENST00000519671 NCAPD3P42695 1498 aa22.08■■□□□ 1.12
MTSS1-208ENST00000519671 ERCC6Q03468 1493 aa22.03■■□□□ 1.12
MTSS1-208ENST00000519671 CUX2O14529 1486 aa22.01■■□□□ 1.11
MTSS1-208ENST00000519671 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.99■■□□□ 1.11
MTSS1-208ENST00000519671 SMARCA4P51532 1647 aa21.88■■□□□ 1.09
MTSS1-208ENST00000519671 NESP48681 1621 aa21.88■■□□□ 1.09
MTSS1-208ENST00000519671 SMARCA2P51531 1590 aa21.87■■□□□ 1.09
MTSS1-208ENST00000519671 HMGXB3Q12766 1538 aa21.83■■□□□ 1.09
MTSS1-208ENST00000519671 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
MTSS1-208ENST00000519671 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
MTSS1-208ENST00000519671 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.62■■□□□ 1.05
MTSS1-208ENST00000519671 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.61■■□□□ 1.05
MTSS1-208ENST00000519671 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
MTSS1-208ENST00000519671 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.58■■□□□ 1.05
MTSS1-208ENST00000519671 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.54■■□□□ 1.04
MTSS1-208ENST00000519671 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.51■■□□□ 1.03
MTSS1-208ENST00000519671 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.42■■□□□ 1.02
MTSS1-208ENST00000519671 TRIM41Q8WV44 630 aa21.37■■□□□ 1.01
MTSS1-208ENST00000519671 WIZO95785 1651 aa21.35■■□□□ 1.01
MTSS1-208ENST00000519671 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.32■■□□□ 1
MTSS1-208ENST00000519671 WDR62O43379 1518 aa21.25■□□□□ 0.99
MTSS1-208ENST00000519671 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.19■□□□□ 0.98
MTSS1-208ENST00000519671 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.17■□□□□ 0.98
MTSS1-208ENST00000519671 CFTRP13569 1480 aa21.09■□□□□ 0.97
MTSS1-208ENST00000519671 OSCARQ8IYS5 282 aa21.08■□□□□ 0.97
MTSS1-208ENST00000519671 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
MTSS1-208ENST00000519671 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
MTSS1-208ENST00000519671 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
MTSS1-208ENST00000519671 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.83■□□□□ 0.93
MTSS1-208ENST00000519671 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
MTSS1-208ENST00000519671 PRDM2Q13029 1718 aa20.82■□□□□ 0.92
MTSS1-208ENST00000519671 IFT140Q96RY7 1462 aa20.78■□□□□ 0.92
MTSS1-208ENST00000519671 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.78■□□□□ 0.92
MTSS1-208ENST00000519671 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.78■□□□□ 0.92
MTSS1-208ENST00000519671 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.78■□□□□ 0.92
MTSS1-208ENST00000519671 TOPBP1Q92547 1522 aa20.73■□□□□ 0.91
MTSS1-208ENST00000519671 ARHGEF11O15085 1522 aa20.67■□□□□ 0.9
MTSS1-208ENST00000519671 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.65■□□□□ 0.9
MTSS1-208ENST00000519671 ABCC8Q09428 1581 aa20.64■□□□□ 0.9
MTSS1-208ENST00000519671 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
MTSS1-208ENST00000519671 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
MTSS1-208ENST00000519671 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.61■□□□□ 0.89
MTSS1-208ENST00000519671 FBLN2P98095 1184 aa20.6■□□□□ 0.89
MTSS1-208ENST00000519671 CHD1O14646 1710 aa20.56■□□□□ 0.88
MTSS1-208ENST00000519671 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
MTSS1-208ENST00000519671 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MTSS1-208ENST00000519671 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
MTSS1-208ENST00000519671 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.5■□□□□ 0.87
MTSS1-208ENST00000519671 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
MTSS1-208ENST00000519671 SOGA1O94964 1423 aa20.45■□□□□ 0.86
MTSS1-208ENST00000519671 ARAP1Q96P48 1450 aa20.45■□□□□ 0.86
MTSS1-208ENST00000519671 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
MTSS1-208ENST00000519671 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.36■□□□□ 0.85
MTSS1-208ENST00000519671 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.36■□□□□ 0.85
MTSS1-208ENST00000519671 CUX1P39880 1505 aa20.3■□□□□ 0.84
MTSS1-208ENST00000519671 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.27■□□□□ 0.84
MTSS1-208ENST00000519671 GRIN2BQ13224 1484 aa20.25■□□□□ 0.83
MTSS1-208ENST00000519671 SYNJ1O43426 1573 aa20.25■□□□□ 0.83
MTSS1-208ENST00000519671 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
MTSS1-208ENST00000519671 WDR97A6NE52 1622 aa20.24■□□□□ 0.83
MTSS1-208ENST00000519671 SYNJ2O15056 1496 aa20.21■□□□□ 0.83
MTSS1-208ENST00000519671 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.17■□□□□ 0.82
MTSS1-208ENST00000519671 PBRM1Q86U86 1689 aa20.15■□□□□ 0.82
MTSS1-208ENST00000519671 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
MTSS1-208ENST00000519671 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.08■□□□□ 0.81
MTSS1-208ENST00000519671 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
MTSS1-208ENST00000519671 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.05■□□□□ 0.8
MTSS1-208ENST00000519671 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.03■□□□□ 0.8
MTSS1-208ENST00000519671 GRIN2AQ12879 1464 aa19.99■□□□□ 0.79
MTSS1-208ENST00000519671 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
MTSS1-208ENST00000519671 CEP170Q5SW79 1584 aa19.94■□□□□ 0.78
MTSS1-208ENST00000519671 ADAMTS12P58397 1594 aa19.92■□□□□ 0.78
MTSS1-208ENST00000519671 NUP160Q12769 1436 aa19.92■□□□□ 0.78
MTSS1-208ENST00000519671 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.89■□□□□ 0.77
MTSS1-208ENST00000519671 TOP2BQ02880 1626 aa19.87■□□□□ 0.77
MTSS1-208ENST00000519671 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.87■□□□□ 0.77
MTSS1-208ENST00000519671 SHROOM2Q13796 1616 aa19.84■□□□□ 0.77
MTSS1-208ENST00000519671 JPH4Q96JJ6 628 aa19.82■□□□□ 0.76
MTSS1-208ENST00000519671 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
MTSS1-208ENST00000519671 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.81■□□□□ 0.76
MTSS1-208ENST00000519671 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms