RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519404.5

CNOT8-210, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNOT8, Length 945 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-210ENST00000519404 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.32■■■■□ 3.72
CNOT8-210ENST00000519404 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.96■■■■□ 3.03
CNOT8-210ENST00000519404 ABCC9O60706 1549 aa32.87■■■□□ 2.85
CNOT8-210ENST00000519404 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
CNOT8-210ENST00000519404 NACADO15069 1562 aa31.9■■■□□ 2.7
CNOT8-210ENST00000519404 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.89■■■□□ 2.7
CNOT8-210ENST00000519404 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.83■■■□□ 2.69
CNOT8-210ENST00000519404 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.81■■■□□ 2.68
CNOT8-210ENST00000519404 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.77■■■□□ 2.68
CNOT8-210ENST00000519404 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.96■■■□□ 2.55
CNOT8-210ENST00000519404 SCRIBQ14160 1630 aa30.88■■■□□ 2.53
CNOT8-210ENST00000519404 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.81■■■□□ 2.52
CNOT8-210ENST00000519404 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.51
CNOT8-210ENST00000519404 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.69■■■□□ 2.5
CNOT8-210ENST00000519404 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CNOT8-210ENST00000519404 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.93■■■□□ 2.38
CNOT8-210ENST00000519404 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.77■■■□□ 2.36
CNOT8-210ENST00000519404 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.75■■■□□ 2.35
CNOT8-210ENST00000519404 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
CNOT8-210ENST00000519404 SMARCA4P51532 1647 aa29.64■■■□□ 2.34
CNOT8-210ENST00000519404 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.48■■■□□ 2.31
CNOT8-210ENST00000519404 NCAPD3P42695 1498 aa29.45■■■□□ 2.31
CNOT8-210ENST00000519404 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.45■■■□□ 2.31
CNOT8-210ENST00000519404 SMARCA2P51531 1590 aa29.44■■■□□ 2.3
CNOT8-210ENST00000519404 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.43■■■□□ 2.3
CNOT8-210ENST00000519404 HMGXB3Q12766 1538 aa29.3■■■□□ 2.28
CNOT8-210ENST00000519404 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CNOT8-210ENST00000519404 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CNOT8-210ENST00000519404 WIZO95785 1651 aa29.12■■■□□ 2.25
CNOT8-210ENST00000519404 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CNOT8-210ENST00000519404 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CNOT8-210ENST00000519404 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.58■■■□□ 2.17
CNOT8-210ENST00000519404 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.58■■■□□ 2.17
CNOT8-210ENST00000519404 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.57■■■□□ 2.16
CNOT8-210ENST00000519404 NESP48681 1621 aa28.51■■■□□ 2.15
CNOT8-210ENST00000519404 CFTRP13569 1480 aa28.46■■■□□ 2.15
CNOT8-210ENST00000519404 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.41■■■□□ 2.14
CNOT8-210ENST00000519404 ERCC6Q03468 1493 aa28.34■■■□□ 2.13
CNOT8-210ENST00000519404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.2■■■□□ 2.1
CNOT8-210ENST00000519404 PRDM2Q13029 1718 aa28.17■■■□□ 2.1
CNOT8-210ENST00000519404 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.16■■■□□ 2.1
CNOT8-210ENST00000519404 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.15■■■□□ 2.1
CNOT8-210ENST00000519404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CNOT8-210ENST00000519404 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.06■■■□□ 2.08
CNOT8-210ENST00000519404 CUX2O14529 1486 aa28.03■■■□□ 2.08
CNOT8-210ENST00000519404 WDR62O43379 1518 aa27.97■■■□□ 2.07
CNOT8-210ENST00000519404 ABCC8Q09428 1581 aa27.89■■■□□ 2.05
CNOT8-210ENST00000519404 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CNOT8-210ENST00000519404 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.78■■■□□ 2.04
CNOT8-210ENST00000519404 TOPBP1Q92547 1522 aa27.78■■■□□ 2.04
CNOT8-210ENST00000519404 CUX1P39880 1505 aa27.65■■■□□ 2.02
CNOT8-210ENST00000519404 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.61■■■□□ 2.01
CNOT8-210ENST00000519404 IFT140Q96RY7 1462 aa27.58■■■□□ 2.01
CNOT8-210ENST00000519404 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CNOT8-210ENST00000519404 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.52■■■□□ 2
CNOT8-210ENST00000519404 TOP2BQ02880 1626 aa27.51■■□□□ 1.99
CNOT8-210ENST00000519404 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.49■■□□□ 1.99
CNOT8-210ENST00000519404 SYNJ1O43426 1573 aa27.47■■□□□ 1.99
CNOT8-210ENST00000519404 SOGA1O94964 1423 aa27.46■■□□□ 1.99
CNOT8-210ENST00000519404 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
CNOT8-210ENST00000519404 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.38■■□□□ 1.97
CNOT8-210ENST00000519404 WDR97A6NE52 1622 aa27.35■■□□□ 1.97
CNOT8-210ENST00000519404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CNOT8-210ENST00000519404 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.32■■□□□ 1.96
CNOT8-210ENST00000519404 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CNOT8-210ENST00000519404 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.954e-10■■■■■ 49.3
CNOT8-210ENST00000519404 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CNOT8-210ENST00000519404 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.15■■□□□ 1.94
CNOT8-210ENST00000519404 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.14■■□□□ 1.94
CNOT8-210ENST00000519404 GRIN2BQ13224 1484 aa27.13■■□□□ 1.93
CNOT8-210ENST00000519404 TRIM41Q8WV44 630 aa27.11■■□□□ 1.93
CNOT8-210ENST00000519404 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CNOT8-210ENST00000519404 KIF27Q86VH2 1401 aa27.03■■□□□ 1.92
CNOT8-210ENST00000519404 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.01■■□□□ 1.91
CNOT8-210ENST00000519404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27■■□□□ 1.91
CNOT8-210ENST00000519404 PBRM1Q86U86 1689 aa26.99■■□□□ 1.91
CNOT8-210ENST00000519404 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.95■■□□□ 1.9
CNOT8-210ENST00000519404 SYNJ2O15056 1496 aa26.93■■□□□ 1.9
CNOT8-210ENST00000519404 OSCARQ8IYS5 282 aa26.9■■□□□ 1.9
CNOT8-210ENST00000519404 IGF1RP08069 1367 aa26.88■■□□□ 1.89
CNOT8-210ENST00000519404 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.88■■□□□ 1.89
CNOT8-210ENST00000519404 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CNOT8-210ENST00000519404 ADAMTS12P58397 1594 aa26.85■■□□□ 1.89
CNOT8-210ENST00000519404 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.83■■□□□ 1.89
CNOT8-210ENST00000519404 FBLN2P98095 1184 aa26.81■■□□□ 1.88
CNOT8-210ENST00000519404 CHD1O14646 1710 aa26.8■■□□□ 1.88
CNOT8-210ENST00000519404 CUL7Q14999 1698 aa26.78■■□□□ 1.88
CNOT8-210ENST00000519404 GRIN2AQ12879 1464 aa26.76■■□□□ 1.87
CNOT8-210ENST00000519404 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.75■■□□□ 1.87
CNOT8-210ENST00000519404 EEA1Q15075 1411 aa26.75■■□□□ 1.87
CNOT8-210ENST00000519404 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.71■■□□□ 1.87
CNOT8-210ENST00000519404 NUP160Q12769 1436 aa26.67■■□□□ 1.86
CNOT8-210ENST00000519404 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.63■■□□□ 1.85
CNOT8-210ENST00000519404 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.61■■□□□ 1.85
CNOT8-210ENST00000519404 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.6■■□□□ 1.85
CNOT8-210ENST00000519404 PRXQ9BXM0 1461 aa26.59■■□□□ 1.85
CNOT8-210ENST00000519404 CEP170Q5SW79 1584 aa26.57■■□□□ 1.84
CNOT8-210ENST00000519404 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.49■■□□□ 1.83
CNOT8-210ENST00000519404 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CNOT8-210ENST00000519404 ARHGEF11O15085 1522 aa26.41■■□□□ 1.82
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