RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519626.1

PDE7A-206, Transcript of phosphodiesterase 7A, humanhuman

TSL 4

Gene PDE7A, Length 522 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7A-206ENST00000519626 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.6■■■■■ 7.45
PDE7A-206ENST00000519626 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.54■■■■■ 6.32
PDE7A-206ENST00000519626 ABCC9O60706 1549 aa53.22■■■■■ 6.11
PDE7A-206ENST00000519626 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.62■■■■■ 5.85
PDE7A-206ENST00000519626 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.35■■■■■ 5.81
PDE7A-206ENST00000519626 NACADO15069 1562 aa51.29■■■■■ 5.8
PDE7A-206ENST00000519626 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.28■■■■■ 5.8
PDE7A-206ENST00000519626 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.03■■■■■ 5.76
PDE7A-206ENST00000519626 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.94■■■■■ 5.75
PDE7A-206ENST00000519626 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.96■■■■■ 5.59
PDE7A-206ENST00000519626 SCRIBQ14160 1630 aa49.87■■■■■ 5.57
PDE7A-206ENST00000519626 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.87■■■■■ 5.57
PDE7A-206ENST00000519626 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.63■■■■■ 5.54
PDE7A-206ENST00000519626 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.17■■■■■ 5.46
PDE7A-206ENST00000519626 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.57■■■■■ 5.37
PDE7A-206ENST00000519626 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
PDE7A-206ENST00000519626 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.08■■■■■ 5.29
PDE7A-206ENST00000519626 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.97■■■■■ 5.27
PDE7A-206ENST00000519626 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.73■■■■■ 5.23
PDE7A-206ENST00000519626 SMARCA4P51532 1647 aa47.7■■■■■ 5.23
PDE7A-206ENST00000519626 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.48■■■■■ 5.19
PDE7A-206ENST00000519626 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.41■■■■■ 5.18
PDE7A-206ENST00000519626 SMARCA2P51531 1590 aa47.37■■■■■ 5.17
PDE7A-206ENST00000519626 NCAPD3P42695 1498 aa47.34■■■■■ 5.17
PDE7A-206ENST00000519626 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.19■■■■■ 5.14
PDE7A-206ENST00000519626 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.09■■■■■ 5.13
PDE7A-206ENST00000519626 HMGXB3Q12766 1538 aa47.08■■■■■ 5.13
PDE7A-206ENST00000519626 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
PDE7A-206ENST00000519626 WIZO95785 1651 aa46.96■■■■■ 5.11
PDE7A-206ENST00000519626 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
PDE7A-206ENST00000519626 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5.01
PDE7A-206ENST00000519626 NESP48681 1621 aa46.1■■■■■ 4.97
PDE7A-206ENST00000519626 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.03■■■■■ 4.96
PDE7A-206ENST00000519626 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.01■■■■■ 4.96
PDE7A-206ENST00000519626 CCDC88BA6NC98 1476 aa46■■■■■ 4.95
PDE7A-206ENST00000519626 ERCC6Q03468 1493 aa45.89■■■■■ 4.94
PDE7A-206ENST00000519626 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.79■■■■■ 4.92
PDE7A-206ENST00000519626 CFTRP13569 1480 aa45.76■■■■■ 4.92
PDE7A-206ENST00000519626 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.48■■■■■ 4.87
PDE7A-206ENST00000519626 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.48■■■■■ 4.87
PDE7A-206ENST00000519626 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.39■■■■■ 4.86
PDE7A-206ENST00000519626 PRDM2Q13029 1718 aa45.3■■■■■ 4.84
PDE7A-206ENST00000519626 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.25■■■■■ 4.83
PDE7A-206ENST00000519626 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
PDE7A-206ENST00000519626 CUX2O14529 1486 aa45.21■■■■■ 4.83
PDE7A-206ENST00000519626 WDR62O43379 1518 aa45.02■■■■■ 4.8
PDE7A-206ENST00000519626 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
PDE7A-206ENST00000519626 ABCC8Q09428 1581 aa44.82■■■■■ 4.77
PDE7A-206ENST00000519626 TOPBP1Q92547 1522 aa44.76■■■■■ 4.76
PDE7A-206ENST00000519626 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.71■■■■■ 4.75
PDE7A-206ENST00000519626 CUX1P39880 1505 aa44.52■■■■■ 4.72
PDE7A-206ENST00000519626 IFT140Q96RY7 1462 aa44.43■■■■■ 4.7
PDE7A-206ENST00000519626 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.42■■■■■ 4.7
PDE7A-206ENST00000519626 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
PDE7A-206ENST00000519626 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.35■■■■■ 4.69
PDE7A-206ENST00000519626 SOGA1O94964 1423 aa44.32■■■■■ 4.68
PDE7A-206ENST00000519626 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.24■■■■■ 4.67
PDE7A-206ENST00000519626 SYNJ1O43426 1573 aa44.2■■■■■ 4.67
PDE7A-206ENST00000519626 TOP2BQ02880 1626 aa44.2■■■■■ 4.67
PDE7A-206ENST00000519626 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
PDE7A-206ENST00000519626 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
PDE7A-206ENST00000519626 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.16■■■■■ 4.66
PDE7A-206ENST00000519626 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
PDE7A-206ENST00000519626 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.02■■■■■ 4.64
PDE7A-206ENST00000519626 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
PDE7A-206ENST00000519626 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.92■■■■■ 4.62
PDE7A-206ENST00000519626 WDR97A6NE52 1622 aa43.85■■■■■ 4.61
PDE7A-206ENST00000519626 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.76■■■■■ 4.6
PDE7A-206ENST00000519626 TRIM41Q8WV44 630 aa43.73■■■■■ 4.59
PDE7A-206ENST00000519626 GRIN2BQ13224 1484 aa43.71■■■■■ 4.59
PDE7A-206ENST00000519626 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.65■■■■■ 4.58
PDE7A-206ENST00000519626 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.59■■■■■ 4.57
PDE7A-206ENST00000519626 FBLN2P98095 1184 aa43.58■■■■■ 4.57
PDE7A-206ENST00000519626 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.55■■■■■ 4.56
PDE7A-206ENST00000519626 OSCARQ8IYS5 282 aa43.54■■■■■ 4.56
PDE7A-206ENST00000519626 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
PDE7A-206ENST00000519626 PBRM1Q86U86 1689 aa43.53■■■■■ 4.56
PDE7A-206ENST00000519626 KIF27Q86VH2 1401 aa43.5■■■■■ 4.55
PDE7A-206ENST00000519626 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
PDE7A-206ENST00000519626 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.4■■■■■ 4.54
PDE7A-206ENST00000519626 SYNJ2O15056 1496 aa43.38■■■■■ 4.53
PDE7A-206ENST00000519626 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.34■■■■■ 4.53
PDE7A-206ENST00000519626 CHD1O14646 1710 aa43.32■■■■■ 4.53
PDE7A-206ENST00000519626 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.28■■■■■ 4.52
PDE7A-206ENST00000519626 IGF1RP08069 1367 aa43.28■■■■■ 4.52
PDE7A-206ENST00000519626 ADAMTS12P58397 1594 aa43.23■■■■■ 4.51
PDE7A-206ENST00000519626 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.14■■■■■ 4.5
PDE7A-206ENST00000519626 GRIN2AQ12879 1464 aa43.12■■■■■ 4.49
PDE7A-206ENST00000519626 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.05■■■■■ 4.48
PDE7A-206ENST00000519626 CUL7Q14999 1698 aa43.04■■■■■ 4.48
PDE7A-206ENST00000519626 NUP160Q12769 1436 aa42.89■■■■■ 4.46
PDE7A-206ENST00000519626 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.87■■■■■ 4.45
PDE7A-206ENST00000519626 EEA1Q15075 1411 aa42.86■■■■■ 4.45
PDE7A-206ENST00000519626 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.85■■■■■ 4.45
PDE7A-206ENST00000519626 CEP170Q5SW79 1584 aa42.84■■■■■ 4.45
PDE7A-206ENST00000519626 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
PDE7A-206ENST00000519626 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.79■■■■■ 4.44
PDE7A-206ENST00000519626 ARHGEF11O15085 1522 aa42.68■■■■■ 4.42
PDE7A-206ENST00000519626 PRXQ9BXM0 1461 aa42.67■■■■■ 4.42
PDE7A-206ENST00000519626 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.63■■■■■ 4.41
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